More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00573 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_06227  hypothetical protein  100 
 
 
58 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.657322  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01087  hypothetical protein  100 
 
 
58 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.449297  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00573  hypothetical protein  100 
 
 
58 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02273  hypothetical protein  100 
 
 
58 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1537  transposase IS3/IS911 family protein  73.68 
 
 
96 aa  88.2  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0796312  hitchhiker  0.00103229 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0825  transposase IS3/IS911 family protein  73.68 
 
 
96 aa  88.2  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.638038  normal  0.192299 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0261  transposase IS3/IS911 family protein  73.68 
 
 
96 aa  88.2  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.269941 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1098  transposase IS3/IS911 family protein  73.68 
 
 
96 aa  88.2  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1654  transposase IS3/IS911 family protein  73.68 
 
 
96 aa  88.2  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.11906  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3580  hypothetical protein  70.69 
 
 
80 aa  86.7  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.274067 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3628  hypothetical protein  70.69 
 
 
80 aa  86.7  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4705  hypothetical protein  70.69 
 
 
80 aa  86.7  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2280  transposase IS3/IS911 family protein  67.24 
 
 
99 aa  80.9  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3165  transposase IS3/IS911 family protein  67.24 
 
 
99 aa  80.9  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.011268 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1962  transposase IS3/IS911 family protein  67.24 
 
 
99 aa  80.9  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0778  transposase IS3/IS911 family protein  67.24 
 
 
99 aa  80.9  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000787771 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4144  transposase IS3/IS911 family protein  67.24 
 
 
99 aa  80.9  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2381  transposase IS3/IS911 family protein  67.24 
 
 
99 aa  80.9  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3829  transposase IS3/IS911 family protein  54.72 
 
 
102 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000725923 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2834  transposase and inactivated derivatives  52.83 
 
 
99 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3045  ISPsy12, transposase OrfA  50 
 
 
62 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.249443  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0536  IS1329/IS3/IS911 transposase  50.91 
 
 
103 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0864  IS1329/IS3/IS911 transposase  50.91 
 
 
103 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.947274 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1452  IS1329/IS3/IS911 transposase  50.91 
 
 
103 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.319621 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1176  hypothetical protein  49.12 
 
 
110 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327458  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4929  transposase IS3/IS911  46.43 
 
 
102 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4469  transposase IS3/IS911 family protein  46.43 
 
 
102 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3234  transposase IS3/IS911 family protein  46.43 
 
 
102 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.425434 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4253  transposase IS3/IS911 family protein  46.43 
 
 
102 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237056 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6427  transposase IS3/IS911 family protein  48.15 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.906991 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6464  transposase IS3/IS911 family protein  48.15 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0304  IS911 transposase orfA  50 
 
 
103 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.122708  hitchhiker  0.00078594 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4464  IS3 family transposase orfA  50 
 
 
103 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0436168  hitchhiker  0.00706078 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03524  transposase  48 
 
 
115 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.329504  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03475  hypothetical protein  48 
 
 
115 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.395069  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0090  hypothetical protein  48 
 
 
103 aa  52  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.386278  hitchhiker  0.00000000270737 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0627  transposase IS3/IS911 family protein  45.28 
 
 
101 aa  51.6  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000506319 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0758  transposase IS3/IS911 family protein  45.28 
 
 
101 aa  51.6  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.462502  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1550  transposase IS3/IS911 family protein  45.28 
 
 
101 aa  51.6  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266897  hitchhiker  0.00000139324 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1762  transposase IS3/IS911 family protein  45.28 
 
 
101 aa  51.6  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2954  transposase IS3/IS911 family protein  45.28 
 
 
101 aa  51.6  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.214998 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2972  transposase IS3/IS911 family protein  45.28 
 
 
101 aa  51.6  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00105094  normal  0.0448799 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3364  transposase IS3/IS911 family protein  45.28 
 
 
101 aa  51.6  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2526  hypothetical protein  45.28 
 
 
102 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0599274  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0366  putative glycine betaine/choline/proline transport system permease protein  45.61 
 
 
103 aa  50.8  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0439  transposase  45.28 
 
 
103 aa  50.8  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0593  putative glycine betaine/choline/proline transport system permease protein  45.61 
 
 
103 aa  50.8  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1139  putative glycine betaine/choline/proline transport system permease protein  45.61 
 
 
103 aa  50.8  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1572  transposase IS3/IS911  45.61 
 
 
103 aa  51.2  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2389  hypothetical protein  45.28 
 
 
102 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413636  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3490  putative glycine betaine/choline/proline transport system permease protein  45.61 
 
 
103 aa  50.8  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03290  hypothetical protein  45.28 
 
 
102 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000165521  unclonable  4.74599e-22 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51620  transposase  45.28 
 
 
102 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141588  hitchhiker  0.0000324729 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1100  IS911 transposase orfA  48 
 
 
103 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0235  transposase IS3/IS911 family protein  42.11 
 
 
103 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0935812 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3329  IS911, transposase orfA  43.4 
 
 
100 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4419  transposase, OrfA  46.43 
 
 
102 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000424248 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03752  transposase, IS911  44.64 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6037  hypothetical protein  45.28 
 
 
102 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1148  transposase IS3/IS911 family protein  44.64 
 
 
106 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0684  transposase IS3/IS911 family protein  43.4 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0754  transposase IS3/IS911 family protein  43.4 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.899394  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0865  transposase IS3/IS911 family protein  43.4 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1610  transposase IS3/IS911 family protein  43.4 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2050  transposase IS3/IS911 family protein  43.4 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.575718  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3016  transposase IS3/IS911 family protein  43.4 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3144  transposase IS3/IS911 family protein  43.4 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0609516  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3616  transposase IS3/IS911 family protein  43.4 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4014  transposase IS3/IS911 family protein  43.4 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01552  transposase, IS911  44.64 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617213  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02080  transposase, IS911  44.64 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3109  IS911, transposase orfA  41.51 
 
 
100 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1217  transposase IS3/IS911 family protein  47.37 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2965  transposase IS3/IS911 family protein  44.64 
 
 
106 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173924  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5033  IS911 transposase orfA  47.92 
 
 
104 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4658  transposase IS3/IS911 family protein  43.4 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.753244  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4652  transposase IS3/IS911 family protein  43.4 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2314  transposase  42.86 
 
 
102 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.397505 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4228  hypothetical protein  43.4 
 
 
102 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2835  hypothetical protein  43.4 
 
 
102 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2936  transposase IS3/IS911 family protein  48.15 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.312037  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0459  transposase IS3/IS911 family protein  43.4 
 
 
103 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0726  transposase IS3/IS911 family protein  43.4 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1348  transposase IS3/IS911 family protein  43.4 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1934  transposase IS3/IS911 family protein  43.4 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3313  transposase IS3/IS911 family protein  43.4 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4038  transposase IS3/IS911 family protein  43.4 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0225  IS911, transposase orfA  41.51 
 
 
100 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0129  IS911, transposase orfA  41.51 
 
 
100 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0117251  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0718  IS911, transposase orfA  41.51 
 
 
100 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.373976  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0696  IS911, transposase orfA  41.51 
 
 
100 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493736  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0690  IS911, transposase orfA  41.51 
 
 
100 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141055  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1237  IS911, transposase orfA  41.51 
 
 
100 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1301  IS911, transposase orfA  41.51 
 
 
100 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0253  IS911, transposase orfA  41.51 
 
 
100 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.653907  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1594  IS911, transposase orfA  41.51 
 
 
100 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1637  IS911, transposase orfA  41.51 
 
 
100 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1605  IS911, transposase orfA  41.51 
 
 
100 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000357192  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1561  IS911, transposase orfA  41.51 
 
 
100 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1695  IS911, transposase orfA  41.51 
 
 
100 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00957844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>