More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1495 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4813  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
93 aa  183  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1495  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
93 aa  183  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.824912  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3530  transposase IS3/IS911 family protein  97.85 
 
 
93 aa  179  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4337  transposase IS3/IS911 family protein  93.55 
 
 
93 aa  174  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4220  transposase IS3/IS911 family protein  93.55 
 
 
93 aa  169  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3339  transposase IS3/IS911 family protein  90.32 
 
 
93 aa  167  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0442  transposase IS3/IS911 family protein  86.02 
 
 
93 aa  166  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.855822 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0440  putative transposase  73.03 
 
 
94 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.468029 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0143  IS3/IS911 family transposase  73.03 
 
 
92 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0209  IS3/IS911 family transposase  73.03 
 
 
92 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.599747 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1235  putative transposase  73.03 
 
 
92 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0720605  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0204  IS3/IS911 family transposase  73.03 
 
 
92 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3414  transposase IS3/IS911 family protein  56.99 
 
 
91 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4909  transposase IS3/IS911 family protein  55.06 
 
 
92 aa  106  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2882  transposase IS3/IS911 family protein  59.26 
 
 
92 aa  103  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.935915  normal  0.211621 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_64  transposase IS3/IS911-family  52.94 
 
 
92 aa  102  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_777  transposase IS3/IS911-family  52.94 
 
 
92 aa  102  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1309  transposase IS3/IS911-family  52.94 
 
 
92 aa  102  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1332  transposase IS3/IS911-family  52.94 
 
 
92 aa  102  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_89  transposase IS3/IS911-family  52.94 
 
 
92 aa  102  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5068  transposase IS3/IS911 family protein  50.56 
 
 
92 aa  100  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.858829  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1508  ISDet3, transposase orfA  49.41 
 
 
92 aa  96.7  9e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.140272  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1300  transposase IS3/IS911 family protein  49.41 
 
 
92 aa  96.7  9e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0288  transposase IS3/IS911 family protein  49.41 
 
 
92 aa  96.7  9e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0116  transposase IS3/IS911 family protein  49.41 
 
 
92 aa  96.7  9e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0272  transposase IS3/IS911 family protein  49.41 
 
 
92 aa  96.7  9e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7865  transposase IS3/IS911 family protein  50.56 
 
 
126 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0345  transposase IS3/IS911 family protein  52.27 
 
 
91 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3816  transposase IS3/IS911 family protein  52.27 
 
 
91 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113749  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5379  transposase IS3/IS911 family protein  51.14 
 
 
91 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.543472  normal  0.936634 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1083  transposase IS3/IS911 family protein  51.14 
 
 
91 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1054  transposase IS3/IS911 family protein  51.14 
 
 
91 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.298359  normal  0.762501 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3840  transposase IS3/IS911 family protein  53.57 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3583  transposase IS3/IS911 family protein  48.31 
 
 
92 aa  94.4  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4474  transposase IS3/IS911 family protein  47.19 
 
 
93 aa  94  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5098  transposase IS3/IS911 family protein  60 
 
 
72 aa  93.6  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.451404 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2016  transposase IS3/IS911 family protein  47.19 
 
 
92 aa  93.2  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3556  hypothetical protein  46.59 
 
 
99 aa  92.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1826  transposase IS3/IS911 family protein  46.59 
 
 
99 aa  92.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0797  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 
106 aa  92  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1291  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
83 aa  88.2  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17080  Transposase  44.94 
 
 
111 aa  86.7  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08100  Transposase  44.94 
 
 
111 aa  86.7  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.721014 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22010  Transposase  44.94 
 
 
111 aa  86.7  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.124801 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1443  transposase IS3/IS911  47.67 
 
 
92 aa  83.6  7e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1571  transposase IS3/IS911  47.67 
 
 
92 aa  83.6  7e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2056  transposase IS3/IS911  47.67 
 
 
92 aa  83.6  7e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0286844  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1694  transposase IS3/IS911  47.67 
 
 
133 aa  83.6  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.233674  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2011  transposase IS3/IS911  46.51 
 
 
92 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2906  Fis family transcriptional regulator  44.09 
 
 
88 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000119814  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0535  hypothetical protein  93.02 
 
 
102 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1433  transposase IS3/IS911 family protein  47.06 
 
 
88 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4237  transposase IS3/IS911 family protein  46.67 
 
 
92 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219099  normal  0.376477 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0797  hypothetical protein  86.05 
 
 
53 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0461181  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0132  isrso12-transposase orfa protein  44.44 
 
 
88 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.183288  normal  0.0817579 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3926  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 
88 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287084  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3081  transposase IS3/IS911 family protein  41.94 
 
 
88 aa  75.5  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2756  transposase IS3/IS911 family protein  44.19 
 
 
88 aa  75.9  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0093  transposase  44.44 
 
 
88 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.426296 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0557  ISRSO16-transposase OrfA protein  40.66 
 
 
88 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.235174 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2942  transposase subfamily protein  40.86 
 
 
88 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.342551  hitchhiker  1.76227e-24 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1010  hypothetical protein  42.53 
 
 
89 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3069  transposase family protein  39.78 
 
 
88 aa  73.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4807  transposase subfamily  39.78 
 
 
88 aa  73.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.650973  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1438  isrso12-transposase orfa protein  44.58 
 
 
88 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2707  isrso12-transposase orfa protein  44.58 
 
 
88 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0503  isrso12-transposase orfa protein  44.58 
 
 
88 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1299  isrso12-transposase orfa protein  44.58 
 
 
88 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1137  transposase IS3/IS911 family protein  39.78 
 
 
88 aa  73.9  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.000000141669 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5527  transposase IS3/IS911 family protein  44.19 
 
 
88 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.100543 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1111  transposase IS3/IS911 family protein  44.19 
 
 
88 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.207112 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4321  transposase IS3/IS911 family protein  40.66 
 
 
88 aa  73.6  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.583527  normal  0.389304 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2278  transposase IS3/IS911 family protein  44.32 
 
 
88 aa  73.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00023086  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2285  transposase IS3/IS911 family protein  44.32 
 
 
88 aa  73.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0445809  normal  0.0110111 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6172  transposase IS3/IS911 family protein  44.32 
 
 
88 aa  73.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3837  transposase IS3/IS911 family protein  44.32 
 
 
88 aa  73.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0125  transposase IS3/IS911 family protein  44.32 
 
 
88 aa  73.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2927  transposase IS3/IS911 family protein  39.29 
 
 
88 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6104  transposase IS3/IS911 family protein  39.29 
 
 
88 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0643  putative transposase  40.74 
 
 
99 aa  72  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.6553  normal  0.737994 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4892  transposase family protein  39.77 
 
 
92 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0142849 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5607  transposase IS3/IS911 family protein  34.09 
 
 
95 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337897  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0066  transposase IS3/IS911 family protein  43.21 
 
 
88 aa  72  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0442  transposase IS3/IS911 family protein  39.29 
 
 
88 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317076  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4740  transposase IS3/IS911 family protein  39.29 
 
 
88 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5363  transposase IS3/IS911 family protein  34.09 
 
 
95 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.657542  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2634  transposase IS3/IS911 family protein  39.29 
 
 
88 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492474  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1163  transposase IS3/IS911  43.33 
 
 
92 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.966557  normal  0.412061 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2015  transposase IS3/IS911 family protein  35.48 
 
 
92 aa  72  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1475  transposase IS3/IS911 family protein  33.71 
 
 
111 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1720  transposase IS3/IS911 family protein  33.71 
 
 
111 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.809119  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1736  transposase IS3/IS911 family protein  33.71 
 
 
111 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908107  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1752  transposase IS3/IS911 family protein  33.71 
 
 
111 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.130264  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1591  transposase IS3/IS911 family protein  33.71 
 
 
111 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1665  transposase IS3/IS911 family protein  33.71 
 
 
111 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1667  transposase IS3/IS911 family protein  33.71 
 
 
111 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0248444  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2263  transposase IS3/IS911 family protein  33.71 
 
 
111 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4451  transposase IS3/IS911 family protein  33.71 
 
 
111 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.396466  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2300  transposase IS3/IS911 family protein  41.77 
 
 
94 aa  71.2  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.356728  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0845  transposase IS3/IS911  32.95 
 
 
111 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>