30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3339 on replicon NC_009468
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009468  Acry_3339  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
170 aa  337  4e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0786  transposase IS3/IS911 family protein  94.23 
 
 
131 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5080  transposase IS3/IS911 family protein  36.54 
 
 
129 aa  50.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0183  IS3/IS911 family transposase  41 
 
 
140 aa  47.4  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1225  IS3/IS911 family transposase  41 
 
 
123 aa  47.8  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.54899  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0900  transposase IS3/IS911 family protein  44.68 
 
 
124 aa  47.4  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.825197  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2730  transposase IS3/IS911 family protein  44.68 
 
 
124 aa  47.4  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.777363  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4786  transposase IS3/IS911 family protein  44.68 
 
 
124 aa  47.4  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5410  transposase IS3/IS911 family protein  36.28 
 
 
113 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.650569 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0726  transposase IS3/IS911 family protein  31.25 
 
 
122 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113703  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8238  transposase  42.11 
 
 
120 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8374  transposase IS3/IS911 family protein  33.03 
 
 
143 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0709  transposase IS3/IS911 family protein  36.54 
 
 
124 aa  44.7  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.668336  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4339  transposase IS3/IS911 family protein  33.03 
 
 
143 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6320  transposase IS3/IS911 family protein  33.03 
 
 
143 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0034  transposase  32.69 
 
 
111 aa  44.3  0.0009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5013  transposase IS3/IS911 family protein  34.02 
 
 
131 aa  43.9  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3761  putative transposase  45.24 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1759  IS66 family orf1  31.73 
 
 
154 aa  42.4  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0153795  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4029  hypothetical protein  41.94 
 
 
102 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.64412 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1112  transposase IS3/IS911 family protein  46.94 
 
 
149 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4024  hypothetical protein  40.38 
 
 
107 aa  42  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1472  transposase IS3/IS911 family protein  35.16 
 
 
139 aa  41.6  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4881  IS66 family orf1  32.35 
 
 
225 aa  41.6  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3366  IS66 family orf1  32.35 
 
 
225 aa  41.6  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.451568  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0045  IS66 family orf1  32.35 
 
 
225 aa  41.6  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.88778  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0003  IS66 family orf1  32.35 
 
 
225 aa  41.6  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.930174  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0065  IS66 family orf1  32.35 
 
 
225 aa  41.6  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.22402  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4596  transposase IS3/IS911 family protein  35.71 
 
 
146 aa  42  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.699862 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3124  IS66 family transposase orfA  31.73 
 
 
225 aa  41.6  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>