130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5984 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5984  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 115 aa  230  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1020  transposase IS3/IS911 family protein  52.59 
 
 		 112 aa  125  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1192  transposase IS3/IS911 family protein  52.59 
 
 		 112 aa  125  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1403  transposase IS3/IS911 family protein  52.59 
 
 		 112 aa  125  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2521  transposase IS3/IS911 family protein  52.59 
 
 		 112 aa  125  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4707  transposase IS3/IS911 family protein  51.67 
 
 		 130 aa  101  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.15139  normal  0.0855064 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4447  transposase IS3/IS911 family protein  47.41 
 
 		 130 aa  96.7  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.151096  normal  0.0837239 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0835  transposase IS3/IS911 family protein  42.34 
 
 		 123 aa  92.8  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.333335 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2667  transposase IS3/IS911 family protein  42.34 
 
 		 123 aa  92.8  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1168  transposase IS3/IS911 family protein  42.34 
 
 		 123 aa  92.8  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.375824  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2977  transposase IS3/IS911 family protein  42.34 
 
 		 123 aa  92.8  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0712  transposase IS3/IS911 family protein  44.07 
 
 		 114 aa  89.4  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2709  transposase IS3/IS911  37.6 
 
 		 134 aa  87  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6937  transposase IS3/IS911 family protein  41.88 
 
 		 127 aa  87  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6372  transposase ISRme19  42.11 
 
 		 125 aa  83.6  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092485 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2417a  hypothetical protein  41.82 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.2099  normal  0.256118 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1867  hypothetical protein  41.82 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.859913  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5581  hypothetical protein  38.39 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1173  transposase IS3/IS911  34.4 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3061  transposase IS3/IS911  34.4 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0570  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0784738 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2457  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.528659  normal  0.919358 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2918  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.384593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3324  hypothetical protein  41.49 
 
 		 95 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1487  hypothetical protein  41.49 
 
 		 95 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221833 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0524  hypothetical protein  38.46 
 
 		 331 aa  74.3  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.104385  hitchhiker  0.00639859 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5175  transposase IS3/IS911 family protein  40.37 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4023  transposase IS3/IS911 family protein  41.74 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0424  transposase IS3/IS911 family protein  34.71 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4441  ISPpu14, transposase Orf1  34.29 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000439178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5398  ISPpu14, transposase Orf1  34.29 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180898  hitchhiker  0.00224199 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5541  hypothetical protein  66.67 
 
 		 75 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.60846 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2471  transposase IS3/IS911 family protein  34.58 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3499  ISPpu14, transposase Orf1  34.95 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3966  ISPpu14, transposase Orf1  34.95 
 
 		 106 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3979  ISPpu14, transposase Orf1  34.95 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.061856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4437  ISPpu14, transposase Orf1  34.95 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0039  transposase IS3/IS911 family protein  34.95 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.251766 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5537  transposase IS3/IS911  65.12 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2255  transposase IS3/IS911 family protein  39.42 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6859  transposase IS3/IS911 family protein  38.1 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.643706  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0663  transposase IS3/IS911 family protein  54.17 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0077  hypothetical protein  36.79 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1101  hypothetical protein  36.79 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0229521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1441  hypothetical protein  36.79 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1445  hypothetical protein  36.79 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0109828  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1452  hypothetical protein  36.79 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2690  hypothetical protein  36.79 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573831  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2737  hypothetical protein  36.79 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0586218  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2889  hypothetical protein  36.79 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3089  hypothetical protein  36.79 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000589591  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3142  hypothetical protein  36.79 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4330  hypothetical protein  44.62 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6579  transposase IS3/IS911 family protein  48 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal  0.0213341 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6838  transposase IS3/IS911 family protein  41.79 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1057  transposase IS3/IS911 family protein  25.66 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.905137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1090  transposase IS3/IS911 family protein  25.66 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1480  transposase IS3/IS911 family protein  25.66 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10456 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3806  transposase IS3/IS911  53.49 
 
 		 170 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179711  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6338  transposase IS3/IS911 family protein  55.81 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.202859 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6443  transposase IS3/IS911 family protein  48.94 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000408557 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1364  transposase IS3/IS911 family protein  24.78 
 
 		 135 aa  50.1  0.000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.059427 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0116  IS66 family element, orf1  48.72 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837926  normal  0.82716 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0019  hypothetical protein  40.74 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0021  IS66 family orf1  48.72 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0040  IS66 family orf1  48.72 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0070  IS66 family element  48.72 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0817  IS66 family orf1  48.72 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.442103  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1405  IS66 family orf1  48.72 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1762  IS66 family orf1  48.72 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2931  IS66 family orf1  48.72 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3345  IS66 family orf1  48.72 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3386  IS66 family orf1  48.72 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4862  IS66 family orf1  48.72 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0144  IS66 family element, orf1  40.74 
 
 		 129 aa  49.7  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.642742  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0072  IS66 family element, orf1  40.74 
 
 		 129 aa  49.7  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202563  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0195  IS66 family element, orf1  40.74 
 
 		 129 aa  49.7  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3167  hypothetical protein  39.34 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.696218 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0226  IS66 family element, orf1  40.74 
 
 		 129 aa  49.7  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59560  putative transposase  45 
 
 		 88 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000451913  hitchhiker  4.3260500000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0063  IS66 family element, orf1  41.51 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.854269  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7615  transposase IS3/IS911 family protein  36.36 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.557321  normal  0.767348 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4974  transposase IS3/IS911  44 
 
 		 138 aa  47  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000160707  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3182  transposase IS3/IS911 family protein  37.14 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3137  IS66 family transposase orfA  31.67 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0025  transposase family  40.38 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000603896  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5562  transposase IS3/IS911 family protein  45.1 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456649 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1178  putative DNA-binding protein  41.07 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693647  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0257  putative transposase  44.44 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0626977 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1729  transposase  43.14 
 
 		 164 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2813  transposase  39.29 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0276  transposase IS3/IS911 family protein  43.9 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4917  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 172 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2589  putative IS3 transposase, TnpA  41.07 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.789608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4642  transposase IS3/IS911 family protein  37.74 
 
 		 129 aa  43.9  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.882945  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2121  IS66 family orf1  30 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.715021  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5386  transposase IS3/IS911 family protein  34.83 
 
 		 115 aa  43.5  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.946691 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0183  IS3/IS911 family transposase  30.97 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1225  IS3/IS911 family transposase  30.97 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.54899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1537  transposase  42.86 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>