95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2417a on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1867  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  254  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.859913  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2417a  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  254  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.2099  normal  0.256118 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6937  transposase IS3/IS911 family protein  63.28 
 
 		 127 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1168  transposase IS3/IS911 family protein  51.18 
 
 		 123 aa  120  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.375824  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0835  transposase IS3/IS911 family protein  51.18 
 
 		 123 aa  120  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.333335 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2977  transposase IS3/IS911 family protein  51.18 
 
 		 123 aa  120  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2667  transposase IS3/IS911 family protein  51.18 
 
 		 123 aa  120  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6372  transposase ISRme19  48.84 
 
 		 125 aa  113  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092485 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2709  transposase IS3/IS911  43.8 
 
 		 134 aa  97.4  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1173  transposase IS3/IS911  41.32 
 
 		 134 aa  94  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3061  transposase IS3/IS911  41.32 
 
 		 134 aa  94  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4447  transposase IS3/IS911 family protein  42.28 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.151096  normal  0.0837239 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3324  hypothetical protein  48.42 
 
 		 95 aa  87.4  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1487  hypothetical protein  48.42 
 
 		 95 aa  87.4  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221833 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5984  transposase IS3/IS911 family protein  43.1 
 
 		 115 aa  86.7  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4023  transposase IS3/IS911 family protein  37.41 
 
 		 125 aa  86.7  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2521  transposase IS3/IS911 family protein  39.83 
 
 		 112 aa  84.3  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1403  transposase IS3/IS911 family protein  39.83 
 
 		 112 aa  84.3  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1192  transposase IS3/IS911 family protein  39.83 
 
 		 112 aa  84.3  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1020  transposase IS3/IS911 family protein  39.83 
 
 		 112 aa  84.3  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5581  hypothetical protein  40.17 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0424  transposase IS3/IS911 family protein  42.28 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0524  hypothetical protein  43.59 
 
 		 331 aa  82.4  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.104385  hitchhiker  0.00639859 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2471  transposase IS3/IS911 family protein  38.33 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5175  transposase IS3/IS911 family protein  35.83 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5398  ISPpu14, transposase Orf1  36.61 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180898  hitchhiker  0.00224199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4441  ISPpu14, transposase Orf1  36.61 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000439178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0039  transposase IS3/IS911 family protein  35.96 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.251766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3499  ISPpu14, transposase Orf1  35.96 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3966  ISPpu14, transposase Orf1  35.96 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3979  ISPpu14, transposase Orf1  35.96 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.061856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4437  ISPpu14, transposase Orf1  35.96 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2918  transposase IS3/IS911 family protein  32.88 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.384593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2457  transposase IS3/IS911 family protein  32.88 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.528659  normal  0.919358 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0570  transposase IS3/IS911 family protein  32.88 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0784738 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4707  transposase IS3/IS911 family protein  42.98 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.15139  normal  0.0855064 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2255  transposase IS3/IS911 family protein  35.9 
 
 		 113 aa  70.1  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3806  transposase IS3/IS911  40.48 
 
 		 170 aa  67  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179711  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0712  transposase IS3/IS911 family protein  34.82 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59560  putative transposase  35.05 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000451913  hitchhiker  4.3260500000000003e-19 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4330  hypothetical protein  42.31 
 
 		 79 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1364  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.059427 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1410  transposase IS3/IS911 family protein  43.16 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3090  transposase IS3/IS911 family protein  43.16 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.234179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1480  transposase IS3/IS911 family protein  36.36 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10456 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1090  transposase IS3/IS911 family protein  36.36 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1057  transposase IS3/IS911 family protein  36.36 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.905137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6579  transposase IS3/IS911 family protein  37.33 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal  0.0213341 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3182  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1729  transposase  43.84 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6838  transposase IS3/IS911 family protein  36.36 
 
 		 159 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0021  IS66 family orf1  34.09 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0040  IS66 family orf1  34.09 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0070  IS66 family element  34.09 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0817  IS66 family orf1  34.09 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.442103  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1405  IS66 family orf1  34.09 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1762  IS66 family orf1  34.09 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2931  IS66 family orf1  34.09 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3345  IS66 family orf1  34.09 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3386  IS66 family orf1  34.09 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4862  IS66 family orf1  34.09 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0226  IS66 family element, orf1  34.09 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0195  IS66 family element, orf1  34.09 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0144  IS66 family element, orf1  34.09 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.642742  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0072  IS66 family element, orf1  34.09 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202563  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7615  transposase IS3/IS911 family protein  41.43 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.557321  normal  0.767348 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0019  hypothetical protein  37.18 
 
 		 133 aa  50.4  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0116  IS66 family element, orf1  37.18 
 
 		 133 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837926  normal  0.82716 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5541  hypothetical protein  60 
 
 		 75 aa  49.7  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.60846 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6338  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.202859 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6443  transposase IS3/IS911 family protein  39.71 
 
 		 133 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000408557 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0875  transposase IS3/IS911 family protein  43.48 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0025  transposase family  44 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000603896  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0063  IS66 family element, orf1  44 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.854269  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5537  transposase IS3/IS911  39.34 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0080  putative ISPpu14, transposase Orf1  36.84 
 
 		 174 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.195214 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3597  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  52.94 
 
 		 254 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237636  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3738  putative transposase  36.84 
 
 		 160 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2548  putative transposase, ISPpu14 Orf1 like  36.84 
 
 		 160 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0063  putative transposase  36.84 
 
 		 155 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7466  transposase IS3/IS911 family protein  37.33 
 
 		 154 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4917  transposase IS3/IS911 family protein  46.51 
 
 		 172 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0663  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0340  transposase IS3/IS911  47.73 
 
 		 167 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394046  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1142  transposase IS3/IS911 family protein  44.23 
 
 		 636 aa  43.5  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0242469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4274  ISSfl4 ORF1  40 
 
 		 224 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6339  transposase IS3/IS911  37.14 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3776  putative transposase  38.46 
 
 		 131 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.981228 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1624  transposase IS3/IS911 family protein  46.94 
 
 		 123 aa  41.6  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3167  hypothetical protein  45.1 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.696218 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0558  IS66 family Orf1  39.58 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.412766  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0524  IS66 family orf1 transposase  39.58 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1992  transposase IS3/IS911  33.87 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.135346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2557  transposase IS3/IS911  33.87 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221495 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6859  transposase IS3/IS911 family protein  43.14 
 
 		 131 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.643706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>