66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4252 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4252  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
85 aa  175  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224337 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  80.26 
 
 
122 aa  123  9e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  80.26 
 
 
122 aa  123  9e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  80.26 
 
 
121 aa  123  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1454  transposase  78.95 
 
 
121 aa  121  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0367  transposase  78.95 
 
 
121 aa  121  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  78.95 
 
 
121 aa  121  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1537  transposase  78.95 
 
 
121 aa  121  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2332  ISRSO10-transposase ORFA protein  80.82 
 
 
88 aa  121  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.162166 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2585  transposase  78.95 
 
 
121 aa  121  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.238572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2745  transposase  78.95 
 
 
121 aa  121  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1931  transposase  76.32 
 
 
133 aa  120  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.575693  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6834  transposase IS3/IS911 family protein  76.32 
 
 
133 aa  120  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5054  transposase IS3/IS911 family protein  76.32 
 
 
133 aa  120  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.880446  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5095  transposase IS3/IS911 family protein  76.32 
 
 
133 aa  120  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5563  transposase IS3/IS911 family protein  76.32 
 
 
133 aa  120  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.121852 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4855  transposase IS3/IS911  76.32 
 
 
133 aa  120  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3311  transposase IS3/IS911 family protein  76.32 
 
 
133 aa  120  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1992  transposase IS3/IS911  76.32 
 
 
133 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.135346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2557  transposase IS3/IS911  76.32 
 
 
133 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.221495 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2606  transposase IS3/IS911 family protein  76.32 
 
 
133 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0566  ISRSO10-transposase ORFA protein  77.63 
 
 
122 aa  117  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0401  insertion sequence 2 OrfA protein  75 
 
 
136 aa  114  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1086  insertion sequence 2 OrfA protein  75 
 
 
136 aa  114  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.612076  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1207  insertion sequence 2 OrfA protein  75 
 
 
136 aa  114  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4197  normal  0.231836 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1670  insertion sequence 2 OrfA protein  75 
 
 
136 aa  114  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.724698 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1887  insertion sequence 2 OrfA protein  75 
 
 
136 aa  114  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00245938 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0108  insertion sequence 2 OrfA protein  75 
 
 
136 aa  114  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0157365  hitchhiker  0.00244119 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0006  insertion sequence 2 OrfA protein  75 
 
 
121 aa  114  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0395  insertion sequence 2 OrfA protein  75 
 
 
121 aa  113  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.867286  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0041  insertion sequence 2 OrfA protein  75 
 
 
121 aa  113  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.64652  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3164  insertion sequence 2 OrfA protein  75 
 
 
121 aa  113  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.703755  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2197  insertion sequence 2 OrfA protein  75 
 
 
121 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000281528  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3224  insertion sequence 2 OrfA protein  75 
 
 
121 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0829  transposase IS3/IS911 family protein  75 
 
 
121 aa  113  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0033  insertion sequence 2 OrfA protein  75 
 
 
121 aa  113  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0075  insertion sequence 2 OrfA protein  75 
 
 
121 aa  113  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0656  transposase IS3/IS911 family protein  75 
 
 
121 aa  113  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1660  transposase IS3/IS911 family protein  75 
 
 
121 aa  113  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3726  transposase IS3/IS911 family protein  75 
 
 
121 aa  113  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2242  transposase IS3/IS911 family protein  75 
 
 
121 aa  113  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.89134  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3246  transposase IS3/IS911 family protein  75 
 
 
121 aa  113  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3761  putative transposase  90.16 
 
 
135 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1791  transposase IS3/IS911 family protein  71.05 
 
 
121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2169  transposase  64 
 
 
154 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.114608  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4721  transposase  63.16 
 
 
122 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2541  transposase IS3/IS911 family protein  58.67 
 
 
101 aa  84.7  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.901832  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3182  transposase IS3/IS911 family protein  51.35 
 
 
125 aa  81.6  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0716  transposase  73.91 
 
 
61 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4642  transposase IS3/IS911 family protein  46.67 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.882945  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2406  transposase IS3/IS911  47.37 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244335  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0169  transposase IS3/IS911  47.37 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2025  transposase IS3/IS911  47.37 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2173  transposase IS3/IS911  46.05 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0054  transposase IS3/IS911  46.05 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000565593  n/a   
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4392  transposase IS3/IS911 family protein  42.67 
 
 
131 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6413  transposase IS3/IS911 family protein  42.11 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0741  transposase IS3/IS911 family protein  42.67 
 
 
131 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.93863 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5766  transposase IS3/IS911 family protein  42.67 
 
 
158 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4142  hypothetical protein  42.67 
 
 
131 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0276  transposase IS3/IS911 family protein  37.14 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2589  putative IS3 transposase, TnpA  48.65 
 
 
142 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.789608  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4974  transposase IS3/IS911  40.68 
 
 
138 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000160707  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3008  transposase IS3/IS911  34.12 
 
 
154 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3776  putative transposase  45.95 
 
 
131 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.981228 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6523  transposase IS3/IS911 family protein  60.71 
 
 
145 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0816552  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>