89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1684 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1684  transposase IS3/IS911  100 
 
 		 201 aa  402  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2062  integrase catalytic subunit  49.48 
 
 		 294 aa  92  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0588444 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0902  integrase catalytic subunit  49.48 
 
 		 294 aa  92  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0647  integrase catalytic subunit  49.48 
 
 		 294 aa  92  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218142 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0293  integrase catalytic subunit  49.48 
 
 		 294 aa  92  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0390  integrase catalytic subunit  49.48 
 
 		 294 aa  92  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.50729  normal  0.30178 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2063  transposase IS3/IS911  37.89 
 
 		 113 aa  64.3  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0960401 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0903  transposase IS3/IS911  37.89 
 
 		 113 aa  64.3  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0648  transposase IS3/IS911  37.89 
 
 		 113 aa  64.3  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185599 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0294  transposase IS3/IS911  37.89 
 
 		 113 aa  64.3  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00451426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0389  transposase IS3/IS911  37.89 
 
 		 113 aa  64.3  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.995377  normal  0.39936 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2510  transposase IS3/IS911  39.08 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.728215  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2074  transposase IS3/IS911  39.08 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.279434  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4642  transposase IS3/IS911 family protein  31.4 
 
 		 129 aa  46.6  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.882945  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5315  transposase IS3/IS911 family protein  32.1 
 
 		 99 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.323663 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5574  transposase IS3/IS911 family protein  32.1 
 
 		 99 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1057  transposase IS3/IS911 family protein  36.67 
 
 		 135 aa  45.4  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.905137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1090  transposase IS3/IS911 family protein  36.67 
 
 		 135 aa  45.4  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1480  transposase IS3/IS911 family protein  36.67 
 
 		 135 aa  45.4  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10456 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1364  transposase IS3/IS911 family protein  36.67 
 
 		 135 aa  45.1  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.059427 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0401  insertion sequence 2 OrfA protein  31.76 
 
 		 136 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0108  insertion sequence 2 OrfA protein  31.76 
 
 		 136 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0157365  hitchhiker  0.00244119 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1086  insertion sequence 2 OrfA protein  31.76 
 
 		 136 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.612076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1207  insertion sequence 2 OrfA protein  31.76 
 
 		 136 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4197  normal  0.231836 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1670  insertion sequence 2 OrfA protein  31.76 
 
 		 136 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.724698 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1887  insertion sequence 2 OrfA protein  31.76 
 
 		 136 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245938 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0946  transposase IS3/IS911 family protein  26.53 
 
 		 415 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.365915 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0649  transposase IS3 family protein  25.33 
 
 		 372 aa  43.9  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0898  transposase IS3 protein  25.33 
 
 		 372 aa  43.9  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0936  transposase IS3 family protein  25.33 
 
 		 372 aa  43.9  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.582923  normal  0.33404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1258  transposase IS3 family protein  25.33 
 
 		 372 aa  43.9  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1688  transposase IS3 family protein  25.33 
 
 		 372 aa  43.9  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1719  transposase IS3 family protein  25.33 
 
 		 372 aa  43.9  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.662695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1761  transposase IS3 family protein  25.33 
 
 		 372 aa  43.9  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1768  transposase IS3 family protein  25.33 
 
 		 372 aa  43.9  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2430  transposase IS3 family protein  25.33 
 
 		 372 aa  43.9  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.755967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2654  transposase IS3 family protein  25.33 
 
 		 372 aa  43.9  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683836  normal  0.423018 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0041  insertion sequence 2 OrfA protein  31.76 
 
 		 121 aa  43.9  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.64652  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3164  insertion sequence 2 OrfA protein  31.76 
 
 		 121 aa  43.9  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.703755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0395  insertion sequence 2 OrfA protein  31.76 
 
 		 121 aa  43.9  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.867286  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0829  transposase IS3/IS911 family protein  31.76 
 
 		 121 aa  43.9  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3216  transposase IS3/IS911 family protein  31.87 
 
 		 158 aa  43.5  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3224  insertion sequence 2 OrfA protein  31.76 
 
 		 121 aa  43.9  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2197  insertion sequence 2 OrfA protein  31.76 
 
 		 121 aa  43.9  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000281528  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0033  insertion sequence 2 OrfA protein  31.76 
 
 		 121 aa  43.9  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0075  insertion sequence 2 OrfA protein  31.76 
 
 		 121 aa  43.9  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0006  insertion sequence 2 OrfA protein  31.76 
 
 		 121 aa  43.5  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3726  transposase IS3/IS911 family protein  31.76 
 
 		 121 aa  43.9  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3246  transposase IS3/IS911 family protein  31.76 
 
 		 121 aa  43.9  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2242  transposase IS3/IS911 family protein  31.76 
 
 		 121 aa  43.9  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.89134  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1660  transposase IS3/IS911 family protein  31.76 
 
 		 121 aa  43.9  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0656  transposase IS3/IS911 family protein  31.76 
 
 		 121 aa  43.9  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3182  transposase IS3/IS911 family protein  27.27 
 
 		 125 aa  43.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3491  transposase IS3/IS911 family protein  26.7 
 
 		 370 aa  42.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1392  transposase IS3/IS911 family protein  26.7 
 
 		 370 aa  42.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3513  transposase IS3/IS911 family protein  26.7 
 
 		 370 aa  42.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3517  transposase IS3/IS911 family protein  26.7 
 
 		 370 aa  42.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4211  transposase IS3/IS911 family protein  26.7 
 
 		 370 aa  42.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5979  transposase IS3/IS911 family protein  26.7 
 
 		 370 aa  42.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6345  transposase IS3/IS911 family protein  26.7 
 
 		 370 aa  42.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1182  transposase IS3/IS911 family protein  32.47 
 
 		 103 aa  42.4  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0669235 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3685  transposase IS3/IS911 family protein  34.52 
 
 		 97 aa  42.4  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0532244  normal  0.0505039 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2173  transposase IS3/IS911 family protein  31.87 
 
 		 228 aa  42.4  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3176  transposase IS3/IS911 family protein  31.87 
 
 		 228 aa  42.4  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00365869  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0157  transposase A  33 
 
 		 87 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.913666  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0785  transposase A  33 
 
 		 101 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1725  transposase A  33 
 
 		 101 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.620325  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0961  transposase A  33 
 
 		 101 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.092394  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2848  transposase IS3/IS911 family protein  30 
 
 		 108 aa  41.6  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.389181 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4721  transposase  29.07 
 
 		 122 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2395  transposase IS3/IS911 family protein  30 
 
 		 108 aa  41.6  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2271  transposase IS3/IS911 family protein  30 
 
 		 108 aa  41.6  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3885  transposase A  33 
 
 		 96 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3882  transposase A  33 
 
 		 96 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3813  transposase A  33 
 
 		 96 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.633568  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2708  transposase A  33 
 
 		 96 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406372  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1550  transposase A  33 
 
 		 96 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0091  transposase A  33 
 
 		 96 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.582456  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1672  transposase IS3/IS911 family protein  23.23 
 
 		 383 aa  41.6  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0220  transposase IS3/IS911 family protein  29.79 
 
 		 87 aa  41.6  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0384  transposase IS3/IS911 family protein  29.79 
 
 		 87 aa  41.6  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00553388  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1028  transposase IS3/IS911 family protein  29.79 
 
 		 87 aa  41.6  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1489  transposase IS3/IS911 family protein  29.79 
 
 		 87 aa  41.6  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0120593  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3289  transposase IS3/IS911 family protein  29.79 
 
 		 87 aa  41.6  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08100  Transposase  31.96 
 
 		 111 aa  41.6  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.721014 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17080  Transposase  31.96 
 
 		 111 aa  41.6  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22010  Transposase  31.96 
 
 		 111 aa  41.6  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.124801 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1156  transposase IS3/IS911 family protein  31.91 
 
 		 87 aa  41.6  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3050  integrase catalytic subunit  25.24 
 
 		 512 aa  41.2  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.985644 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>