28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4178 on replicon NC_007490
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007490  RSP_4178  putative transposase, ISRm14  100 
 
 		 102 aa  191  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4029  hypothetical protein  94.06 
 
 		 102 aa  180  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.64412 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0935  transposase IS3/IS911 family protein  91.09 
 
 		 149 aa  175  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.089943  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3504  hypothetical protein  91.09 
 
 		 149 aa  175  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138745  normal  0.543824 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3012  transposase  74.76 
 
 		 136 aa  144  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930008  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9620  hypothetical protein  50 
 
 		 150 aa  95.9  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.754847  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3206  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  81.25 
 
 		 554 aa  82  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.662551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3717  hypothetical protein  42 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4310  hypothetical protein  42 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4303  hypothetical protein  42 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3761  hypothetical protein  42 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3720  hypothetical protein  42 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3518  hypothetical protein  42 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.734603 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1807  transposase IS3/IS911 family protein  42 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1417  transposase IS3/IS911 family protein  42 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1415  transposase IS3/IS911 family protein  42 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0917  transposase IS3/IS911 family protein  42 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.308887  normal  0.246469 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0433  transposase IS3/IS911 family protein  42 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0349226 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4167  IS3 family transposase  43.56 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0827165  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3726  hypothetical protein  41.86 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.890145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4875  transposase IS3/IS911 family protein  39.29 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.64301  normal  0.539748 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4652  transposase IS3/IS911 family protein  45 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.110926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4596  transposase IS3/IS911 family protein  42.37 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.699862 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3309  transposase IS3/IS911 family protein  36.27 
 
 		 110 aa  44.3  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.437547 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0183  IS3/IS911 family transposase  39.74 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1225  IS3/IS911 family transposase  38.46 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.54899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2724  transposase IS3/IS911 family protein  31.13 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.8231  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3776  putative transposase  40.32 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.981228 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>