106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4707 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008760  Pnap_4707  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 130 aa  262  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.15139  normal  0.0855064 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5984  transposase IS3/IS911 family protein  51.67 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1020  transposase IS3/IS911 family protein  49.58 
 
 		 112 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1192  transposase IS3/IS911 family protein  49.58 
 
 		 112 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1403  transposase IS3/IS911 family protein  49.58 
 
 		 112 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2521  transposase IS3/IS911 family protein  49.58 
 
 		 112 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4447  transposase IS3/IS911 family protein  47.01 
 
 		 130 aa  100  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.151096  normal  0.0837239 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1168  transposase IS3/IS911 family protein  45.61 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.375824  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2977  transposase IS3/IS911 family protein  45.61 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2667  transposase IS3/IS911 family protein  45.61 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0835  transposase IS3/IS911 family protein  45.61 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.333335 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5581  hypothetical protein  45.13 
 
 		 110 aa  93.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0712  transposase IS3/IS911 family protein  45.71 
 
 		 114 aa  86.7  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6937  transposase IS3/IS911 family protein  41.67 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6372  transposase ISRme19  41.74 
 
 		 125 aa  85.1  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092485 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1487  hypothetical protein  46.39 
 
 		 95 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221833 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3324  hypothetical protein  46.39 
 
 		 95 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2417a  hypothetical protein  42.34 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.2099  normal  0.256118 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1867  hypothetical protein  42.34 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.859913  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2709  transposase IS3/IS911  36.84 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5175  transposase IS3/IS911 family protein  38.94 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1173  transposase IS3/IS911  35.34 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3061  transposase IS3/IS911  35.34 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4023  transposase IS3/IS911 family protein  37.61 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0570  transposase IS3/IS911 family protein  33.08 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0784738 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2457  transposase IS3/IS911 family protein  33.08 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.528659  normal  0.919358 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2918  transposase IS3/IS911 family protein  33.08 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.384593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0424  transposase IS3/IS911 family protein  36.22 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4441  ISPpu14, transposase Orf1  33.64 
 
 		 106 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000439178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5398  ISPpu14, transposase Orf1  33.64 
 
 		 106 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180898  hitchhiker  0.00224199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3499  ISPpu14, transposase Orf1  33.93 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3966  ISPpu14, transposase Orf1  33.93 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3979  ISPpu14, transposase Orf1  33.93 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.061856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4437  ISPpu14, transposase Orf1  33.93 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0039  transposase IS3/IS911 family protein  33.93 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.251766 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2471  transposase IS3/IS911 family protein  32.5 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0524  hypothetical protein  37.07 
 
 		 331 aa  64.7  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.104385  hitchhiker  0.00639859 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2255  transposase IS3/IS911 family protein  35.14 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5537  transposase IS3/IS911  64.29 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59560  putative transposase  33.33 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000451913  hitchhiker  4.3260500000000003e-19 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4330  hypothetical protein  42.86 
 
 		 79 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5080  transposase IS3/IS911 family protein  34.95 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0663  transposase IS3/IS911 family protein  43.42 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5541  hypothetical protein  54.76 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.60846 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6338  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.202859 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0472  putative transposase IS3/IS911  44.68 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6859  transposase IS3/IS911 family protein  46.81 
 
 		 131 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.643706  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3137  IS66 family transposase orfA  45.24 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5562  transposase IS3/IS911 family protein  41.67 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456649 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6838  transposase IS3/IS911 family protein  39.66 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0025  transposase family  50 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000603896  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0063  IS66 family element, orf1  48.84 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.854269  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4974  transposase IS3/IS911  35.09 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000160707  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2291  transposase IS3/IS911 family protein  36.59 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112265  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1057  transposase IS3/IS911 family protein  39.53 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.905137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1090  transposase IS3/IS911 family protein  39.53 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1364  transposase IS3/IS911 family protein  39.53 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.059427 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1480  transposase IS3/IS911 family protein  39.53 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10456 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3806  transposase IS3/IS911  40.91 
 
 		 170 aa  43.9  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179711  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0065  IS66 family orf1  40.38 
 
 		 225 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.22402  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0003  IS66 family orf1  40.38 
 
 		 225 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.930174  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0045  IS66 family orf1  40.38 
 
 		 225 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.88778  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1759  IS66 family orf1  40.38 
 
 		 154 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0153795  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3366  IS66 family orf1  40.38 
 
 		 225 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.451568  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4881  IS66 family orf1  40.38 
 
 		 225 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3124  IS66 family transposase orfA  40.38 
 
 		 225 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2121  IS66 family orf1  42.86 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.715021  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6579  transposase IS3/IS911 family protein  31.33 
 
 		 159 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal  0.0213341 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0077  hypothetical protein  34.92 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1101  hypothetical protein  34.92 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0229521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1441  hypothetical protein  34.92 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1445  hypothetical protein  34.92 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0109828  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1452  hypothetical protein  34.92 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2690  hypothetical protein  34.92 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573831  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2737  hypothetical protein  34.92 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0586218  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2889  hypothetical protein  34.92 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3089  hypothetical protein  34.92 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000589591  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3142  hypothetical protein  34.92 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3597  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  52.78 
 
 		 254 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237636  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2589  putative IS3 transposase, TnpA  34.78 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.789608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3167  hypothetical protein  50 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.696218 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4274  ISSfl4 ORF1  43.9 
 
 		 224 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0397  transposase IS3/IS911  34.83 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.541296  normal  0.262239 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0257  putative transposase  29.31 
 
 		 145 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0626977 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0021  IS66 family orf1  32.2 
 
 		 129 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0040  IS66 family orf1  32.2 
 
 		 129 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0070  IS66 family element  32.2 
 
 		 129 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0817  IS66 family orf1  32.2 
 
 		 129 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.442103  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1405  IS66 family orf1  32.2 
 
 		 129 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1762  IS66 family orf1  32.2 
 
 		 129 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2931  IS66 family orf1  32.2 
 
 		 129 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3345  IS66 family orf1  32.2 
 
 		 129 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3386  IS66 family orf1  32.2 
 
 		 129 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4862  IS66 family orf1  32.2 
 
 		 129 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0116  IS66 family element, orf1  32.2 
 
 		 133 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837926  normal  0.82716 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1965  transposase IS3/IS911  32.26 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0019  hypothetical protein  37.5 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0072  IS66 family element, orf1  37.5 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202563  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0144  IS66 family element, orf1  37.5 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.642742  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0195  IS66 family element, orf1  37.5 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>