185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4907 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_4907  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
136 aa  266  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4842  transposase IS3/IS911 family protein  52 
 
 
131 aa  114  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.926413  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2252  transposase IS3/IS911 family protein  51.24 
 
 
131 aa  110  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367013  normal  0.015617 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5013  transposase IS3/IS911 family protein  48.8 
 
 
131 aa  106  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0611  putative transposase  36.3 
 
 
133 aa  83.2  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6363  putative transposase  36.3 
 
 
133 aa  83.2  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3972  transposase IS3/IS911 family protein  48.19 
 
 
283 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4987  putative insertion sequence transposase protein  39.25 
 
 
113 aa  71.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1112  transposase IS3/IS911 family protein  39.25 
 
 
149 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4596  transposase IS3/IS911 family protein  41.57 
 
 
146 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.699862 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3008  transposase IS3/IS911  35.16 
 
 
154 aa  62  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4820  transposase IS3/IS911 family protein  32.26 
 
 
168 aa  61.6  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.187465 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6460  transposase IS3/IS911 family protein  39.66 
 
 
176 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.556682 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3182  transposase IS3/IS911 family protein  50.94 
 
 
125 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0183  IS3/IS911 family transposase  41.11 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1225  IS3/IS911 family transposase  42.5 
 
 
123 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.54899  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6197  transposase IS3/IS911 family protein  37.31 
 
 
128 aa  57  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.578613  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  39.02 
 
 
122 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  39.02 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  39.02 
 
 
122 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  40.24 
 
 
121 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0367  transposase  40.24 
 
 
121 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1454  transposase  40.24 
 
 
121 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1537  transposase  40.24 
 
 
121 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2585  transposase  40.24 
 
 
121 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.238572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2745  transposase  40.24 
 
 
121 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2606  transposase IS3/IS911 family protein  41.18 
 
 
133 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1791  transposase IS3/IS911 family protein  40.24 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0566  ISRSO10-transposase ORFA protein  40.24 
 
 
122 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1729  transposase  35.16 
 
 
164 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6413  transposase IS3/IS911 family protein  48.15 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0686  transposase  27.4 
 
 
150 aa  54.7  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7043  transposase  27.4 
 
 
150 aa  54.7  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.443559  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4167  IS3 family transposase  33.59 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0827165  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3409  hypothetical protein  27.4 
 
 
150 aa  54.7  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0558  IS66 family Orf1  38.46 
 
 
155 aa  54.7  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.412766  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1992  transposase IS3/IS911  35.29 
 
 
133 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.135346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2557  transposase IS3/IS911  35.29 
 
 
133 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.221495 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5463  transposase IS3/IS911 family protein  60.47 
 
 
128 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0524  IS66 family orf1 transposase  38.46 
 
 
155 aa  54.7  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4815  transposase IS3/IS911 family protein  31.94 
 
 
135 aa  54.3  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.290342 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0054  transposase IS3/IS911  44.64 
 
 
135 aa  52.8  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000565593  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0169  transposase IS3/IS911  44.64 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2025  transposase IS3/IS911  46.43 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2173  transposase IS3/IS911  44.64 
 
 
135 aa  52.8  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4688  transposase IS3/IS911 family protein  35.23 
 
 
152 aa  52.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.426446  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8376  transposase IS3/IS911 family protein  31.34 
 
 
136 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1624  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
123 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6122  transposase IS3/IS911 family protein  62.79 
 
 
86 aa  52.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6488  transposase IS3/IS911 family protein  28.57 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6511  transposase IS3/IS911 family protein  28.57 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0972019 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2742  transposase IS3/IS911 family protein  35.23 
 
 
152 aa  52.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4326  transposase IS3/IS911 family protein  35.23 
 
 
152 aa  52.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9097  TRm1a transposase  26.71 
 
 
162 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2406  transposase IS3/IS911  46.43 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244335  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0648  transposase IS3/IS911  39.76 
 
 
151 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5386  transposase IS3/IS911 family protein  25.44 
 
 
115 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.946691 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0663  transposase IS3/IS911 family protein  41.67 
 
 
128 aa  51.6  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2997  transposase IS3/IS911  35.48 
 
 
135 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294595  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0257  putative transposase  32.23 
 
 
145 aa  50.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0626977 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0397  transposase IS3/IS911  35.71 
 
 
119 aa  50.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.541296  normal  0.262239 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4023  transposase IS3/IS911 family protein  35.51 
 
 
125 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8374  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6320  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7466  transposase IS3/IS911 family protein  36.59 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4339  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5080  transposase IS3/IS911 family protein  27.68 
 
 
129 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5516  transposase IS3/IS911 family protein  38.96 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6338  transposase IS3/IS911 family protein  29.47 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.202859 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6366  transposase IS3/IS911 family protein  38.96 
 
 
160 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1220  transposase IS3/IS911 family protein  38.96 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  0.0481139 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2724  transposase IS3/IS911 family protein  54.55 
 
 
129 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.8231  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4642  transposase IS3/IS911 family protein  39.29 
 
 
129 aa  48.9  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.882945  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2291  transposase IS3/IS911 family protein  34.07 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112265  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8238  transposase  25.78 
 
 
120 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0433  transposase IS3/IS911 family protein  31.01 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0349226 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0917  transposase IS3/IS911 family protein  31.01 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.308887  normal  0.246469 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1415  transposase IS3/IS911 family protein  31.01 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1417  transposase IS3/IS911 family protein  31.01 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1807  transposase IS3/IS911 family protein  31.01 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301512  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3518  hypothetical protein  31.01 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.734603 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3717  hypothetical protein  31.01 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3720  hypothetical protein  31.01 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3761  hypothetical protein  31.01 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4303  hypothetical protein  31.01 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4310  hypothetical protein  31.01 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4619  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
152 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44110  Transposase IS3/IS911  50 
 
 
68 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3761  putative transposase  37.8 
 
 
135 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4780  transposase IS3/IS911 family protein  45.31 
 
 
128 aa  47.4  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248666  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0570  transposase IS3/IS911 family protein  47.73 
 
 
150 aa  47  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0784738 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2457  transposase IS3/IS911 family protein  47.73 
 
 
150 aa  47  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.528659  normal  0.919358 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2918  transposase IS3/IS911 family protein  47.73 
 
 
150 aa  47  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.384593  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0741  transposase IS3/IS911 family protein  41.07 
 
 
131 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.93863 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5410  transposase IS3/IS911 family protein  38.6 
 
 
113 aa  47  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.650569 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4142  hypothetical protein  41.07 
 
 
131 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4392  transposase IS3/IS911 family protein  41.07 
 
 
131 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0006  insertion sequence 2 OrfA protein  31.37 
 
 
121 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0401  insertion sequence 2 OrfA protein  30.48 
 
 
136 aa  47  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1670  insertion sequence 2 OrfA protein  30.48 
 
 
136 aa  47  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.724698 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>