156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6122 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_6122  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 86 aa  166  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5463  transposase IS3/IS911 family protein  86.89 
 
 		 128 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4780  transposase IS3/IS911 family protein  69.84 
 
 		 128 aa  87.8  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1624  transposase IS3/IS911 family protein  65.52 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0183  IS3/IS911 family transposase  57.78 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1225  IS3/IS911 family transposase  57.78 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.54899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2606  transposase IS3/IS911 family protein  47.76 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3008  transposase IS3/IS911  56.6 
 
 		 154 aa  53.5  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2724  transposase IS3/IS911 family protein  54.72 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.8231  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4907  transposase IS3/IS911 family protein  62.79 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6197  transposase IS3/IS911 family protein  50.88 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.578613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  54.76 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0367  transposase  54.76 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1454  transposase  54.76 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1537  transposase  54.76 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2585  transposase  54.76 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.238572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2745  transposase  54.76 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0648  transposase IS3/IS911  57.78 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1992  transposase IS3/IS911  46.27 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.135346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2557  transposase IS3/IS911  46.27 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221495 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1791  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0611  putative transposase  54.35 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6363  putative transposase  54.35 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5013  transposase IS3/IS911 family protein  44.78 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4596  transposase IS3/IS911 family protein  55.56 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.699862 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44110  Transposase IS3/IS911  44.83 
 
 		 68 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9620  hypothetical protein  48.98 
 
 		 150 aa  50.4  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.754847  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6460  transposase IS3/IS911 family protein  49.09 
 
 		 176 aa  50.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.556682 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4842  transposase IS3/IS911 family protein  52.94 
 
 		 131 aa  50.4  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.926413  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0663  transposase IS3/IS911 family protein  55.56 
 
 		 128 aa  50.4  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3309  transposase IS3/IS911 family protein  57.89 
 
 		 110 aa  50.4  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.437547 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2252  transposase IS3/IS911 family protein  52.94 
 
 		 131 aa  50.4  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367013  normal  0.015617 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  46.3 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  50 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  46.3 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0566  ISRSO10-transposase ORFA protein  41.79 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8374  transposase IS3/IS911 family protein  52.73 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6320  transposase IS3/IS911 family protein  52.73 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4875  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.64301  normal  0.539748 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0935  transposase IS3/IS911 family protein  54.55 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.089943  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3504  hypothetical protein  54.55 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138745  normal  0.543824 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1112  transposase IS3/IS911 family protein  53.33 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4339  transposase IS3/IS911 family protein  52.73 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6366  transposase IS3/IS911 family protein  43.48 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6413  transposase IS3/IS911 family protein  52.27 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5516  transposase IS3/IS911 family protein  48.94 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1220  transposase IS3/IS911 family protein  48.94 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  0.0481139 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6488  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 		 127 aa  47.4  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6511  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 		 127 aa  47.4  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0972019 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4619  transposase IS3/IS911 family protein  45.61 
 
 		 152 aa  47.4  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4652  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.110926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2742  transposase IS3/IS911 family protein  45.61 
 
 		 152 aa  47.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4326  transposase IS3/IS911 family protein  45.61 
 
 		 152 aa  47.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4688  transposase IS3/IS911 family protein  45.61 
 
 		 152 aa  47.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.426446  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0995  transposase IS3/IS911  42.22 
 
 		 99 aa  47  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0054  transposase IS3/IS911  43.28 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000565593  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2173  transposase IS3/IS911  43.28 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0139  transposase IS3/IS911  50 
 
 		 109 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4642  transposase IS3/IS911 family protein  45.24 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.882945  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0169  transposase IS3/IS911  54.76 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2406  transposase IS3/IS911  41.79 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244335  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5080  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0558  IS66 family Orf1  37.5 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.412766  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2025  transposase IS3/IS911  52.38 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1931  transposase  45.45 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.575693  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5456  transposase DNA binding site ISRme11  42.86 
 
 		 90 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0552744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5496  transposase DNA binding site ISRme11  42.86 
 
 		 90 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0524  IS66 family orf1 transposase  37.5 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5054  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 133 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.880446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1785  transposase IS3/IS911 family protein  37.7 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.496155 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0891  transposase IS3/IS911 family protein  36.07 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5095  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 133 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5563  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 133 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.121852 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4855  transposase IS3/IS911  45.45 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3311  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6834  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 133 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4708  transposase IS3/IS911 family protein  36.07 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8238  transposase  43.4 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4987  putative insertion sequence transposase protein  46.51 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4424  transposase IS3/IS911 family protein  36.07 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0276  transposase IS3/IS911 family protein  39.66 
 
 		 126 aa  44.7  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4167  IS3 family transposase  45.1 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0827165  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0433  transposase IS3/IS911 family protein  45.1 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0349226 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0917  transposase IS3/IS911 family protein  45.1 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.308887  normal  0.246469 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1415  transposase IS3/IS911 family protein  45.1 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1417  transposase IS3/IS911 family protein  45.1 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1807  transposase IS3/IS911 family protein  45.1 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3518  hypothetical protein  45.1 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.734603 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3717  hypothetical protein  45.1 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3720  hypothetical protein  45.1 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3761  hypothetical protein  45.1 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4303  hypothetical protein  45.1 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4310  hypothetical protein  45.1 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2589  putative IS3 transposase, TnpA  43.18 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.789608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3182  transposase IS3/IS911 family protein  52.27 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3665  transposase IS3/IS911 family protein  43.75 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0598755  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3726  hypothetical protein  46.67 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.890145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1539  transposase  36.07 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0203174  normal  0.231759 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4815  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.290342 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4820  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 168 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187465 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>