113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2074 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2074  transposase IS3/IS911  100 
 
 		 104 aa  210  5.999999999999999e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.279434  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2510  transposase IS3/IS911  100 
 
 		 104 aa  210  5.999999999999999e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.728215  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0294  transposase IS3/IS911  32.69 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00451426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0389  transposase IS3/IS911  32.69 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.995377  normal  0.39936 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0648  transposase IS3/IS911  32.69 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185599 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0903  transposase IS3/IS911  32.69 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2063  transposase IS3/IS911  32.69 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0960401 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0365  transposase IS3/IS911 family protein  38.24 
 
 		 72 aa  62  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000790877  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1684  transposase IS3/IS911  39.08 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6765  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 		 103 aa  49.7  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2308  transposase IS3/IS911 family protein  29.59 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2311  transposase IS3/IS911 family protein  29.59 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.882739 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0079  transposase IS3/IS911 family protein  29.59 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0278085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0649  transposase IS3 family protein  32.99 
 
 		 372 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0898  transposase IS3 protein  32.99 
 
 		 372 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0936  transposase IS3 family protein  32.99 
 
 		 372 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.582923  normal  0.33404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1258  transposase IS3 family protein  32.99 
 
 		 372 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1688  transposase IS3 family protein  32.99 
 
 		 372 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1719  transposase IS3 family protein  32.99 
 
 		 372 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.662695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1761  transposase IS3 family protein  32.99 
 
 		 372 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1768  transposase IS3 family protein  32.99 
 
 		 372 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2430  transposase IS3 family protein  32.99 
 
 		 372 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.755967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2654  transposase IS3 family protein  32.99 
 
 		 372 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683836  normal  0.423018 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3395  transposase IS3/IS911 family protein  30.3 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6861  transposase IS3/IS911 family protein  33.67 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232506  normal  0.190073 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  30.43 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  30.43 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  30.43 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0785  transposase A  27.55 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0961  transposase A  27.55 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.092394  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1725  transposase A  27.55 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.620325  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1156  transposase IS3/IS911 family protein  29.59 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1489  transposase IS3/IS911 family protein  29.59 
 
 		 87 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0120593  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0157  transposase A  27.55 
 
 		 87 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.913666  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  28.92 
 
 		 92 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4974  transposase IS3/IS911  44.19 
 
 		 138 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000160707  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1142  transposase IS3/IS911 family protein  24.49 
 
 		 636 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0242469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3289  transposase IS3/IS911 family protein  29.59 
 
 		 87 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1028  transposase IS3/IS911 family protein  29.59 
 
 		 87 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0384  transposase IS3/IS911 family protein  29.59 
 
 		 87 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00553388  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0091  transposase A  27.55 
 
 		 96 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.582456  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1550  transposase A  27.55 
 
 		 96 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2708  transposase A  27.55 
 
 		 96 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406372  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3813  transposase A  27.55 
 
 		 96 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.633568  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3882  transposase A  27.55 
 
 		 96 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3885  transposase A  27.55 
 
 		 96 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4608  transposase IS3/IS911 family protein  32 
 
 		 88 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546764  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3216  transposase IS3/IS911 family protein  26.76 
 
 		 158 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7038  transposase IS3/IS911 family protein  29.59 
 
 		 88 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0220  transposase IS3/IS911 family protein  29.59 
 
 		 87 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1992  transposase IS3/IS911  30.12 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.135346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2557  transposase IS3/IS911  30.12 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221495 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1213  transposase  30.38 
 
 		 86 aa  41.2  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.474133  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2065  ISEhe3, transposase orfA  28.24 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000139393  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2173  transposase IS3/IS911 family protein  26.76 
 
 		 228 aa  41.2  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3176  transposase IS3/IS911 family protein  26.76 
 
 		 228 aa  41.2  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00365869  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0680  transposase  30.38 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0306806  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5438  transposase IS3/IS911 family protein  30.43 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4710  transposase IS3/IS911 family protein  30.43 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0896  transposase IS3/IS911 family protein  30.43 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.665473  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0602  transposase IS3/IS911 family protein  30.43 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2606  transposase IS3/IS911 family protein  33.72 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.22197 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3340  transposase IS3/IS911 family protein  26.92 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0763009  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3127  transposase IS3/IS911  29.47 
 
 		 88 aa  40.4  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.800536  normal  0.701441 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3534  transposase IS3/IS911  29.47 
 
 		 88 aa  40.4  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.545436  normal  0.522486 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2969  transposase IS3/IS911  29.47 
 
 		 88 aa  40.4  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0895571 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0274  transposase IS3/IS911 family protein  29.17 
 
 		 92 aa  40.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1895  ISMca3, transposase, OrfA  38.89 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.827912  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4904  transposase IS3/IS911 family protein  30.43 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0142  ISEhe3, transposase orfA  28.24 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000709796  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0280  ISEhe3, transposase orfA  28.24 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0325  ISEhe3, transposase orfA  28.24 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.196335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0346  ISEhe3, transposase orfA  28.24 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0509042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0436  ISEhe3, transposase orfA  28.24 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1261  ISEhe3, transposase orfA  28.24 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1990  ISEhe3, transposase orfA  28.24 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000327529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2789  ISEhe3, transposase orfA  28.24 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.013431  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3022  ISEhe3, transposase orfA  28.24 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00292237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3971  ISEhe3, transposase orfA  28.24 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000376066  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4530  ISEhe3, transposase orfA  28.24 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.66022  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0463  transposase IS3/IS911 family protein  27.55 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0875  transposase IS3/IS911 family protein  27.55 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.572302 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1914  putative insertion element / transposase  27.55 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.863357  hitchhiker  0.0000000229131 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2103  putative transposase  27.55 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0726746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2507  transposase  27.55 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0154773 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1433  transposase IS3/IS911 family protein  30.61 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0245  transposase IS3 family protein  29.9 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4258  transposase IS3/IS911 family protein  26.74 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2856  transposase IS3/IS911 family protein  28.57 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000104071  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3450  transposase IS3/IS911 family protein  28.57 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000413069  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3961  transposase IS3/IS911 family protein  28.57 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03535  predicted IS protein  27.91 
 
 		 118 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.924615  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1931  transposase  30.12 
 
 		 133 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.575693  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0039  transposase  29.11 
 
 		 86 aa  40  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1364  transposase  29.11 
 
 		 86 aa  40  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1494  transposase  29.11 
 
 		 86 aa  40  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.85047  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1592  transposase  29.11 
 
 		 86 aa  40  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.673997  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1634  transposase  29.11 
 
 		 86 aa  40  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1965  transposase  29.11 
 
 		 86 aa  40  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2300  transposase  29.11 
 
 		 86 aa  40  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00950484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>