56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0524 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0524  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  657    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.104385  hitchhiker  0.00639859 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2977  transposase IS3/IS911 family protein  43.86 
 
 
123 aa  92.8  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2667  transposase IS3/IS911 family protein  43.86 
 
 
123 aa  92.8  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0835  transposase IS3/IS911 family protein  43.86 
 
 
123 aa  92.8  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.333335 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1168  transposase IS3/IS911 family protein  43.86 
 
 
123 aa  92.8  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.375824  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6372  transposase ISRme19  39.66 
 
 
125 aa  81.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092485 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6937  transposase IS3/IS911 family protein  41.03 
 
 
127 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5984  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 
115 aa  77  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1867  hypothetical protein  43.59 
 
 
128 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.859913  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2417a  hypothetical protein  43.59 
 
 
128 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.2099  normal  0.256118 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4447  transposase IS3/IS911 family protein  35.71 
 
 
130 aa  73.6  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.151096  normal  0.0837239 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1020  transposase IS3/IS911 family protein  36.21 
 
 
112 aa  73.6  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1192  transposase IS3/IS911 family protein  36.21 
 
 
112 aa  73.6  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1403  transposase IS3/IS911 family protein  36.21 
 
 
112 aa  73.6  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2521  transposase IS3/IS911 family protein  36.21 
 
 
112 aa  73.6  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3324  hypothetical protein  40.62 
 
 
95 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1487  hypothetical protein  40.62 
 
 
95 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000221833 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4023  transposase IS3/IS911 family protein  37.17 
 
 
125 aa  67  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3061  transposase IS3/IS911  33.88 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2709  transposase IS3/IS911  34.19 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1173  transposase IS3/IS911  33.88 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5581  hypothetical protein  37.14 
 
 
110 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0424  transposase IS3/IS911 family protein  32.5 
 
 
136 aa  60.8  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4707  transposase IS3/IS911 family protein  35.59 
 
 
130 aa  60.1  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.15139  normal  0.0855064 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0039  transposase IS3/IS911 family protein  35.24 
 
 
106 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.251766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3966  ISPpu14, transposase Orf1  35.24 
 
 
106 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3499  ISPpu14, transposase Orf1  35.24 
 
 
106 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3979  ISPpu14, transposase Orf1  35.24 
 
 
106 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.061856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4437  ISPpu14, transposase Orf1  35.24 
 
 
106 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0712  transposase IS3/IS911 family protein  32.69 
 
 
114 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4441  ISPpu14, transposase Orf1  32.69 
 
 
106 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000439178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5398  ISPpu14, transposase Orf1  32.69 
 
 
106 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180898  hitchhiker  0.00224199 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59560  putative transposase  41.51 
 
 
88 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000451913  hitchhiker  4.3260500000000003e-19 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2255  transposase IS3/IS911 family protein  33.02 
 
 
113 aa  55.1  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5175  transposase IS3/IS911 family protein  33.96 
 
 
110 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2471  transposase IS3/IS911 family protein  35.71 
 
 
130 aa  55.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6579  transposase IS3/IS911 family protein  46.67 
 
 
159 aa  52.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal  0.0213341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2918  transposase IS3/IS911 family protein  45.83 
 
 
150 aa  50.8  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.384593  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3806  transposase IS3/IS911  48.89 
 
 
170 aa  51.2  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179711  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6338  transposase IS3/IS911 family protein  34.74 
 
 
155 aa  51.2  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.202859 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0570  transposase IS3/IS911 family protein  45.83 
 
 
150 aa  50.8  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0784738 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2457  transposase IS3/IS911 family protein  45.83 
 
 
150 aa  50.8  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.528659  normal  0.919358 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0663  transposase IS3/IS911 family protein  47.73 
 
 
128 aa  50.1  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6838  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
159 aa  49.3  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1410  transposase IS3/IS911 family protein  36.05 
 
 
147 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3090  transposase IS3/IS911 family protein  36.05 
 
 
147 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.234179  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4917  transposase IS3/IS911 family protein  52.5 
 
 
172 aa  47  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999875  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2523  transposase IS3/IS911 family protein  44.68 
 
 
145 aa  47.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6377  helix-turn-helix, Fis-type  32.17 
 
 
146 aa  47.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4532  transposase IS3/IS911 family protein  37.31 
 
 
148 aa  46.6  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5537  transposase IS3/IS911  50 
 
 
131 aa  46.6  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1729  transposase  37.84 
 
 
164 aa  46.2  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0340  transposase IS3/IS911  47.5 
 
 
167 aa  45.8  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394046  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3182  transposase IS3/IS911 family protein  43.18 
 
 
125 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6339  transposase IS3/IS911  47.5 
 
 
167 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5541  hypothetical protein  45 
 
 
75 aa  42.4  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.60846 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>