136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3012 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3012  transposase  100 
 
 		 136 aa  266  7e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930008  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0935  transposase IS3/IS911 family protein  78.68 
 
 		 149 aa  210  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.089943  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3504  hypothetical protein  78.68 
 
 		 149 aa  210  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138745  normal  0.543824 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4029  hypothetical protein  76.7 
 
 		 102 aa  147  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.64412 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4178  putative transposase, ISRm14  74.76 
 
 		 102 aa  144  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9620  hypothetical protein  56.25 
 
 		 150 aa  133  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.754847  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4167  IS3 family transposase  46.85 
 
 		 140 aa  87.8  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0827165  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0433  transposase IS3/IS911 family protein  45.95 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0349226 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0917  transposase IS3/IS911 family protein  45.95 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.308887  normal  0.246469 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1415  transposase IS3/IS911 family protein  45.95 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1417  transposase IS3/IS911 family protein  45.95 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1807  transposase IS3/IS911 family protein  45.95 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3518  hypothetical protein  45.95 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.734603 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3717  hypothetical protein  45.95 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3720  hypothetical protein  45.95 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3761  hypothetical protein  45.95 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4303  hypothetical protein  45.95 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4310  hypothetical protein  45.95 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4652  transposase IS3/IS911 family protein  47.83 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.110926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3726  hypothetical protein  40.68 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.890145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3206  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  79.17 
 
 		 554 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.662551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4875  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.64301  normal  0.539748 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6366  transposase IS3/IS911 family protein  39.1 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5516  transposase IS3/IS911 family protein  39.1 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1220  transposase IS3/IS911 family protein  39.1 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  0.0481139 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0183  IS3/IS911 family transposase  44.55 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1225  IS3/IS911 family transposase  46.74 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.54899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4596  transposase IS3/IS911 family protein  46.84 
 
 		 146 aa  67  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.699862 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4619  transposase IS3/IS911 family protein  39.1 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2742  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4326  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4688  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.426446  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6460  transposase IS3/IS911 family protein  35.9 
 
 		 176 aa  60.5  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.556682 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3309  transposase IS3/IS911 family protein  38.39 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.437547 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6197  transposase IS3/IS911 family protein  34.17 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.578613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1112  transposase IS3/IS911 family protein  31.11 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0072  IS66 family element, orf1  31.93 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202563  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0019  hypothetical protein  31.93 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0226  IS66 family element, orf1  31.93 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0195  IS66 family element, orf1  31.93 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0144  IS66 family element, orf1  31.93 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.642742  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0021  IS66 family orf1  31.93 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0040  IS66 family orf1  31.93 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0070  IS66 family element  31.93 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0817  IS66 family orf1  31.93 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.442103  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1405  IS66 family orf1  31.93 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1762  IS66 family orf1  31.93 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2931  IS66 family orf1  31.93 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3345  IS66 family orf1  31.93 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3386  IS66 family orf1  31.93 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4862  IS66 family orf1  31.93 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3008  transposase IS3/IS911  34.68 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0116  IS66 family element, orf1  31.93 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837926  normal  0.82716 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6443  transposase IS3/IS911 family protein  36.7 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000408557 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8374  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6320  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4339  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2724  transposase IS3/IS911 family protein  32.2 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.8231  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0611  putative transposase  34.58 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6363  putative transposase  34.58 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1472  transposase IS3/IS911 family protein  31.06 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0648  transposase IS3/IS911  48.57 
 
 		 151 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2291  hypothetical protein  37.07 
 
 		 166 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8238  transposase  27.56 
 
 		 120 aa  50.4  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3198  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4110  hypothetical protein  35.4 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4974  transposase IS3/IS911  27.34 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000160707  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3776  putative transposase  28.8 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.981228 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0558  IS66 family Orf1  28.8 
 
 		 155 aa  47.4  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.412766  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0524  IS66 family orf1 transposase  28.8 
 
 		 155 aa  47.4  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2997  transposase IS3/IS911  35.92 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294595  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4024  hypothetical protein  38.24 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5410  transposase IS3/IS911 family protein  38.24 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.650569 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2589  putative IS3 transposase, TnpA  30.48 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.789608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4987  putative insertion sequence transposase protein  35.64 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6488  transposase IS3/IS911 family protein  29.01 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6511  transposase IS3/IS911 family protein  29.01 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0972019 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2252  transposase IS3/IS911 family protein  30.58 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367013  normal  0.015617 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5013  transposase IS3/IS911 family protein  31.4 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1804  transposase IS3/IS911 family protein  33.61 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3698  hypothetical protein  33.61 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.451428 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4399  transposase IS3/IS911 family protein  33.61 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134241  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0139  transposase IS3/IS911  35.06 
 
 		 109 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7043  transposase  26.98 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.443559  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3409  hypothetical protein  26.98 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0686  transposase  26.98 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6523  transposase IS3/IS911 family protein  30.95 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0816552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0276  transposase IS3/IS911 family protein  31.93 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1931  transposase  47.62 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.575693  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4855  transposase IS3/IS911  47.62 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3311  transposase IS3/IS911 family protein  47.62 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6834  transposase IS3/IS911 family protein  47.62 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9097  TRm1a transposase  26.98 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5563  transposase IS3/IS911 family protein  47.62 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.121852 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5095  transposase IS3/IS911 family protein  47.62 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5054  transposase IS3/IS911 family protein  47.62 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.880446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0900  transposase IS3/IS911 family protein  31.52 
 
 		 124 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.825197  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2730  transposase IS3/IS911 family protein  31.52 
 
 		 124 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.777363  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4786  transposase IS3/IS911 family protein  31.52 
 
 		 124 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1759  IS66 family orf1  28.57 
 
 		 154 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0153795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>