27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1142 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1142  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 636 aa  1274    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0242469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2965  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 106 aa  75.1  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173924  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1148  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 106 aa  75.1  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4772  hypothetical protein  28.33 
 
 		 645 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021908 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0441  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 90 aa  50.8  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0287  transposase  34.94 
 
 		 96 aa  50.4  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4144  transposase IS3/IS911 family protein  44.9 
 
 		 99 aa  47.8  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3165  transposase IS3/IS911 family protein  44.9 
 
 		 99 aa  47.8  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.011268 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0778  transposase IS3/IS911 family protein  44.9 
 
 		 99 aa  47.8  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000787771 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1962  transposase IS3/IS911 family protein  44.9 
 
 		 99 aa  47.8  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2280  transposase IS3/IS911 family protein  44.9 
 
 		 99 aa  47.8  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2381  transposase IS3/IS911 family protein  44.9 
 
 		 99 aa  47.8  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3665  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 		 96 aa  45.8  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0598755  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2226  transposase IS3/IS911  37.97 
 
 		 107 aa  45.4  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0429  transposase  34.25 
 
 		 87 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3716  transposase IS3/IS911 family protein  30.25 
 
 		 122 aa  45.4  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3165  transposase IS3/IS911 family protein  38.55 
 
 		 105 aa  45.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.897924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2521  transposase IS3/IS911 family protein  36.78 
 
 		 96 aa  45.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0546  transposase IS3/IS911  34.52 
 
 		 95 aa  44.7  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.266021  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1431  transposase IS3/IS911  34.52 
 
 		 95 aa  44.7  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0966831  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1296  transposase IS3/IS911  34.52 
 
 		 95 aa  44.7  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5574  transposase IS3/IS911 family protein  34.48 
 
 		 99 aa  44.3  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5315  transposase IS3/IS911 family protein  34.48 
 
 		 99 aa  44.3  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.323663 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1452  IS1329/IS3/IS911 transposase  30 
 
 		 103 aa  43.9  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.319621 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0864  IS1329/IS3/IS911 transposase  30 
 
 		 103 aa  43.9  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.947274 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0536  IS1329/IS3/IS911 transposase  30 
 
 		 103 aa  43.9  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3370  transposase IS3/IS911 family protein  35.44 
 
 		 98 aa  43.9  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>