19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1176 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1176  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  223  8e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327458  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3628  hypothetical protein  48.33 
 
 
80 aa  60.8  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4705  hypothetical protein  48.33 
 
 
80 aa  60.8  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3580  hypothetical protein  48.33 
 
 
80 aa  60.8  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.274067 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4144  transposase IS3/IS911 family protein  49.15 
 
 
99 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3165  transposase IS3/IS911 family protein  49.15 
 
 
99 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.011268 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2381  transposase IS3/IS911 family protein  49.15 
 
 
99 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2280  transposase IS3/IS911 family protein  49.15 
 
 
99 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1962  transposase IS3/IS911 family protein  49.15 
 
 
99 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0778  transposase IS3/IS911 family protein  49.15 
 
 
99 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000787771 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00573  hypothetical protein  49.12 
 
 
58 aa  56.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01087  hypothetical protein  49.12 
 
 
58 aa  56.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.449297  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02273  hypothetical protein  49.12 
 
 
58 aa  56.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06227  hypothetical protein  49.12 
 
 
58 aa  56.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.657322  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0261  transposase IS3/IS911 family protein  46.03 
 
 
96 aa  53.9  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.269941 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0825  transposase IS3/IS911 family protein  46.03 
 
 
96 aa  53.9  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.638038  normal  0.192299 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1098  transposase IS3/IS911 family protein  46.03 
 
 
96 aa  53.9  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1537  transposase IS3/IS911 family protein  46.03 
 
 
96 aa  53.9  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0796312  hitchhiker  0.00103229 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1654  transposase IS3/IS911 family protein  46.03 
 
 
96 aa  53.9  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.11906  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>