More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3628 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3580  hypothetical protein  100 
 
 
80 aa  161  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.274067 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3628  hypothetical protein  100 
 
 
80 aa  161  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4705  hypothetical protein  100 
 
 
80 aa  161  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2280  transposase IS3/IS911 family protein  75 
 
 
99 aa  129  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0778  transposase IS3/IS911 family protein  75 
 
 
99 aa  129  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000787771 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2381  transposase IS3/IS911 family protein  75 
 
 
99 aa  129  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4144  transposase IS3/IS911 family protein  75 
 
 
99 aa  129  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1962  transposase IS3/IS911 family protein  75 
 
 
99 aa  129  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3165  transposase IS3/IS911 family protein  75 
 
 
99 aa  129  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.011268 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0261  transposase IS3/IS911 family protein  56.96 
 
 
96 aa  97.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.269941 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1537  transposase IS3/IS911 family protein  56.96 
 
 
96 aa  97.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0796312  hitchhiker  0.00103229 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1654  transposase IS3/IS911 family protein  56.96 
 
 
96 aa  97.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.11906  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0825  transposase IS3/IS911 family protein  56.96 
 
 
96 aa  97.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.638038  normal  0.192299 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1098  transposase IS3/IS911 family protein  56.96 
 
 
96 aa  97.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00573  hypothetical protein  70.69 
 
 
58 aa  86.7  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01087  hypothetical protein  70.69 
 
 
58 aa  86.7  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.449297  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06227  hypothetical protein  70.69 
 
 
58 aa  86.7  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.657322  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02273  hypothetical protein  70.69 
 
 
58 aa  86.7  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3829  transposase IS3/IS911 family protein  41.33 
 
 
102 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000725923 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2834  transposase and inactivated derivatives  38.67 
 
 
99 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1176  hypothetical protein  48.33 
 
 
110 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327458  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0758  transposase IS3/IS911 family protein  38.67 
 
 
101 aa  60.5  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.462502  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0627  transposase IS3/IS911 family protein  38.67 
 
 
101 aa  60.5  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000506319 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1762  transposase IS3/IS911 family protein  38.67 
 
 
101 aa  60.5  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1550  transposase IS3/IS911 family protein  38.67 
 
 
101 aa  60.5  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266897  hitchhiker  0.00000139324 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3364  transposase IS3/IS911 family protein  38.67 
 
 
101 aa  60.5  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2972  transposase IS3/IS911 family protein  38.67 
 
 
101 aa  60.5  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00105094  normal  0.0448799 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2954  transposase IS3/IS911 family protein  38.67 
 
 
101 aa  60.5  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.214998 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0536  IS1329/IS3/IS911 transposase  41.43 
 
 
103 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0864  IS1329/IS3/IS911 transposase  41.43 
 
 
103 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.947274 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1452  IS1329/IS3/IS911 transposase  41.43 
 
 
103 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.319621 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1509  transposase IS3/IS911  42.25 
 
 
95 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1532  transposase IS3/IS911 family protein  42.25 
 
 
95 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4253  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 
102 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237056 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2526  hypothetical protein  38.67 
 
 
102 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0599274  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2389  hypothetical protein  38.67 
 
 
102 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413636  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03290  hypothetical protein  38.67 
 
 
102 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000165521  unclonable  4.74599e-22 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51620  transposase  38.67 
 
 
102 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141588  hitchhiker  0.0000324729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4228  hypothetical protein  38.67 
 
 
102 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1100  IS911 transposase orfA  38.67 
 
 
103 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4464  IS3 family transposase orfA  40 
 
 
103 aa  57  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0436168  hitchhiker  0.00706078 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0304  IS911 transposase orfA  40 
 
 
103 aa  57  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.122708  hitchhiker  0.00078594 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2835  hypothetical protein  37.33 
 
 
102 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2154  transposase IS3/IS911 family protein  42.25 
 
 
95 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432378 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3842  transposase IS3/IS911 family protein  37.33 
 
 
103 aa  56.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0739  transposase IS3/IS911 family protein  37.33 
 
 
103 aa  56.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0277  transposase IS3/IS911 family protein  37.33 
 
 
103 aa  56.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0090  hypothetical protein  38.67 
 
 
103 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.386278  hitchhiker  0.00000000270737 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03524  transposase  38.67 
 
 
115 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.329504  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0375  ISSod1, transposase OrfA  39.76 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0494  ISSod1, transposase OrfA  39.76 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0656  ISSod1, transposase OrfA  39.76 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0685  ISSod1, transposase OrfA  39.76 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0891  ISSod1, transposase OrfA  39.76 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0982  ISSod1, transposase OrfA  39.76 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1025  ISSod1, transposase OrfA  39.76 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1080  ISSod1, transposase OrfA  39.76 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1082  ISSod1, transposase OrfA  39.76 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1130  ISSod1, transposase OrfA  39.76 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1133  ISSod1, transposase OrfA  39.76 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1464  ISSod1, transposase OrfA  39.76 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1514  ISSod1, transposase OrfA  39.76 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1905  ISSod1, transposase OrfA  39.76 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2025  ISSod1, transposase OrfA  39.76 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2032  ISSod1, transposase OrfA  39.76 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2057  ISSod1, transposase OrfA  39.76 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2131  ISSod1, transposase OrfA  39.76 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2134  ISSod1, transposase OrfA  39.76 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2168  ISSod1, transposase OrfA  39.76 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2172  ISSod1, transposase OrfA  39.76 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2314  ISSod1, transposase OrfA  39.76 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2368  ISSod1, transposase OrfA  39.76 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2463  ISSod1, transposase OrfA  39.76 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2733  ISSod1, transposase OrfA  39.76 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3397  ISSod1, transposase OrfA  39.76 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3569  ISSod1, transposase OrfA  39.76 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3607  ISSod1, transposase OrfA  39.76 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3609  ISSod1, transposase OrfA  39.76 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4184  ISSod1, transposase OrfA  39.76 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4278  ISSod1, transposase OrfA  39.76 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4293  ISSod1, transposase OrfA  39.76 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4301  ISSod1, transposase OrfA  39.76 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4441  ISSod1, transposase OrfA  39.76 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4581  ISSod1, transposase OrfA  39.76 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4698  hypothetical protein  37.33 
 
 
102 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03752  transposase, IS911  38.27 
 
 
97 aa  55.5  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02080  transposase, IS911  38.27 
 
 
97 aa  55.5  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4929  transposase IS3/IS911  37.18 
 
 
102 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01552  transposase, IS911  38.27 
 
 
97 aa  55.5  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617213  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4469  transposase IS3/IS911 family protein  37.18 
 
 
102 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3234  transposase IS3/IS911 family protein  37.18 
 
 
102 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.425434 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03475  hypothetical protein  38.67 
 
 
115 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.395069  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4419  transposase, OrfA  37.18 
 
 
102 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000424248 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0439  transposase  37.33 
 
 
103 aa  54.7  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0366  putative glycine betaine/choline/proline transport system permease protein  41.33 
 
 
103 aa  54.7  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0593  putative glycine betaine/choline/proline transport system permease protein  41.33 
 
 
103 aa  54.7  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1139  putative glycine betaine/choline/proline transport system permease protein  41.33 
 
 
103 aa  54.7  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1572  transposase IS3/IS911  41.33 
 
 
103 aa  54.7  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3490  putative glycine betaine/choline/proline transport system permease protein  41.33 
 
 
103 aa  54.7  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0424  transposase IS3/IS911  40 
 
 
96 aa  54.3  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>