76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6377 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6377  helix-turn-helix, Fis-type  100 
 
 		 146 aa  294  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6181  hypothetical protein  59.21 
 
 		 152 aa  156  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6339  transposase IS3/IS911  51.28 
 
 		 167 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0080  putative ISPpu14, transposase Orf1  50.97 
 
 		 174 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.195214 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0063  putative transposase  50.97 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2548  putative transposase, ISPpu14 Orf1 like  50.97 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3738  putative transposase  50.97 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7466  transposase IS3/IS911 family protein  48.34 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1729  transposase  46.95 
 
 		 164 aa  111  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7615  transposase IS3/IS911 family protein  45.68 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.557321  normal  0.767348 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6579  transposase IS3/IS911 family protein  40.4 
 
 		 159 aa  99  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal  0.0213341 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6838  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 		 159 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3806  transposase IS3/IS911  41.45 
 
 		 170 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179711  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6338  transposase IS3/IS911 family protein  41.73 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.202859 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2291  transposase IS3/IS911 family protein  35.76 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112265  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0340  transposase IS3/IS911  50 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394046  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4447  transposase IS3/IS911 family protein  36.46 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.151096  normal  0.0837239 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0039  transposase IS3/IS911 family protein  46.67 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.251766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4437  ISPpu14, transposase Orf1  46.67 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3979  ISPpu14, transposase Orf1  46.67 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.061856 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59560  putative transposase  41.67 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000451913  hitchhiker  4.3260500000000003e-19 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3499  ISPpu14, transposase Orf1  46.67 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2255  transposase IS3/IS911 family protein  43.24 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5398  ISPpu14, transposase Orf1  40.85 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180898  hitchhiker  0.00224199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4441  ISPpu14, transposase Orf1  40.85 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000439178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3966  ISPpu14, transposase Orf1  46.67 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3090  transposase IS3/IS911 family protein  31.53 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.234179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1410  transposase IS3/IS911 family protein  31.53 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4917  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4023  transposase IS3/IS911 family protein  41.67 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4532  transposase IS3/IS911 family protein  40.98 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2523  transposase IS3/IS911 family protein  40.98 
 
 		 145 aa  50.4  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0570  transposase IS3/IS911 family protein  48.84 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0784738 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2457  transposase IS3/IS911 family protein  48.84 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.528659  normal  0.919358 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2918  transposase IS3/IS911 family protein  48.84 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.384593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5175  transposase IS3/IS911 family protein  38.33 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5581  hypothetical protein  40.98 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5537  transposase IS3/IS911  50 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1403  transposase IS3/IS911 family protein  35.38 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1192  transposase IS3/IS911 family protein  35.38 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1020  transposase IS3/IS911 family protein  35.38 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2521  transposase IS3/IS911 family protein  35.38 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4842  transposase IS3/IS911 family protein  33.02 
 
 		 131 aa  45.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.926413  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1173  transposase IS3/IS911  34.25 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3061  transposase IS3/IS911  34.25 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5013  transposase IS3/IS911 family protein  31.19 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2252  transposase IS3/IS911 family protein  31.19 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367013  normal  0.015617 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0524  hypothetical protein  47.5 
 
 		 331 aa  43.9  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.104385  hitchhiker  0.00639859 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2709  transposase IS3/IS911  40.91 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1405  IS66 family orf1  40 
 
 		 129 aa  42.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6372  transposase ISRme19  30.71 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092485 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0116  IS66 family element, orf1  40 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837926  normal  0.82716 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0021  IS66 family orf1  40 
 
 		 129 aa  42.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0040  IS66 family orf1  40 
 
 		 129 aa  42.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0070  IS66 family element  40 
 
 		 129 aa  42.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4862  IS66 family orf1  40 
 
 		 129 aa  42.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0817  IS66 family orf1  40 
 
 		 129 aa  42.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.442103  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1762  IS66 family orf1  40 
 
 		 129 aa  42.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2931  IS66 family orf1  40 
 
 		 129 aa  42.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4596  transposase IS3/IS911 family protein  34.43 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.699862 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3345  IS66 family orf1  40 
 
 		 129 aa  42.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3386  IS66 family orf1  40 
 
 		 129 aa  42.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0195  IS66 family element, orf1  40 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0226  IS66 family element, orf1  40 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0144  IS66 family element, orf1  40 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.642742  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0072  IS66 family element, orf1  40 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202563  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0019  hypothetical protein  40 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2471  transposase IS3/IS911 family protein  32.47 
 
 		 130 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4330  hypothetical protein  34.38 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5995  hypothetical protein  35.21 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2162  transposase IS3/IS911 family protein  35.21 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.102712  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0276  transposase IS3/IS911 family protein  36.67 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4274  ISSfl4 ORF1  32.1 
 
 		 224 aa  40.8  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1374  transposase IS3/IS911 family protein  35.14 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2691  protein of unknown function DUF1528  37.5 
 
 		 282 aa  40.4  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698088  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3137  IS66 family transposase orfA  30.51 
 
 		 141 aa  40  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>