82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6372 on replicon NC_007971
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007971  Rmet_6372  transposase ISRme19  100 
 
 		 125 aa  252  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092485 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2977  transposase IS3/IS911 family protein  76.8 
 
 		 123 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1168  transposase IS3/IS911 family protein  76.8 
 
 		 123 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.375824  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0835  transposase IS3/IS911 family protein  76.8 
 
 		 123 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.333335 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2667  transposase IS3/IS911 family protein  76.8 
 
 		 123 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1487  hypothetical protein  73.2 
 
 		 95 aa  144  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221833 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3324  hypothetical protein  73.2 
 
 		 95 aa  144  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6937  transposase IS3/IS911 family protein  48.84 
 
 		 127 aa  105  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2417a  hypothetical protein  48.84 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.2099  normal  0.256118 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1867  hypothetical protein  48.84 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.859913  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4447  transposase IS3/IS911 family protein  40.5 
 
 		 130 aa  94  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.151096  normal  0.0837239 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1020  transposase IS3/IS911 family protein  41.03 
 
 		 112 aa  87  8e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1192  transposase IS3/IS911 family protein  41.03 
 
 		 112 aa  87  8e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1403  transposase IS3/IS911 family protein  41.03 
 
 		 112 aa  87  8e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2521  transposase IS3/IS911 family protein  41.03 
 
 		 112 aa  87  8e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0424  transposase IS3/IS911 family protein  43.59 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5984  transposase IS3/IS911 family protein  42.11 
 
 		 115 aa  83.6  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2709  transposase IS3/IS911  38.33 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1173  transposase IS3/IS911  38.33 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3061  transposase IS3/IS911  38.33 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5581  hypothetical protein  39.13 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0524  hypothetical protein  42.24 
 
 		 331 aa  77  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.104385  hitchhiker  0.00639859 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4023  transposase IS3/IS911 family protein  32.06 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2255  transposase IS3/IS911 family protein  35.34 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4707  transposase IS3/IS911 family protein  41.74 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.15139  normal  0.0855064 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3966  ISPpu14, transposase Orf1  29.2 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2471  transposase IS3/IS911 family protein  39.22 
 
 		 130 aa  67  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3499  ISPpu14, transposase Orf1  28.32 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3979  ISPpu14, transposase Orf1  28.32 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.061856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4437  ISPpu14, transposase Orf1  28.32 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0039  transposase IS3/IS911 family protein  28.32 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.251766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4441  ISPpu14, transposase Orf1  28.57 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000439178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5398  ISPpu14, transposase Orf1  28.57 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180898  hitchhiker  0.00224199 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5175  transposase IS3/IS911 family protein  32.74 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0712  transposase IS3/IS911 family protein  31.53 
 
 		 114 aa  53.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1410  transposase IS3/IS911 family protein  32.76 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6579  transposase IS3/IS911 family protein  51.11 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal  0.0213341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3090  transposase IS3/IS911 family protein  32.76 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.234179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59560  putative transposase  39.13 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000451913  hitchhiker  4.3260500000000003e-19 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3806  transposase IS3/IS911  40.58 
 
 		 170 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179711  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6838  transposase IS3/IS911 family protein  37.31 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4330  hypothetical protein  41.43 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0340  transposase IS3/IS911  54.76 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394046  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6338  transposase IS3/IS911 family protein  35.53 
 
 		 155 aa  47.4  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.202859 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1480  transposase IS3/IS911 family protein  36.49 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10456 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1090  transposase IS3/IS911 family protein  36.49 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1057  transposase IS3/IS911 family protein  36.49 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.905137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7466  transposase IS3/IS911 family protein  35 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6443  transposase IS3/IS911 family protein  28.21 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000408557 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5537  transposase IS3/IS911  38.24 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1364  transposase IS3/IS911 family protein  35.14 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.059427 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6859  transposase IS3/IS911 family protein  35.24 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.643706  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2918  transposase IS3/IS911 family protein  27.86 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.384593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2457  transposase IS3/IS911 family protein  27.86 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.528659  normal  0.919358 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0570  transposase IS3/IS911 family protein  27.86 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0784738 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2589  putative IS3 transposase, TnpA  27.82 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.789608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6523  transposase IS3/IS911 family protein  33.93 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0816552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3182  transposase IS3/IS911 family protein  44.23 
 
 		 125 aa  43.9  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0080  putative ISPpu14, transposase Orf1  31.13 
 
 		 174 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.195214 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2548  putative transposase, ISPpu14 Orf1 like  31.13 
 
 		 160 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0663  transposase IS3/IS911 family protein  52.5 
 
 		 128 aa  43.5  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0063  putative transposase  31.13 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3738  putative transposase  31.13 
 
 		 160 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7615  transposase IS3/IS911 family protein  31.33 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.557321  normal  0.767348 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6377  helix-turn-helix, Fis-type  30.71 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4274  ISSfl4 ORF1  35.94 
 
 		 224 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4532  transposase IS3/IS911 family protein  46.94 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0946  transposase IS3/IS911 family protein  37.25 
 
 		 415 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.365915 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6339  transposase IS3/IS911  38.98 
 
 		 167 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5541  hypothetical protein  52.5 
 
 		 75 aa  41.2  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.60846 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4917  transposase IS3/IS911 family protein  40.91 
 
 		 172 aa  41.2  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0077  hypothetical protein  36.46 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1101  hypothetical protein  36.46 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0229521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1441  hypothetical protein  36.46 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3142  hypothetical protein  36.46 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3089  hypothetical protein  36.46 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000589591  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2889  hypothetical protein  36.46 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1445  hypothetical protein  36.46 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0109828  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2737  hypothetical protein  36.46 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0586218  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2690  hypothetical protein  36.46 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573831  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2523  transposase IS3/IS911 family protein  35.38 
 
 		 145 aa  40  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1452  hypothetical protein  36.46 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>