More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4710 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4710  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 96 aa  187  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0896  transposase IS3/IS911 family protein  98.96 
 
 		 96 aa  186  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.665473  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4904  transposase IS3/IS911 family protein  98.96 
 
 		 96 aa  185  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0602  transposase IS3/IS911 family protein  91.4 
 
 		 93 aa  163  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5438  transposase IS3/IS911 family protein  90.32 
 
 		 93 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4474  transposase IS3/IS911 family protein  55.91 
 
 		 93 aa  104  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22010  Transposase  54.44 
 
 		 111 aa  95.9  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.124801 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17080  Transposase  54.44 
 
 		 111 aa  95.9  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08100  Transposase  54.44 
 
 		 111 aa  95.9  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.721014 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2015  transposase IS3/IS911 family protein  45.56 
 
 		 92 aa  90.1  8e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1508  ISDet3, transposase orfA  46.59 
 
 		 92 aa  79.3  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.140272  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0845  transposase IS3/IS911  43.33 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0862  transposase IS3/IS911 family protein  43.33 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0288  transposase IS3/IS911 family protein  46.59 
 
 		 92 aa  79.3  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0272  transposase IS3/IS911 family protein  46.59 
 
 		 92 aa  79.3  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0116  transposase IS3/IS911 family protein  46.59 
 
 		 92 aa  79.3  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1300  transposase IS3/IS911 family protein  46.59 
 
 		 92 aa  79.3  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0578  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1110  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5607  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 95 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1475  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1720  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.809119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1736  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1752  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.130264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1591  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1667  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0248444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1665  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4451  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.396466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5363  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 95 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.657542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2263  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0797  transposase IS3/IS911 family protein  40.45 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3556  hypothetical protein  41.57 
 
 		 99 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1826  transposase IS3/IS911 family protein  41.57 
 
 		 99 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2882  transposase IS3/IS911 family protein  40.66 
 
 		 92 aa  76.6  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.935915  normal  0.211621 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3816  transposase IS3/IS911 family protein  40.45 
 
 		 91 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1083  transposase IS3/IS911 family protein  40.45 
 
 		 91 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5379  transposase IS3/IS911 family protein  40.45 
 
 		 91 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.543472  normal  0.936634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0345  transposase IS3/IS911 family protein  40.45 
 
 		 91 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1054  transposase IS3/IS911 family protein  40.45 
 
 		 91 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.298359  normal  0.762501 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0209  IS3/IS911 family transposase  41.11 
 
 		 92 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.599747 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0204  IS3/IS911 family transposase  41.11 
 
 		 92 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4909  transposase IS3/IS911 family protein  41.57 
 
 		 92 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1235  putative transposase  41.11 
 
 		 92 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0720605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0440  putative transposase  39.78 
 
 		 94 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.468029 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0143  IS3/IS911 family transposase  41.11 
 
 		 92 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1332  transposase IS3/IS911-family  43.18 
 
 		 92 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1309  transposase IS3/IS911-family  43.18 
 
 		 92 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_89  transposase IS3/IS911-family  43.18 
 
 		 92 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_777  transposase IS3/IS911-family  43.18 
 
 		 92 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_64  transposase IS3/IS911-family  43.18 
 
 		 92 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3840  transposase IS3/IS911 family protein  39.33 
 
 		 91 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4337  transposase IS3/IS911 family protein  41.57 
 
 		 93 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3583  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 		 92 aa  73.2  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2016  transposase IS3/IS911 family protein  41.76 
 
 		 92 aa  73.2  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3530  transposase IS3/IS911 family protein  39.33 
 
 		 93 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3339  transposase IS3/IS911 family protein  38.2 
 
 		 93 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7865  transposase IS3/IS911 family protein  36.26 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3414  transposase IS3/IS911 family protein  41.38 
 
 		 91 aa  70.9  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0442  transposase IS3/IS911 family protein  39.33 
 
 		 93 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.855822 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4813  transposase IS3/IS911 family protein  38.2 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1694  transposase IS3/IS911  37.78 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.233674  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1495  transposase IS3/IS911 family protein  38.2 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.824912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0026  transposase subfamily  43.82 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.138106  normal  0.472585 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4856  transposase IS3/IS911 family protein  37.78 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.164746 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02903  transposase ORF-A, IS-type  37.21 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1443  transposase IS3/IS911  37.78 
 
 		 92 aa  67  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1571  transposase IS3/IS911  37.78 
 
 		 92 aa  67  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2056  transposase IS3/IS911  37.78 
 
 		 92 aa  67  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0286844  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0375  transposase IS3/IS911 family protein  42.7 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000436145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0093  transposase  35.56 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.426296 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3926  transposase IS3/IS911 family protein  35.56 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287084  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5068  transposase IS3/IS911 family protein  37.08 
 
 		 92 aa  66.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.858829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0079  transposase IS3/IS911 family protein  41.57 
 
 		 88 aa  66.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0278085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0132  isrso12-transposase orfa protein  35.56 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.183288  normal  0.0817579 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4079  transposase IS3/IS911 family protein  42.7 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2011  transposase IS3/IS911  36.67 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2633  IS3/IS911 family transposase A  40.86 
 
 		 87 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000594495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4520  IS3/IS911 family transposase A  40.86 
 
 		 87 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000777217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4237  transposase IS3/IS911 family protein  36.67 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219099  normal  0.376477 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2308  transposase IS3/IS911 family protein  40.45 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2311  transposase IS3/IS911 family protein  40.45 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.882739 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0959  transposase IS3/IS911 family protein  37.78 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4220  transposase IS3/IS911 family protein  35.96 
 
 		 93 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1291  transposase IS3/IS911 family protein  41.25 
 
 		 83 aa  63.5  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0785  transposase A  36.84 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0961  transposase A  36.84 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.092394  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1725  transposase A  36.84 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.620325  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4865  transposase IS3/IS911  39.33 
 
 		 87 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3300  transposase IS3/IS911 family protein  39.33 
 
 		 87 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0091  transposase A  36.84 
 
 		 96 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.582456  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1550  transposase A  36.84 
 
 		 96 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0066  transposase IS3/IS911 family protein  34.44 
 
 		 88 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3882  transposase A  36.84 
 
 		 96 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3813  transposase A  36.84 
 
 		 96 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.633568  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3885  transposase A  36.84 
 
 		 96 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2708  transposase A  36.84 
 
 		 96 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406372  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0943  transposase IS3/IS911 family protein  36.67 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0157  transposase A  37.78 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.913666  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0275  transposase IS3/IS911 family protein  36.67 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1263  transposase IS3/IS911 family protein  36.67 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>