More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1962 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3165  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 99 aa  198  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.011268 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2280  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 99 aa  198  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0778  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 99 aa  198  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000787771 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2381  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 99 aa  198  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1962  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 99 aa  198  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4144  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 99 aa  198  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3580  hypothetical protein  75 
 
 		 80 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.274067 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3628  hypothetical protein  75 
 
 		 80 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4705  hypothetical protein  75 
 
 		 80 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1098  transposase IS3/IS911 family protein  55.91 
 
 		 96 aa  103  6e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1654  transposase IS3/IS911 family protein  55.91 
 
 		 96 aa  103  6e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.11906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1537  transposase IS3/IS911 family protein  55.91 
 
 		 96 aa  103  6e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0796312  hitchhiker  0.00103229 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0825  transposase IS3/IS911 family protein  55.91 
 
 		 96 aa  103  6e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.638038  normal  0.192299 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0261  transposase IS3/IS911 family protein  55.91 
 
 		 96 aa  103  6e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.269941 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02273  hypothetical protein  67.24 
 
 		 58 aa  80.9  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01087  hypothetical protein  67.24 
 
 		 58 aa  80.9  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.449297  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00573  hypothetical protein  67.24 
 
 		 58 aa  80.9  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06227  hypothetical protein  67.24 
 
 		 58 aa  80.9  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.657322  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3364  transposase IS3/IS911 family protein  43.82 
 
 		 101 aa  77.8  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2972  transposase IS3/IS911 family protein  43.82 
 
 		 101 aa  77.8  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00105094  normal  0.0448799 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2954  transposase IS3/IS911 family protein  43.82 
 
 		 101 aa  77.8  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.214998 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0627  transposase IS3/IS911 family protein  43.82 
 
 		 101 aa  77.8  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000506319 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0758  transposase IS3/IS911 family protein  43.82 
 
 		 101 aa  77.8  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.462502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1762  transposase IS3/IS911 family protein  43.82 
 
 		 101 aa  77.8  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3829  transposase IS3/IS911 family protein  42.39 
 
 		 102 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000725923 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1550  transposase IS3/IS911 family protein  43.82 
 
 		 101 aa  77.8  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266897  hitchhiker  0.00000139324 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2834  transposase and inactivated derivatives  40.43 
 
 		 99 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2835  hypothetical protein  44.68 
 
 		 102 aa  74.7  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0536  IS1329/IS3/IS911 transposase  38.54 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0864  IS1329/IS3/IS911 transposase  38.54 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.947274 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1452  IS1329/IS3/IS911 transposase  38.54 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.319621 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01552  transposase, IS911  40.21 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617213  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02080  transposase, IS911  40.21 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03752  transposase, IS911  40.21 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4698  hypothetical protein  43.62 
 
 		 102 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2389  hypothetical protein  43.62 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413636  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2526  hypothetical protein  43.62 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0599274  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4228  hypothetical protein  43.62 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03290  hypothetical protein  43.62 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000165521  unclonable  4.74599e-22 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51620  transposase  43.62 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141588  hitchhiker  0.0000324729 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0235  transposase IS3/IS911 family protein  39.78 
 
 		 103 aa  72  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935812 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1387  transposase OrfAB, subunit A  38.3 
 
 		 114 aa  72  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0739  transposase OrfAB, subunit A  38.3 
 
 		 114 aa  72  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0441  transposase OrfAB, subunit A  38.3 
 
 		 114 aa  72  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2360  transposase OrfAB, subunit A  38.3 
 
 		 114 aa  72  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5538  transposase IS3/IS911 family protein  42.55 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.414602  normal  0.0181307 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0731  transposase OrfAB, subunit A  38.3 
 
 		 114 aa  72  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4469  transposase IS3/IS911 family protein  43.3 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4929  transposase IS3/IS911  43.3 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3234  transposase IS3/IS911 family protein  43.3 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425434 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  41.05 
 
 		 97 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4253  transposase IS3/IS911 family protein  39.36 
 
 		 102 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237056 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2965  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173924  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4419  transposase, OrfA  40.43 
 
 		 102 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000424248 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1100  IS911 transposase orfA  37.23 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4464  IS3 family transposase orfA  38.3 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0436168  hitchhiker  0.00706078 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0304  IS911 transposase orfA  38.3 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.122708  hitchhiker  0.00078594 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1148  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01676  hypothetical protein  37.23 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0439  transposase  37.23 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2751  transposase  36.84 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.268757  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03524  transposase  37.23 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.329504  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0090  hypothetical protein  37.23 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.386278  hitchhiker  0.00000000270737 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03475  hypothetical protein  37.23 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.395069  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5033  IS911 transposase orfA  36.96 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1853  transposase IS3/IS911  38.46 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6037  hypothetical protein  39.56 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3328  transposase IS3/IS911 family protein  39.36 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2169  transposase IS3/IS911 family protein  39.36 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263727  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0561  transposase  32.98 
 
 		 103 aa  65.9  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0794003  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0651  helix-turn-helix, Fis-type  37.89 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0987  helix-turn-helix, Fis-type  37.89 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4607  helix-turn-helix, Fis-type  37.89 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1641  transposase IS3/IS911  37.36 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.783903  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1858  transposase IS3/IS911  37.36 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2075  transposase IS3/IS911  37.36 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0185  hypothetical protein  41.49 
 
 		 97 aa  63.5  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0197  hypothetical protein  41.49 
 
 		 97 aa  63.5  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1110  hypothetical protein  41.49 
 
 		 97 aa  63.5  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1577  hypothetical protein  41.49 
 
 		 97 aa  63.5  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1584  hypothetical protein  41.49 
 
 		 97 aa  63.5  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0664  transposase  33.7 
 
 		 96 aa  63.5  0.0000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1412  transposase  33.7 
 
 		 96 aa  63.5  0.0000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000502951  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2003  transposase IS3/IS911 family protein  40.4 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.523186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1944  transposase IS3/IS911 family protein  40.4 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0849  transposase  33.7 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00575778  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0855  transposase  33.7 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000259877  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0883  transposase  33.7 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.453287  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1037  transposase  33.7 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000447764  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1086  transposase  33.7 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1672  transposase  33.7 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4971  transposase IS3/IS911 family protein  40.4 
 
 		 104 aa  62  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.184087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1104  transposase IS3/IS911 family protein  40.4 
 
 		 104 aa  62  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.339333 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4228  transposase IS3/IS911 family protein  40.4 
 
 		 104 aa  62  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1031  transposase IS3/IS911 family protein  40.4 
 
 		 104 aa  62  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4249  transposase IS3/IS911 family protein  40.4 
 
 		 104 aa  62  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0339  transposase IS3/IS911 family protein  40.4 
 
 		 104 aa  62  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3600  transposase IS3/IS911 family protein  40.4 
 
 		 104 aa  62  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3275  transposase IS3/IS911 family protein  40.4 
 
 		 104 aa  62  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0841  transposase IS3/IS911 family protein  40.4 
 
 		 104 aa  62  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.216447 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>