More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5080 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_5080  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 129 aa  261  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0397  transposase IS3/IS911  55.65 
 
 		 119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.541296  normal  0.262239 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5386  transposase IS3/IS911 family protein  51.22 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.946691 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4596  transposase IS3/IS911 family protein  36.69 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.699862 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4915  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.269908 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0786  transposase IS3/IS911 family protein  41.54 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6488  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6511  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0972019 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4339  transposase IS3/IS911 family protein  33.08 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8374  transposase IS3/IS911 family protein  33.08 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6320  transposase IS3/IS911 family protein  33.08 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4024  hypothetical protein  50.82 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0566  ISRSO10-transposase ORFA protein  37.66 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  37.66 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  37.66 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  37.66 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5410  transposase IS3/IS911 family protein  34.19 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.650569 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0611  putative transposase  38.89 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6363  putative transposase  38.89 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8238  transposase  50 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0648  transposase IS3/IS911  39.47 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3761  putative transposase  38.96 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0558  IS66 family Orf1  31.4 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.412766  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4642  transposase IS3/IS911 family protein  31.65 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.882945  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2997  transposase IS3/IS911  34.21 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294595  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0524  IS66 family orf1 transposase  31.4 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  32.47 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0367  transposase  32.47 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1454  transposase  32.47 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1537  transposase  32.47 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2585  transposase  32.47 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.238572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2745  transposase  32.47 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1472  transposase IS3/IS911 family protein  33.59 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0900  transposase IS3/IS911 family protein  34.09 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.825197  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1992  transposase IS3/IS911  37.66 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.135346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2557  transposase IS3/IS911  37.66 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221495 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4786  transposase IS3/IS911 family protein  34.09 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1791  transposase IS3/IS911 family protein  32.47 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2730  transposase IS3/IS911 family protein  34.09 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.777363  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2606  transposase IS3/IS911 family protein  37.66 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3008  transposase IS3/IS911  39.66 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8376  transposase IS3/IS911 family protein  32.52 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1965  transposase IS3/IS911  36.71 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0183  IS3/IS911 family transposase  36 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0656  transposase IS3/IS911 family protein  34.33 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0829  transposase IS3/IS911 family protein  34.33 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1660  transposase IS3/IS911 family protein  34.33 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2242  transposase IS3/IS911 family protein  34.33 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.89134  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3246  transposase IS3/IS911 family protein  34.33 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3726  transposase IS3/IS911 family protein  34.33 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0075  insertion sequence 2 OrfA protein  34.33 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2724  transposase IS3/IS911 family protein  37.88 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.8231  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1887  insertion sequence 2 OrfA protein  34.33 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245938 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0401  insertion sequence 2 OrfA protein  34.33 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3224  insertion sequence 2 OrfA protein  34.33 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0033  insertion sequence 2 OrfA protein  34.33 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3164  insertion sequence 2 OrfA protein  34.33 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.703755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6413  transposase IS3/IS911 family protein  37.04 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2197  insertion sequence 2 OrfA protein  34.33 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000281528  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0041  insertion sequence 2 OrfA protein  34.33 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.64652  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4707  transposase IS3/IS911 family protein  34.95 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.15139  normal  0.0855064 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1670  insertion sequence 2 OrfA protein  34.33 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.724698 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0395  insertion sequence 2 OrfA protein  34.33 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.867286  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0006  insertion sequence 2 OrfA protein  34.33 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4820  transposase IS3/IS911 family protein  30.83 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187465 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1207  insertion sequence 2 OrfA protein  34.33 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4197  normal  0.231836 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1086  insertion sequence 2 OrfA protein  34.33 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.612076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0108  insertion sequence 2 OrfA protein  34.33 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0157365  hitchhiker  0.00244119 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6366  transposase IS3/IS911 family protein  29.55 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4167  IS3 family transposase  37.93 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0827165  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5516  transposase IS3/IS911 family protein  29.55 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1220  transposase IS3/IS911 family protein  29.55 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  0.0481139 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1415  transposase IS3/IS911 family protein  37.93 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1807  transposase IS3/IS911 family protein  37.93 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1417  transposase IS3/IS911 family protein  37.93 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3720  hypothetical protein  37.93 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3717  hypothetical protein  37.93 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3761  hypothetical protein  37.93 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3518  hypothetical protein  37.93 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.734603 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0917  transposase IS3/IS911 family protein  37.93 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.308887  normal  0.246469 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4310  hypothetical protein  37.93 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4303  hypothetical protein  37.93 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1112  transposase IS3/IS911 family protein  37.29 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0433  transposase IS3/IS911 family protein  37.93 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0349226 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1518  transposase IS3/IS911 family protein  45 
 
 		 95 aa  51.6  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3182  transposase IS3/IS911 family protein  37.29 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0054  transposase IS3/IS911  36.67 
 
 		 135 aa  50.8  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000565593  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2173  transposase IS3/IS911  36.67 
 
 		 135 aa  50.8  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1225  IS3/IS911 family transposase  35.65 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.54899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2169  transposase  37.1 
 
 		 154 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.114608  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0169  transposase IS3/IS911  36.67 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2025  transposase IS3/IS911  36.67 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2406  transposase IS3/IS911  36.67 
 
 		 141 aa  50.4  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244335  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3339  transposase IS3/IS911 family protein  36.54 
 
 		 170 aa  50.4  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3504  hypothetical protein  31.43 
 
 		 149 aa  50.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138745  normal  0.543824 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0935  transposase IS3/IS911 family protein  31.43 
 
 		 149 aa  50.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.089943  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3726  hypothetical protein  38.1 
 
 		 133 aa  50.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.890145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4721  transposase  30.67 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3124  IS66 family transposase orfA  26.51 
 
 		 225 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0003  IS66 family orf1  26.51 
 
 		 225 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.930174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>