78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7466 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010627  Bphy_7466  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
154 aa  309  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0080  putative ISPpu14, transposase Orf1  68.39 
 
 
174 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.195214 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3738  putative transposase  68.39 
 
 
160 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2548  putative transposase, ISPpu14 Orf1 like  68.39 
 
 
160 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598372  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0063  putative transposase  68.39 
 
 
155 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1729  transposase  62.11 
 
 
164 aa  165  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7615  transposase IS3/IS911 family protein  55.97 
 
 
159 aa  152  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.557321  normal  0.767348 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6181  hypothetical protein  48.75 
 
 
152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6339  transposase IS3/IS911  43.75 
 
 
167 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6377  helix-turn-helix, Fis-type  48.34 
 
 
146 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6579  transposase IS3/IS911 family protein  43.42 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal  0.0213341 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6838  transposase IS3/IS911 family protein  42.11 
 
 
159 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3806  transposase IS3/IS911  42.86 
 
 
170 aa  96.7  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179711  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6338  transposase IS3/IS911 family protein  43.62 
 
 
155 aa  90.5  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.202859 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1410  transposase IS3/IS911 family protein  35.25 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3090  transposase IS3/IS911 family protein  35.25 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.234179  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4447  transposase IS3/IS911 family protein  37.08 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.151096  normal  0.0837239 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4917  transposase IS3/IS911 family protein  45.9 
 
 
172 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999875  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0340  transposase IS3/IS911  51.06 
 
 
167 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394046  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2291  transposase IS3/IS911 family protein  37.41 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112265  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2523  transposase IS3/IS911 family protein  41.25 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4532  transposase IS3/IS911 family protein  42.62 
 
 
148 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0663  transposase IS3/IS911 family protein  42.11 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2977  transposase IS3/IS911 family protein  38.96 
 
 
123 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1168  transposase IS3/IS911 family protein  38.96 
 
 
123 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.375824  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0835  transposase IS3/IS911 family protein  38.96 
 
 
123 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.333335 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2667  transposase IS3/IS911 family protein  38.96 
 
 
123 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4907  transposase IS3/IS911 family protein  36.59 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2709  transposase IS3/IS911  38.89 
 
 
134 aa  48.9  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4023  transposase IS3/IS911 family protein  39.39 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5013  transposase IS3/IS911 family protein  34.06 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4441  ISPpu14, transposase Orf1  37.31 
 
 
106 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000439178 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1173  transposase IS3/IS911  36.99 
 
 
134 aa  47.4  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5398  ISPpu14, transposase Orf1  37.31 
 
 
106 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180898  hitchhiker  0.00224199 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3061  transposase IS3/IS911  36.99 
 
 
134 aa  47.4  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59560  putative transposase  45.24 
 
 
88 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000451913  hitchhiker  4.3260500000000003e-19 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3979  ISPpu14, transposase Orf1  36.92 
 
 
106 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.061856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4437  ISPpu14, transposase Orf1  36.92 
 
 
106 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0039  transposase IS3/IS911 family protein  36.92 
 
 
106 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.251766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3499  ISPpu14, transposase Orf1  36.92 
 
 
106 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2255  transposase IS3/IS911 family protein  47.92 
 
 
113 aa  47  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5175  transposase IS3/IS911 family protein  36.92 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1192  transposase IS3/IS911 family protein  40.51 
 
 
112 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1020  transposase IS3/IS911 family protein  40.51 
 
 
112 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1403  transposase IS3/IS911 family protein  40.51 
 
 
112 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2521  transposase IS3/IS911 family protein  40.51 
 
 
112 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6372  transposase ISRme19  35 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092485 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3966  ISPpu14, transposase Orf1  44.19 
 
 
106 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5581  hypothetical protein  39.13 
 
 
110 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0570  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 
150 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0784738 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2457  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 
150 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.528659  normal  0.919358 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2918  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 
150 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.384593  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4842  transposase IS3/IS911 family protein  34.29 
 
 
131 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.926413  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3386  IS66 family orf1  52.5 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0021  IS66 family orf1  52.5 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0116  IS66 family element, orf1  52.5 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837926  normal  0.82716 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0040  IS66 family orf1  52.5 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0070  IS66 family element  52.5 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0226  IS66 family element, orf1  52.5 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0144  IS66 family element, orf1  52.5 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.642742  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4862  IS66 family orf1  52.5 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3345  IS66 family orf1  52.5 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2931  IS66 family orf1  52.5 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1762  IS66 family orf1  52.5 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1405  IS66 family orf1  52.5 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0817  IS66 family orf1  52.5 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.442103  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0019  hypothetical protein  52.5 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0072  IS66 family element, orf1  52.5 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202563  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0195  IS66 family element, orf1  52.5 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0276  transposase IS3/IS911 family protein  37.33 
 
 
126 aa  43.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2252  transposase IS3/IS911 family protein  32.77 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367013  normal  0.015617 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3324  hypothetical protein  42.62 
 
 
95 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1487  hypothetical protein  42.62 
 
 
95 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000221833 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0524  hypothetical protein  40 
 
 
331 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.104385  hitchhiker  0.00639859 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2471  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 
130 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1867  hypothetical protein  37.33 
 
 
128 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.859913  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2417a  hypothetical protein  37.33 
 
 
128 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.2099  normal  0.256118 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4274  ISSfl4 ORF1  32.17 
 
 
224 aa  40.4  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>