89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4330 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4330  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  161  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5175  transposase IS3/IS911 family protein  78.79 
 
 		 110 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5581  hypothetical protein  64.06 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4447  transposase IS3/IS911 family protein  57.14 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.151096  normal  0.0837239 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59560  putative transposase  47.3 
 
 		 88 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000451913  hitchhiker  4.3260500000000003e-19 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3979  ISPpu14, transposase Orf1  48.68 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.061856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4437  ISPpu14, transposase Orf1  48.68 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4441  ISPpu14, transposase Orf1  48.68 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000439178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5398  ISPpu14, transposase Orf1  48.68 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180898  hitchhiker  0.00224199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3499  ISPpu14, transposase Orf1  48.68 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0570  transposase IS3/IS911 family protein  49.28 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0784738 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2457  transposase IS3/IS911 family protein  49.28 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.528659  normal  0.919358 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2918  transposase IS3/IS911 family protein  49.28 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.384593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0039  transposase IS3/IS911 family protein  48.68 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.251766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3966  ISPpu14, transposase Orf1  45.95 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2709  transposase IS3/IS911  37.18 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3061  transposase IS3/IS911  37.18 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1173  transposase IS3/IS911  37.18 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2521  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1403  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1192  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1020  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1168  transposase IS3/IS911 family protein  44.29 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.375824  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0835  transposase IS3/IS911 family protein  44.29 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.333335 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2667  transposase IS3/IS911 family protein  44.29 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2977  transposase IS3/IS911 family protein  44.29 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2255  transposase IS3/IS911 family protein  44.26 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2417a  hypothetical protein  43.24 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.2099  normal  0.256118 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1867  hypothetical protein  43.24 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.859913  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5984  transposase IS3/IS911 family protein  44.62 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1480  transposase IS3/IS911 family protein  38.96 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10456 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1090  transposase IS3/IS911 family protein  38.96 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1057  transposase IS3/IS911 family protein  38.96 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.905137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1364  transposase IS3/IS911 family protein  38.96 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.059427 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2471  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4023  transposase IS3/IS911 family protein  39.06 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4707  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.15139  normal  0.0855064 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5541  hypothetical protein  57.78 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.60846 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0025  transposase family  45.1 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000603896  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6579  transposase IS3/IS911 family protein  39.68 
 
 		 159 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal  0.0213341 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3806  transposase IS3/IS911  36.25 
 
 		 170 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179711  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5537  transposase IS3/IS911  39.39 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0712  transposase IS3/IS911 family protein  41.82 
 
 		 114 aa  51.6  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0063  IS66 family element, orf1  43.75 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.854269  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6372  transposase ISRme19  41.43 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092485 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6937  transposase IS3/IS911 family protein  38.89 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0424  transposase IS3/IS911 family protein  33.78 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0472  putative transposase IS3/IS911  37.21 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3090  transposase IS3/IS911 family protein  36.11 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.234179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1410  transposase IS3/IS911 family protein  36.11 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6838  transposase IS3/IS911 family protein  32.26 
 
 		 159 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4274  ISSfl4 ORF1  43.9 
 
 		 224 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4974  transposase IS3/IS911  41.86 
 
 		 138 aa  47  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000160707  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0663  transposase IS3/IS911 family protein  38.3 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2291  transposase IS3/IS911 family protein  34.78 
 
 		 147 aa  45.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112265  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4917  transposase IS3/IS911 family protein  35.71 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2121  IS66 family orf1  37.5 
 
 		 141 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.715021  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3137  IS66 family transposase orfA  37.5 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2589  putative IS3 transposase, TnpA  43.24 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.789608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6443  transposase IS3/IS911 family protein  44.19 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000408557 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0340  transposase IS3/IS911  46.34 
 
 		 167 aa  44.7  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394046  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2523  transposase IS3/IS911 family protein  40.38 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7615  transposase IS3/IS911 family protein  41.46 
 
 		 159 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.557321  normal  0.767348 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5562  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 138 aa  43.5  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456649 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1391  IS66 family element, orf1  37.29 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3167  hypothetical protein  45.1 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.696218 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4532  transposase IS3/IS911 family protein  41.67 
 
 		 148 aa  42.7  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6338  transposase IS3/IS911 family protein  34.92 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.202859 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3182  transposase IS3/IS911 family protein  35.29 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3738  putative transposase  36.21 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0080  putative ISPpu14, transposase Orf1  36.21 
 
 		 174 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.195214 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2548  putative transposase, ISPpu14 Orf1 like  36.21 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0063  putative transposase  36.21 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1487  hypothetical protein  42.31 
 
 		 95 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221833 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3324  hypothetical protein  42.31 
 
 		 95 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1337  transposase OrfA, ISEc8  44.44 
 
 		 120 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6377  helix-turn-helix, Fis-type  34.38 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0276  transposase IS3/IS911 family protein  35.09 
 
 		 126 aa  40.8  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4881  IS66 family orf1  29.85 
 
 		 225 aa  40.8  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3366  IS66 family orf1  29.85 
 
 		 225 aa  40.8  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.451568  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0045  IS66 family orf1  29.85 
 
 		 225 aa  40.8  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.88778  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0003  IS66 family orf1  29.85 
 
 		 225 aa  40.8  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.930174  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0065  IS66 family orf1  29.85 
 
 		 225 aa  40.8  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.22402  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3124  IS66 family transposase orfA  29.85 
 
 		 225 aa  40.8  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0524  hypothetical protein  38 
 
 		 331 aa  40.8  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.104385  hitchhiker  0.00639859 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5410  transposase IS3/IS911 family protein  29.51 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.650569 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1759  IS66 family orf1  29.85 
 
 		 154 aa  40.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0153795  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6363  putative transposase  32.79 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0611  putative transposase  32.79 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>