192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6443 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6443  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
133 aa  271  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000408557 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0077  hypothetical protein  34.35 
 
 
135 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1101  hypothetical protein  34.35 
 
 
135 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0229521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1441  hypothetical protein  34.35 
 
 
135 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1445  hypothetical protein  34.35 
 
 
135 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0109828  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1452  hypothetical protein  34.35 
 
 
135 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2690  hypothetical protein  34.35 
 
 
135 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573831  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2737  hypothetical protein  34.35 
 
 
135 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0586218  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2889  hypothetical protein  34.35 
 
 
135 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3089  hypothetical protein  34.35 
 
 
135 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000589591  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3142  hypothetical protein  34.35 
 
 
135 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0472  putative transposase IS3/IS911  40.38 
 
 
132 aa  72  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6859  transposase IS3/IS911 family protein  29.37 
 
 
131 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.643706  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1759  IS66 family orf1  52.83 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0153795  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3366  IS66 family orf1  52.83 
 
 
225 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.451568  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0065  IS66 family orf1  52.83 
 
 
225 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.22402  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0003  IS66 family orf1  52.83 
 
 
225 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.930174  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4881  IS66 family orf1  52.83 
 
 
225 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0045  IS66 family orf1  52.83 
 
 
225 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.88778  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3124  IS66 family transposase orfA  52.83 
 
 
225 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0116  IS66 family element, orf1  31.34 
 
 
133 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837926  normal  0.82716 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0019  hypothetical protein  31.34 
 
 
133 aa  62.4  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2931  IS66 family orf1  32.03 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0070  IS66 family element  32.03 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0040  IS66 family orf1  32.03 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3345  IS66 family orf1  32.03 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0021  IS66 family orf1  32.03 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0063  IS66 family element, orf1  33.57 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.854269  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0817  IS66 family orf1  32.03 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.442103  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1405  IS66 family orf1  32.03 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4862  IS66 family orf1  32.03 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3386  IS66 family orf1  32.03 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1762  IS66 family orf1  32.03 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0195  IS66 family element, orf1  32.03 
 
 
129 aa  62  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0072  IS66 family element, orf1  32.03 
 
 
129 aa  62  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202563  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0144  IS66 family element, orf1  32.03 
 
 
129 aa  62  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.642742  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4974  transposase IS3/IS911  42 
 
 
138 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000160707  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2813  transposase  31.78 
 
 
131 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0226  IS66 family element, orf1  32.03 
 
 
129 aa  62  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0663  transposase IS3/IS911 family protein  36.72 
 
 
128 aa  61.6  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2589  putative IS3 transposase, TnpA  35.82 
 
 
142 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.789608  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0025  transposase family  33.33 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000603896  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0257  putative transposase  30.08 
 
 
145 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0626977 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0276  transposase IS3/IS911 family protein  51.06 
 
 
126 aa  60.1  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3776  putative transposase  57.45 
 
 
131 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.981228 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2121  IS66 family orf1  31.11 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.715021  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1178  putative DNA-binding protein  29.77 
 
 
131 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693647  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3012  transposase  36.7 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930008  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3137  IS66 family transposase orfA  30.37 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6523  transposase IS3/IS911 family protein  58.14 
 
 
145 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0816552  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1391  IS66 family element, orf1  33.88 
 
 
120 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4274  ISSfl4 ORF1  41.38 
 
 
224 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5537  transposase IS3/IS911  37.74 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3309  transposase IS3/IS911 family protein  32.41 
 
 
110 aa  52.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.437547 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1364  transposase IS3/IS911 family protein  28.68 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.059427 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1057  transposase IS3/IS911 family protein  27.91 
 
 
135 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.905137  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1090  transposase IS3/IS911 family protein  27.91 
 
 
135 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1480  transposase IS3/IS911 family protein  27.91 
 
 
135 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.10456 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5984  transposase IS3/IS911 family protein  48.94 
 
 
115 aa  50.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1337  transposase OrfA, ISEc8  32.23 
 
 
120 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2724  transposase IS3/IS911 family protein  30.97 
 
 
129 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.8231  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5175  transposase IS3/IS911 family protein  39.39 
 
 
110 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5563  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.121852 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2606  transposase IS3/IS911 family protein  42 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1931  transposase  50 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.575693  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5095  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5054  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.880446  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4855  transposase IS3/IS911  50 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3311  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6834  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1020  transposase IS3/IS911 family protein  40.98 
 
 
112 aa  47.4  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1403  transposase IS3/IS911 family protein  40.98 
 
 
112 aa  47.4  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2521  transposase IS3/IS911 family protein  40.98 
 
 
112 aa  47.4  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1192  transposase IS3/IS911 family protein  40.98 
 
 
112 aa  47.4  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0397  transposase IS3/IS911  43.75 
 
 
119 aa  47.4  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.541296  normal  0.262239 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4917  transposase IS3/IS911 family protein  46.67 
 
 
172 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999875  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1112  transposase IS3/IS911 family protein  27.69 
 
 
149 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3761  putative transposase  44 
 
 
135 aa  47  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4447  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 
130 aa  47  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.151096  normal  0.0837239 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  36 
 
 
122 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  36 
 
 
121 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  36 
 
 
122 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  37.25 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0367  transposase  37.25 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1454  transposase  37.25 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1537  transposase  37.25 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2585  transposase  37.25 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.238572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2745  transposase  37.25 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2709  transposase IS3/IS911  32.32 
 
 
134 aa  46.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1992  transposase IS3/IS911  38 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.135346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2557  transposase IS3/IS911  38 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.221495 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1168  transposase IS3/IS911 family protein  32.53 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.375824  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1173  transposase IS3/IS911  34.41 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3061  transposase IS3/IS911  34.41 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6372  transposase ISRme19  28.21 
 
 
125 aa  45.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092485 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0108  insertion sequence 2 OrfA protein  33.33 
 
 
136 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0157365  hitchhiker  0.00244119 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0401  insertion sequence 2 OrfA protein  33.33 
 
 
136 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1086  insertion sequence 2 OrfA protein  33.33 
 
 
136 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.612076  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1670  insertion sequence 2 OrfA protein  33.33 
 
 
136 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.724698 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1207  insertion sequence 2 OrfA protein  33.33 
 
 
136 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4197  normal  0.231836 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>