73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4532 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008758  Pnap_4532  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 148 aa  293  7e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2523  transposase IS3/IS911 family protein  87.16 
 
 		 145 aa  216  6e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1410  transposase IS3/IS911 family protein  44.9 
 
 		 147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3090  transposase IS3/IS911 family protein  44.9 
 
 		 147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.234179  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2291  transposase IS3/IS911 family protein  41.5 
 
 		 147 aa  97.8  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112265  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6579  transposase IS3/IS911 family protein  38.35 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal  0.0213341 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3806  transposase IS3/IS911  30.81 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179711  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7466  transposase IS3/IS911 family protein  35.66 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0340  transposase IS3/IS911  59.62 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394046  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6338  transposase IS3/IS911 family protein  31.76 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.202859 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4917  transposase IS3/IS911 family protein  32.72 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6181  hypothetical protein  32.65 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2548  putative transposase, ISPpu14 Orf1 like  33.77 
 
 		 160 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3738  putative transposase  33.77 
 
 		 160 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0063  putative transposase  33.77 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0080  putative ISPpu14, transposase Orf1  33.77 
 
 		 174 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.195214 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6377  helix-turn-helix, Fis-type  33.33 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7615  transposase IS3/IS911 family protein  30.71 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.557321  normal  0.767348 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1729  transposase  31.47 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6838  transposase IS3/IS911 family protein  44.26 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6339  transposase IS3/IS911  33.59 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6372  transposase ISRme19  30.77 
 
 		 125 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092485 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4023  transposase IS3/IS911 family protein  28.23 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0524  hypothetical protein  34.12 
 
 		 331 aa  45.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.104385  hitchhiker  0.00639859 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1168  transposase IS3/IS911 family protein  28.57 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.375824  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0835  transposase IS3/IS911 family protein  28.57 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.333335 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2977  transposase IS3/IS911 family protein  28.57 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2667  transposase IS3/IS911 family protein  28.57 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5175  transposase IS3/IS911 family protein  26.92 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5398  ISPpu14, transposase Orf1  36.59 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180898  hitchhiker  0.00224199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4441  ISPpu14, transposase Orf1  36.59 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000439178 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59560  putative transposase  41.46 
 
 		 88 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000451913  hitchhiker  4.3260500000000003e-19 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0663  transposase IS3/IS911 family protein  32.56 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0039  transposase IS3/IS911 family protein  41.46 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.251766 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4330  hypothetical protein  33.33 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3966  ISPpu14, transposase Orf1  37.5 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4437  ISPpu14, transposase Orf1  41.46 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3499  ISPpu14, transposase Orf1  41.46 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3979  ISPpu14, transposase Orf1  41.46 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.061856 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1364  transposase IS3/IS911 family protein  24.59 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.059427 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4447  transposase IS3/IS911 family protein  39.13 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.151096  normal  0.0837239 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0712  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0518  hypothetical protein  54.05 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1057  transposase IS3/IS911 family protein  25 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.905137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1090  transposase IS3/IS911 family protein  25 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1480  transposase IS3/IS911 family protein  25 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10456 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4652  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 135 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.110926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0040  IS66 family orf1  43.18 
 
 		 129 aa  41.2  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0116  IS66 family element, orf1  43.18 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837926  normal  0.82716 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5995  hypothetical protein  36.36 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0070  IS66 family element  43.18 
 
 		 129 aa  41.2  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4862  IS66 family orf1  43.18 
 
 		 129 aa  41.2  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3386  IS66 family orf1  43.18 
 
 		 129 aa  41.2  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0021  IS66 family orf1  43.18 
 
 		 129 aa  41.2  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3345  IS66 family orf1  43.18 
 
 		 129 aa  41.2  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2931  IS66 family orf1  43.18 
 
 		 129 aa  41.2  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0817  IS66 family orf1  43.18 
 
 		 129 aa  41.2  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.442103  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1405  IS66 family orf1  43.18 
 
 		 129 aa  41.2  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1762  IS66 family orf1  43.18 
 
 		 129 aa  41.2  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0072  IS66 family element, orf1  43.18 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202563  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1759  IS66 family orf1  33.61 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0153795  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0226  IS66 family element, orf1  43.18 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0195  IS66 family element, orf1  43.18 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0144  IS66 family element, orf1  43.18 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.642742  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0019  hypothetical protein  43.18 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0065  IS66 family orf1  33.61 
 
 		 225 aa  40.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.22402  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2255  transposase IS3/IS911 family protein  53.85 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4881  IS66 family orf1  33.61 
 
 		 225 aa  40.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0003  IS66 family orf1  33.61 
 
 		 225 aa  40.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.930174  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0045  IS66 family orf1  33.61 
 
 		 225 aa  40.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.88778  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3366  IS66 family orf1  33.61 
 
 		 225 aa  40.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.451568  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3124  IS66 family transposase orfA  33.61 
 
 		 225 aa  40.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2805  transposase IS3/  54.55 
 
 		 37 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>