62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2997 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2997  transposase IS3/IS911  100 
 
 		 135 aa  265  1e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294595  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8376  transposase IS3/IS911 family protein  51.22 
 
 		 136 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1582  hypothetical protein  42.24 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.447037 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4110  hypothetical protein  37.19 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4399  transposase IS3/IS911 family protein  37.93 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134241  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3698  hypothetical protein  37.93 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.451428 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1804  transposase IS3/IS911 family protein  37.93 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5080  transposase IS3/IS911 family protein  34.21 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6363  putative transposase  37.1 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0611  putative transposase  37.1 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4619  transposase IS3/IS911 family protein  40.35 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4815  transposase IS3/IS911 family protein  36.92 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.290342 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1472  transposase IS3/IS911 family protein  51.61 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4820  transposase IS3/IS911 family protein  37.21 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187465 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4596  transposase IS3/IS911 family protein  42.39 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.699862 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3198  transposase IS3/IS911 family protein  56.25 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4930  hypothetical protein  50 
 
 		 79 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.527295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5516  transposase IS3/IS911 family protein  35.25 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6366  transposase IS3/IS911 family protein  35.83 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1220  transposase IS3/IS911 family protein  35.25 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  0.0481139 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4907  transposase IS3/IS911 family protein  35.48 
 
 		 136 aa  50.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8374  transposase IS3/IS911 family protein  50.85 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4339  transposase IS3/IS911 family protein  50.85 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6320  transposase IS3/IS911 family protein  50.85 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4326  transposase IS3/IS911 family protein  36.61 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2742  transposase IS3/IS911 family protein  36.61 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4688  transposase IS3/IS911 family protein  36.61 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.426446  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1112  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3008  transposase IS3/IS911  47.17 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0648  transposase IS3/IS911  46.03 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4642  transposase IS3/IS911 family protein  51.11 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.882945  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4167  IS3 family transposase  32.28 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0827165  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3012  transposase  35.92 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930008  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44110  Transposase IS3/IS911  43.64 
 
 		 68 aa  45.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  37.5 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  37.8 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  37.8 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4392  transposase IS3/IS911 family protein  46 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4142  hypothetical protein  46 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0741  transposase IS3/IS911 family protein  46 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.93863 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0566  ISRSO10-transposase ORFA protein  42.86 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  43.48 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0367  transposase  43.48 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1454  transposase  43.48 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2745  transposase  43.48 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2585  transposase  43.48 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.238572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1537  transposase  43.48 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0524  IS66 family orf1 transposase  31.97 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0558  IS66 family Orf1  31.97 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.412766  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6413  transposase IS3/IS911 family protein  51.16 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0397  transposase IS3/IS911  31.58 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.541296  normal  0.262239 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4024  hypothetical protein  34.78 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25470  transposase IS3/IS911  52.38 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0935  transposase IS3/IS911 family protein  35.4 
 
 		 149 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.089943  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3504  hypothetical protein  35.4 
 
 		 149 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138745  normal  0.543824 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0183  IS3/IS911 family transposase  32 
 
 		 140 aa  41.6  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0779  hypothetical protein  64.52 
 
 		 74 aa  41.6  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0663  transposase IS3/IS911 family protein  33.9 
 
 		 128 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5410  transposase IS3/IS911 family protein  34.51 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.650569 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4915  transposase IS3/IS911 family protein  30.58 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.269908 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1518  transposase IS3/IS911 family protein  41.86 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0139  transposase IS3/IS911  50 
 
 		 109 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>