More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1086 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008505  LACR_C60  transposase  100 
 
 		 357 aa  193  6e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0849  transposase  100 
 
 		 96 aa  192  2e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00575778  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0855  transposase  100 
 
 		 96 aa  192  2e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000259877  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0883  transposase  100 
 
 		 96 aa  192  2e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.453287  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1037  transposase  100 
 
 		 96 aa  192  2e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000447764  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1086  transposase  100 
 
 		 96 aa  192  2e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1672  transposase  100 
 
 		 96 aa  192  2e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0664  transposase  98.96 
 
 		 96 aa  191  4e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1412  transposase  98.96 
 
 		 96 aa  190  7e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000502951  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0185  hypothetical protein  43.33 
 
 		 97 aa  73.6  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0197  hypothetical protein  43.33 
 
 		 97 aa  73.6  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1110  hypothetical protein  43.33 
 
 		 97 aa  73.6  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1577  hypothetical protein  43.33 
 
 		 97 aa  73.6  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1584  hypothetical protein  43.33 
 
 		 97 aa  73.6  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0569  hypothetical protein  41.3 
 
 		 97 aa  70.5  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02080  transposase, IS911  41.76 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01552  transposase, IS911  41.76 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617213  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5538  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.414602  normal  0.0181307 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03752  transposase, IS911  41.76 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  41.18 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2200  transposase IS3/IS911 family protein  34.41 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2010  transposase IS3/IS911 family protein  34.41 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.639133  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0401  transposase IS3/IS911 family protein  37.65 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1485  transposase IS3/IS911 family protein  34.41 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230726  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1610  transposase IS3/IS911  37.23 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1828  transposase IS3/IS911 family protein  34.41 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2694  transposase IS3/IS911 family protein  34.41 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2950  transposase IS3/IS911 family protein  34.41 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1824  transposase IS3/IS911 family protein  34.41 
 
 		 94 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1560  transposase IS3/IS911 family protein  34.41 
 
 		 94 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2278  transposase IS3/IS911  41.86 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1182  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0669235 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1098  transposase IS3/IS911 family protein  35.42 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0825  transposase IS3/IS911 family protein  35.42 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.638038  normal  0.192299 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0261  transposase IS3/IS911 family protein  35.42 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.269941 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1654  transposase IS3/IS911 family protein  35.42 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.11906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1819  transposase-like  39.53 
 
 		 98 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000000187587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1537  transposase IS3/IS911 family protein  35.42 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0796312  hitchhiker  0.00103229 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2906  transposase IS3/IS911 family protein  36.05 
 
 		 96 aa  63.5  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1014  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 		 98 aa  63.5  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1962  transposase IS3/IS911 family protein  33.7 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4144  transposase IS3/IS911 family protein  33.7 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0778  transposase IS3/IS911 family protein  33.7 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000787771 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2280  transposase IS3/IS911 family protein  33.7 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2381  transposase IS3/IS911 family protein  33.7 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3165  transposase IS3/IS911 family protein  33.7 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.011268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3328  transposase IS3/IS911 family protein  37.65 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2169  transposase IS3/IS911 family protein  37.65 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263727  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2751  transposase  39.08 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.268757  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1398  transposase-like  40.7 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.276724  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1745  transposase-like  40.7 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0731  transposase IS3/IS911 family protein  37.21 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0479858  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1853  transposase IS3/IS911  32.97 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4601  transposase IS3/IS911 family protein  34.52 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13730  transposase IS3/IS911 family protein  36.73 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169245  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00280  transposase IS3/IS911 family protein  36.73 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1583  transposase IS3/IS911 family protein  34.04 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1704  transposase IS3/IS911 family protein  34.04 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0140  transposase IS3/IS911 family protein  34.04 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3971  ISEhe3, transposase orfA  32.29 
 
 		 92 aa  57  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000376066  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0280  ISEhe3, transposase orfA  32.29 
 
 		 92 aa  57  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1261  ISEhe3, transposase orfA  32.29 
 
 		 92 aa  57  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2789  ISEhe3, transposase orfA  32.29 
 
 		 92 aa  57  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.013431  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0325  ISEhe3, transposase orfA  32.29 
 
 		 92 aa  57  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.196335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0142  ISEhe3, transposase orfA  32.29 
 
 		 92 aa  57  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000709796  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1990  ISEhe3, transposase orfA  32.29 
 
 		 92 aa  57  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000327529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0436  ISEhe3, transposase orfA  32.29 
 
 		 92 aa  57  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3022  ISEhe3, transposase orfA  32.29 
 
 		 92 aa  57  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00292237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2065  ISEhe3, transposase orfA  31.52 
 
 		 92 aa  57  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000139393  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  34.78 
 
 		 92 aa  57  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0346  ISEhe3, transposase orfA  32.29 
 
 		 92 aa  57  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0509042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4530  ISEhe3, transposase orfA  32.29 
 
 		 92 aa  57  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.66022  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3407  transposase IS3/IS911 family protein  34.78 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3340  transposase IS3/IS911 family protein  34.78 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0763009  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2162  transposase IS3/IS911 family protein  32.98 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.102712  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4253  transposase IS3/IS911 family protein  35.56 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237056 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03535  predicted IS protein  34.83 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.924615  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0651  helix-turn-helix, Fis-type  30.43 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0987  helix-turn-helix, Fis-type  30.43 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4607  helix-turn-helix, Fis-type  30.43 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2834  transposase and inactivated derivatives  34.07 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03480  hypothetical protein  34.83 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707856  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4469  transposase IS3/IS911 family protein  35.56 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3829  transposase IS3/IS911 family protein  31.87 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000725923 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4929  transposase IS3/IS911  35.56 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3234  transposase IS3/IS911 family protein  35.56 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425434 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0623  hypothetical protein  36.67 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1232  hypothetical protein  36.67 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1297  hypothetical protein  36.67 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0090  hypothetical protein  29.67 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.386278  hitchhiker  0.00000000270737 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2547  transposase IS3/IS911 family protein  37.21 
 
 		 105 aa  53.5  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03524  transposase  29.67 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.329504  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0772  transposase IS3/IS911 family protein  37.21 
 
 		 105 aa  53.5  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4216  transposase IS3/IS911 family protein  37.21 
 
 		 105 aa  53.5  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03475  hypothetical protein  29.67 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.395069  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1641  transposase IS3/IS911  29.67 
 
 		 102 aa  53.5  0.0000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.783903  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1858  transposase IS3/IS911  29.67 
 
 		 102 aa  53.5  0.0000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2075  transposase IS3/IS911  29.67 
 
 		 102 aa  53.5  0.0000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2340  transposase IS3/IS911 family protein  31.25 
 
 		 92 aa  53.5  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0864  IS1329/IS3/IS911 transposase  28.89 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.947274 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>