62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_25470 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_25470  transposase IS3/IS911  100 
 
 
63 aa  125  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44110  Transposase IS3/IS911  87.23 
 
 
68 aa  81.3  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2335  remnant of ISRSO10-transposase protein  62.75 
 
 
51 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  72.5 
 
 
122 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  72.5 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  72.5 
 
 
122 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0566  ISRSO10-transposase ORFA protein  70 
 
 
122 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  70 
 
 
121 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2745  transposase  70 
 
 
121 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2585  transposase  70 
 
 
121 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.238572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1537  transposase  70 
 
 
121 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1454  transposase  70 
 
 
121 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0367  transposase  70 
 
 
121 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1791  transposase IS3/IS911 family protein  65 
 
 
121 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2169  transposase  57.69 
 
 
154 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.114608  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0779  hypothetical protein  56.25 
 
 
74 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2557  transposase IS3/IS911  53.85 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.221495 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1992  transposase IS3/IS911  53.85 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.135346 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4642  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.882945  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2606  transposase IS3/IS911 family protein  55.77 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1887  insertion sequence 2 OrfA protein  47.62 
 
 
136 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00245938 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0108  insertion sequence 2 OrfA protein  47.62 
 
 
136 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0157365  hitchhiker  0.00244119 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0401  insertion sequence 2 OrfA protein  47.62 
 
 
136 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1086  insertion sequence 2 OrfA protein  47.62 
 
 
136 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.612076  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1207  insertion sequence 2 OrfA protein  47.62 
 
 
136 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4197  normal  0.231836 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1670  insertion sequence 2 OrfA protein  47.62 
 
 
136 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.724698 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3761  putative transposase  66.67 
 
 
135 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0611  putative transposase  56.1 
 
 
133 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6363  putative transposase  56.1 
 
 
133 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3224  insertion sequence 2 OrfA protein  51.28 
 
 
121 aa  43.9  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2197  insertion sequence 2 OrfA protein  51.28 
 
 
121 aa  43.9  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000281528  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0829  transposase IS3/IS911 family protein  51.28 
 
 
121 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0395  insertion sequence 2 OrfA protein  51.28 
 
 
121 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.867286  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0041  insertion sequence 2 OrfA protein  51.28 
 
 
121 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.64652  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0033  insertion sequence 2 OrfA protein  51.28 
 
 
121 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0075  insertion sequence 2 OrfA protein  51.28 
 
 
121 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3164  insertion sequence 2 OrfA protein  51.28 
 
 
121 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.703755  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0656  transposase IS3/IS911 family protein  51.28 
 
 
121 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1660  transposase IS3/IS911 family protein  51.28 
 
 
121 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2242  transposase IS3/IS911 family protein  51.28 
 
 
121 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.89134  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3246  transposase IS3/IS911 family protein  51.28 
 
 
121 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3726  transposase IS3/IS911 family protein  51.28 
 
 
121 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4820  transposase IS3/IS911 family protein  60 
 
 
168 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.187465 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0006  insertion sequence 2 OrfA protein  51.28 
 
 
121 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6413  transposase IS3/IS911 family protein  58.54 
 
 
139 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4024  hypothetical protein  57.5 
 
 
107 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6488  transposase IS3/IS911 family protein  52.5 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0054  transposase IS3/IS911  59.52 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000565593  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0169  transposase IS3/IS911  59.52 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2173  transposase IS3/IS911  59.52 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6511  transposase IS3/IS911 family protein  52.5 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0972019 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2406  transposase IS3/IS911  57.14 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244335  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2997  transposase IS3/IS911  52.38 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294595  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2025  transposase IS3/IS911  57.14 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0558  IS66 family Orf1  50 
 
 
155 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.412766  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0524  IS66 family orf1 transposase  50 
 
 
155 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3008  transposase IS3/IS911  52.27 
 
 
154 aa  40.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0741  transposase IS3/IS911 family protein  59.38 
 
 
131 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.93863 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4142  hypothetical protein  59.38 
 
 
131 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4392  transposase IS3/IS911 family protein  59.38 
 
 
131 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4815  transposase IS3/IS911 family protein  60.61 
 
 
135 aa  40.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.290342 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3182  transposase IS3/IS911 family protein  57.5 
 
 
125 aa  40  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>