165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1225 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1225  IS3/IS911 family transposase  100 
 
 		 123 aa  243  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.54899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0183  IS3/IS911 family transposase  99.19 
 
 		 140 aa  241  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9620  hypothetical protein  45.79 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.754847  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4596  transposase IS3/IS911 family protein  38.76 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.699862 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4652  transposase IS3/IS911 family protein  40.43 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.110926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4875  transposase IS3/IS911 family protein  39.36 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.64301  normal  0.539748 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3012  transposase  46.74 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930008  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0935  transposase IS3/IS911 family protein  44.57 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.089943  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3504  hypothetical protein  44.57 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138745  normal  0.543824 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4339  transposase IS3/IS911 family protein  39.2 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8374  transposase IS3/IS911 family protein  39.2 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6320  transposase IS3/IS911 family protein  39.2 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3726  hypothetical protein  41 
 
 		 133 aa  62  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.890145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4167  IS3 family transposase  34.51 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0827165  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0648  transposase IS3/IS911  38.89 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0433  transposase IS3/IS911 family protein  43.08 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0349226 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0917  transposase IS3/IS911 family protein  43.08 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.308887  normal  0.246469 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1415  transposase IS3/IS911 family protein  43.08 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1417  transposase IS3/IS911 family protein  43.08 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1807  transposase IS3/IS911 family protein  43.08 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3518  hypothetical protein  43.08 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.734603 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3717  hypothetical protein  43.08 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3720  hypothetical protein  43.08 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3761  hypothetical protein  43.08 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4303  hypothetical protein  43.08 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4310  hypothetical protein  43.08 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3008  transposase IS3/IS911  47.83 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5410  transposase IS3/IS911 family protein  41.59 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.650569 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4907  transposase IS3/IS911 family protein  42.5 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1112  transposase IS3/IS911 family protein  34.43 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3309  transposase IS3/IS911 family protein  47.14 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.437547 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0276  transposase IS3/IS911 family protein  33.91 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5463  transposase IS3/IS911 family protein  54.17 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6122  transposase IS3/IS911 family protein  57.78 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4024  hypothetical protein  41.89 
 
 		 107 aa  52.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1965  transposase IS3/IS911  47.54 
 
 		 137 aa  52  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0786  transposase IS3/IS911 family protein  40.74 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0558  IS66 family Orf1  34.78 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.412766  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0524  IS66 family orf1 transposase  34.78 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5516  transposase IS3/IS911 family protein  38.89 
 
 		 156 aa  51.2  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6366  transposase IS3/IS911 family protein  38.89 
 
 		 160 aa  51.2  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1220  transposase IS3/IS911 family protein  38.89 
 
 		 156 aa  51.2  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  0.0481139 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3409  hypothetical protein  29.77 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0611  putative transposase  57.78 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6363  putative transposase  57.78 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5080  transposase IS3/IS911 family protein  35.65 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7043  transposase  29.77 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.443559  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0686  transposase  29.77 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9097  TRm1a transposase  29.55 
 
 		 162 aa  50.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0566  ISRSO10-transposase ORFA protein  40.54 
 
 		 122 aa  50.4  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4820  transposase IS3/IS911 family protein  35.35 
 
 		 168 aa  50.4  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187465 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0257  putative transposase  32 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0626977 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4029  hypothetical protein  42.31 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.64412 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2589  putative IS3 transposase, TnpA  31.36 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.789608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4815  transposase IS3/IS911 family protein  35.35 
 
 		 135 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.290342 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4619  transposase IS3/IS911 family protein  37.96 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1405  IS66 family orf1  25.86 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0070  IS66 family element  25.86 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0040  IS66 family orf1  25.86 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1762  IS66 family orf1  25.86 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0072  IS66 family element, orf1  25.86 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202563  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  41.94 
 
 		 122 aa  48.1  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  41.94 
 
 		 122 aa  48.1  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0817  IS66 family orf1  25.86 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.442103  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0226  IS66 family element, orf1  25.86 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3386  IS66 family orf1  25.86 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  40.85 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0367  transposase  40.85 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1454  transposase  40.85 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1537  transposase  40.85 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0144  IS66 family element, orf1  25.86 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.642742  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2585  transposase  40.85 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.238572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2745  transposase  40.85 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2931  IS66 family orf1  25.86 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3345  IS66 family orf1  25.86 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0195  IS66 family element, orf1  25.86 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6523  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0816552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0021  IS66 family orf1  25.86 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2606  transposase IS3/IS911 family protein  45.16 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0019  hypothetical protein  25.86 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4862  IS66 family orf1  25.86 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6197  transposase IS3/IS911 family protein  44.9 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.578613  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  41.94 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4688  transposase IS3/IS911 family protein  37.04 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.426446  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2742  transposase IS3/IS911 family protein  37.04 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4326  transposase IS3/IS911 family protein  37.04 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1992  transposase IS3/IS911  43.55 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.135346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2557  transposase IS3/IS911  43.55 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221495 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0116  IS66 family element, orf1  25.86 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837926  normal  0.82716 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3339  transposase IS3/IS911 family protein  41 
 
 		 170 aa  47.8  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6460  transposase IS3/IS911 family protein  44.9 
 
 		 176 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.556682 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2724  transposase IS3/IS911 family protein  41.51 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.8231  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0139  transposase IS3/IS911  51.06 
 
 		 109 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1472  transposase IS3/IS911 family protein  42.03 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6488  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6511  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0972019 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1445  hypothetical protein  25.81 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0109828  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1452  hypothetical protein  25.81 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2690  hypothetical protein  25.81 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573831  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2737  hypothetical protein  25.81 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0586218  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>