15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5995 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5995  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  294  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2291  transposase IS3/IS911 family protein  75 
 
 		 147 aa  144  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112265  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1410  transposase IS3/IS911 family protein  39.19 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3090  transposase IS3/IS911 family protein  39.19 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.234179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2523  transposase IS3/IS911 family protein  43.02 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6338  transposase IS3/IS911 family protein  36.05 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.202859 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3806  transposase IS3/IS911  46.03 
 
 		 170 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179711  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6339  transposase IS3/IS911  34.72 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6377  helix-turn-helix, Fis-type  34.62 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1173  transposase IS3/IS911  36.11 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3061  transposase IS3/IS911  36.11 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2709  transposase IS3/IS911  48.84 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4532  transposase IS3/IS911 family protein  41.82 
 
 		 148 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4917  transposase IS3/IS911 family protein  40.62 
 
 		 172 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0340  transposase IS3/IS911  41.82 
 
 		 167 aa  40.8  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394046  normal  0.320291 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>