125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2457 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0570  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
150 aa  300  4.0000000000000003e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0784738 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2457  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
150 aa  300  4.0000000000000003e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.528659  normal  0.919358 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2918  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
150 aa  300  4.0000000000000003e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.384593  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5984  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 
115 aa  80.9  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5581  hypothetical protein  38.17 
 
 
110 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4447  transposase IS3/IS911 family protein  36.05 
 
 
130 aa  72.8  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.151096  normal  0.0837239 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2709  transposase IS3/IS911  44.19 
 
 
134 aa  70.1  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1173  transposase IS3/IS911  42.53 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3061  transposase IS3/IS911  42.53 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4330  hypothetical protein  49.28 
 
 
79 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5175  transposase IS3/IS911 family protein  32.35 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4023  transposase IS3/IS911 family protein  34.65 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1403  transposase IS3/IS911 family protein  36.22 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2521  transposase IS3/IS911 family protein  36.22 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1192  transposase IS3/IS911 family protein  36.22 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1020  transposase IS3/IS911 family protein  36.22 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6937  transposase IS3/IS911 family protein  34.25 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4707  transposase IS3/IS911 family protein  36.92 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.15139  normal  0.0855064 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2417a  hypothetical protein  35.17 
 
 
128 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.2099  normal  0.256118 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1867  hypothetical protein  35.17 
 
 
128 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.859913  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6338  transposase IS3/IS911 family protein  34.78 
 
 
155 aa  63.9  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.202859 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2471  transposase IS3/IS911 family protein  57.14 
 
 
130 aa  62  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2255  transposase IS3/IS911 family protein  59.09 
 
 
113 aa  61.6  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59560  putative transposase  41.67 
 
 
88 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000451913  hitchhiker  4.3260500000000003e-19 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3806  transposase IS3/IS911  37.25 
 
 
170 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179711  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4441  ISPpu14, transposase Orf1  44.62 
 
 
106 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000439178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5398  ISPpu14, transposase Orf1  44.62 
 
 
106 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180898  hitchhiker  0.00224199 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6579  transposase IS3/IS911 family protein  47.06 
 
 
159 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal  0.0213341 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0663  transposase IS3/IS911 family protein  30.77 
 
 
128 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3499  ISPpu14, transposase Orf1  39.29 
 
 
106 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3979  ISPpu14, transposase Orf1  39.29 
 
 
106 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.061856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4437  ISPpu14, transposase Orf1  39.29 
 
 
106 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0039  transposase IS3/IS911 family protein  39.29 
 
 
106 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.251766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3966  ISPpu14, transposase Orf1  50 
 
 
106 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5541  hypothetical protein  60.42 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.60846 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1057  transposase IS3/IS911 family protein  32.18 
 
 
135 aa  55.5  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.905137  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1090  transposase IS3/IS911 family protein  32.18 
 
 
135 aa  55.5  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1480  transposase IS3/IS911 family protein  32.18 
 
 
135 aa  55.5  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.10456 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0025  transposase family  34.34 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000603896  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1364  transposase IS3/IS911 family protein  32.18 
 
 
135 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.059427 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0835  transposase IS3/IS911 family protein  30.43 
 
 
123 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.333335 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2977  transposase IS3/IS911 family protein  30.43 
 
 
123 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1168  transposase IS3/IS911 family protein  30.43 
 
 
123 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.375824  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2667  transposase IS3/IS911 family protein  30.43 
 
 
123 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0424  transposase IS3/IS911 family protein  39.66 
 
 
136 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0063  IS66 family element, orf1  34.09 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.854269  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6838  transposase IS3/IS911 family protein  45.1 
 
 
159 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6372  transposase ISRme19  28.47 
 
 
125 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092485 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5537  transposase IS3/IS911  54.76 
 
 
131 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0712  transposase IS3/IS911 family protein  30.83 
 
 
114 aa  52  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0524  hypothetical protein  45.83 
 
 
331 aa  51.2  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.104385  hitchhiker  0.00639859 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3137  IS66 family transposase orfA  30.68 
 
 
141 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6377  helix-turn-helix, Fis-type  48.84 
 
 
146 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2291  transposase IS3/IS911 family protein  37.36 
 
 
147 aa  50.4  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112265  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4907  transposase IS3/IS911 family protein  31.82 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6339  transposase IS3/IS911  45.24 
 
 
167 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3182  transposase IS3/IS911 family protein  52.27 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4987  putative insertion sequence transposase protein  38.89 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2121  IS66 family orf1  29.55 
 
 
141 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.715021  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0063  putative transposase  37.33 
 
 
155 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0080  putative ISPpu14, transposase Orf1  37.33 
 
 
174 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.195214 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2548  putative transposase, ISPpu14 Orf1 like  37.33 
 
 
160 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598372  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3738  putative transposase  37.33 
 
 
160 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0226  IS66 family element, orf1  38.18 
 
 
129 aa  45.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4274  ISSfl4 ORF1  40.68 
 
 
224 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1410  transposase IS3/IS911 family protein  34.25 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3090  transposase IS3/IS911 family protein  34.25 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.234179  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0195  IS66 family element, orf1  38.18 
 
 
129 aa  45.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0072  IS66 family element, orf1  38.18 
 
 
129 aa  45.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202563  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0144  IS66 family element, orf1  38.18 
 
 
129 aa  45.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.642742  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0875  transposase IS3/IS911 family protein  46.67 
 
 
101 aa  45.4  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0021  IS66 family orf1  38.18 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0040  IS66 family orf1  38.18 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0070  IS66 family element  38.18 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0817  IS66 family orf1  38.18 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.442103  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1405  IS66 family orf1  38.18 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1762  IS66 family orf1  38.18 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2931  IS66 family orf1  38.18 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3345  IS66 family orf1  38.18 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3386  IS66 family orf1  38.18 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4862  IS66 family orf1  38.18 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7466  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 
154 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0995  transposase IS3/IS911  32.84 
 
 
99 aa  44.7  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0116  IS66 family element, orf1  45.95 
 
 
133 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837926  normal  0.82716 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0019  hypothetical protein  42.55 
 
 
133 aa  44.7  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0257  putative transposase  27.35 
 
 
145 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0626977 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1729  transposase  40.48 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2589  putative IS3 transposase, TnpA  23.66 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.789608  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5562  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.456649 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7615  transposase IS3/IS911 family protein  43.59 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.557321  normal  0.767348 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4974  transposase IS3/IS911  39.13 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000160707  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0472  putative transposase IS3/IS911  38.1 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6443  transposase IS3/IS911 family protein  33.96 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000408557 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4917  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
172 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999875  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5463  transposase IS3/IS911 family protein  45.1 
 
 
128 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4601  transposase IS3/IS911 family protein  39.66 
 
 
98 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2252  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
131 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367013  normal  0.015617 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4619  transposase IS3/IS911 family protein  28.57 
 
 
152 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1110  hypothetical protein  36.96 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1577  hypothetical protein  36.96 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>