74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3167 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3167  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  155  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.696218 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5562  transposase IS3/IS911 family protein  65.22 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456649 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0021  IS66 family orf1  47.92 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0116  IS66 family element, orf1  47.92 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837926  normal  0.82716 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0019  hypothetical protein  47.92 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4862  IS66 family orf1  47.92 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3386  IS66 family orf1  47.92 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3345  IS66 family orf1  47.92 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2931  IS66 family orf1  47.92 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1762  IS66 family orf1  47.92 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1405  IS66 family orf1  47.92 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0817  IS66 family orf1  47.92 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.442103  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0070  IS66 family element  47.92 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0040  IS66 family orf1  47.92 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0072  IS66 family element, orf1  47.92 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202563  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0226  IS66 family element, orf1  47.92 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0144  IS66 family element, orf1  47.92 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.642742  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0195  IS66 family element, orf1  47.92 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5984  transposase IS3/IS911 family protein  39.34 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2255  transposase IS3/IS911 family protein  38.67 
 
 		 113 aa  47  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4652  transposase IS3/IS911 family protein  38.89 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.110926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59560  putative transposase  48.65 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000451913  hitchhiker  4.3260500000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5175  transposase IS3/IS911 family protein  56.76 
 
 		 110 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4875  transposase IS3/IS911 family protein  38.89 
 
 		 128 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.64301  normal  0.539748 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4441  ISPpu14, transposase Orf1  48.65 
 
 		 106 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000439178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5398  ISPpu14, transposase Orf1  48.65 
 
 		 106 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180898  hitchhiker  0.00224199 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0257  putative transposase  37.74 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0626977 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4330  hypothetical protein  45.1 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1057  transposase IS3/IS911 family protein  47.37 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.905137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1090  transposase IS3/IS911 family protein  47.37 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1480  transposase IS3/IS911 family protein  47.37 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10456 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2724  transposase IS3/IS911 family protein  35.42 
 
 		 129 aa  42.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.8231  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4707  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.15139  normal  0.0855064 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5581  hypothetical protein  60.61 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2521  transposase IS3/IS911 family protein  43.4 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1403  transposase IS3/IS911 family protein  43.4 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1192  transposase IS3/IS911 family protein  43.4 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1020  transposase IS3/IS911 family protein  43.4 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3966  ISPpu14, transposase Orf1  45.95 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0039  transposase IS3/IS911 family protein  45.95 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.251766 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1364  transposase IS3/IS911 family protein  47.37 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.059427 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3499  ISPpu14, transposase Orf1  45.95 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6859  transposase IS3/IS911 family protein  43.14 
 
 		 131 aa  42  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.643706  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4437  ISPpu14, transposase Orf1  45.95 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3979  ISPpu14, transposase Orf1  45.95 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.061856 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0712  transposase IS3/IS911 family protein  48.57 
 
 		 114 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2589  putative IS3 transposase, TnpA  42.86 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.789608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4447  transposase IS3/IS911 family protein  48.72 
 
 		 130 aa  41.2  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.151096  normal  0.0837239 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0590  transposase IS3/IS911  36.59 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.139932  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4974  transposase IS3/IS911  41.3 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000160707  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0570  transposase IS3/IS911 family protein  41.18 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0784738 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2457  transposase IS3/IS911 family protein  41.18 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.528659  normal  0.919358 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2918  transposase IS3/IS911 family protein  41.18 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.384593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2417a  hypothetical protein  45.1 
 
 		 128 aa  40.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.2099  normal  0.256118 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1867  hypothetical protein  45.1 
 
 		 128 aa  40.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.859913  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1657  transposase IS3/IS911  36.59 
 
 		 97 aa  40  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.803884  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0586  transposase IS3/IS911  36.59 
 
 		 97 aa  40  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0920  transposase IS3/IS911  36.59 
 
 		 97 aa  40  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3504  hypothetical protein  42.86 
 
 		 149 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138745  normal  0.543824 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1662  transposase IS3/IS911  36.59 
 
 		 97 aa  40  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1673  transposase IS3/IS911  36.59 
 
 		 97 aa  40  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1675  transposase IS3/IS911  36.59 
 
 		 97 aa  40  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1682  transposase IS3/IS911  36.59 
 
 		 97 aa  40  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1686  transposase IS3/IS911  36.59 
 
 		 97 aa  40  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1692  transposase IS3/IS911  36.59 
 
 		 97 aa  40  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.325728  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1880  transposase IS3/IS911  36.59 
 
 		 97 aa  40  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1887  transposase IS3/IS911  36.59 
 
 		 97 aa  40  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1975  transposase IS3/IS911  36.59 
 
 		 97 aa  40  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1992  transposase IS3/IS911  36.59 
 
 		 97 aa  40  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2001  transposase IS3/IS911  36.59 
 
 		 97 aa  40  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2013  transposase IS3/IS911  36.59 
 
 		 97 aa  40  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00189647  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2136  transposase IS3/IS911  36.59 
 
 		 97 aa  40  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2772  transposase IS3/IS911  36.59 
 
 		 97 aa  40  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.120538  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0935  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 		 149 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.089943  normal  0.624774 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>