More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2016 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2016  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 92 aa  185  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3583  transposase IS3/IS911 family protein  97.83 
 
 		 92 aa  180  7e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1291  transposase IS3/IS911 family protein  97.59 
 
 		 83 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0345  transposase IS3/IS911 family protein  71.43 
 
 		 91 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3816  transposase IS3/IS911 family protein  71.43 
 
 		 91 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1083  transposase IS3/IS911 family protein  71.43 
 
 		 91 aa  143  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1054  transposase IS3/IS911 family protein  71.43 
 
 		 91 aa  143  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.298359  normal  0.762501 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5379  transposase IS3/IS911 family protein  71.43 
 
 		 91 aa  143  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.543472  normal  0.936634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3840  transposase IS3/IS911 family protein  70.33 
 
 		 91 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7865  transposase IS3/IS911 family protein  65.22 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1826  transposase IS3/IS911 family protein  70 
 
 		 99 aa  134  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3556  hypothetical protein  70 
 
 		 99 aa  134  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0797  transposase IS3/IS911 family protein  67.78 
 
 		 106 aa  130  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4909  transposase IS3/IS911 family protein  64.13 
 
 		 92 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5068  transposase IS3/IS911 family protein  63.04 
 
 		 92 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.858829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1010  hypothetical protein  64.84 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3414  transposase IS3/IS911 family protein  60.67 
 
 		 91 aa  121  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2882  transposase IS3/IS911 family protein  51.09 
 
 		 92 aa  103  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.935915  normal  0.211621 
 
 
-
 
NC_002936  DET1508  ISDet3, transposase orfA  50.55 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.140272  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0272  transposase IS3/IS911 family protein  50.55 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0116  transposase IS3/IS911 family protein  50.55 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1300  transposase IS3/IS911 family protein  50.55 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0288  transposase IS3/IS911 family protein  50.55 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0442  transposase IS3/IS911 family protein  53.93 
 
 		 93 aa  100  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.855822 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5098  transposase IS3/IS911 family protein  65.28 
 
 		 72 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.451404 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1332  transposase IS3/IS911-family  50.55 
 
 		 92 aa  98.2  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_64  transposase IS3/IS911-family  50.55 
 
 		 92 aa  98.2  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_777  transposase IS3/IS911-family  50.55 
 
 		 92 aa  98.2  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1309  transposase IS3/IS911-family  50.55 
 
 		 92 aa  98.2  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_89  transposase IS3/IS911-family  50.55 
 
 		 92 aa  98.2  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3530  transposase IS3/IS911 family protein  51.76 
 
 		 93 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6820  transposase IS3/IS911 family protein  59.74 
 
 		 79 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4337  transposase IS3/IS911 family protein  51.76 
 
 		 93 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3339  transposase IS3/IS911 family protein  50.59 
 
 		 93 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4474  transposase IS3/IS911 family protein  49.44 
 
 		 93 aa  96.7  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3515  hypothetical protein  70.49 
 
 		 71 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4813  transposase IS3/IS911 family protein  47.19 
 
 		 93 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1495  transposase IS3/IS911 family protein  47.19 
 
 		 93 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.824912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0440  putative transposase  45.65 
 
 		 94 aa  91.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.468029 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0204  IS3/IS911 family transposase  45.65 
 
 		 92 aa  91.7  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1235  putative transposase  45.65 
 
 		 92 aa  91.7  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0720605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0209  IS3/IS911 family transposase  45.65 
 
 		 92 aa  91.7  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.599747 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0143  IS3/IS911 family transposase  45.65 
 
 		 92 aa  91.7  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1168  transposase and inactivated derivative  63.49 
 
 		 76 aa  89  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4220  transposase IS3/IS911 family protein  46.07 
 
 		 93 aa  89  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2015  transposase IS3/IS911 family protein  44.57 
 
 		 92 aa  86.7  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22010  Transposase  44.94 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.124801 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08100  Transposase  44.94 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.721014 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17080  Transposase  44.94 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0845  transposase IS3/IS911  41.57 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0862  transposase IS3/IS911 family protein  41.57 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1475  transposase IS3/IS911 family protein  40.45 
 
 		 111 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1720  transposase IS3/IS911 family protein  40.45 
 
 		 111 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.809119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1736  transposase IS3/IS911 family protein  40.45 
 
 		 111 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1752  transposase IS3/IS911 family protein  40.45 
 
 		 111 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.130264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4451  transposase IS3/IS911 family protein  40.45 
 
 		 111 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.396466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2263  transposase IS3/IS911 family protein  40.45 
 
 		 111 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1591  transposase IS3/IS911 family protein  40.45 
 
 		 111 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1665  transposase IS3/IS911 family protein  40.45 
 
 		 111 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1667  transposase IS3/IS911 family protein  40.45 
 
 		 111 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0248444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5363  transposase IS3/IS911 family protein  40.45 
 
 		 95 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.657542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5607  transposase IS3/IS911 family protein  40.45 
 
 		 95 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0578  transposase IS3/IS911 family protein  39.33 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1110  transposase IS3/IS911 family protein  39.33 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4237  transposase IS3/IS911 family protein  41.86 
 
 		 92 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219099  normal  0.376477 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1694  transposase IS3/IS911  39.53 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.233674  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1443  transposase IS3/IS911  39.53 
 
 		 92 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1571  transposase IS3/IS911  39.53 
 
 		 92 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2056  transposase IS3/IS911  39.53 
 
 		 92 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0286844  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0896  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.665473  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4904  transposase IS3/IS911 family protein  41.76 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4710  transposase IS3/IS911 family protein  41.76 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2011  transposase IS3/IS911  38.37 
 
 		 92 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0602  transposase IS3/IS911 family protein  41.76 
 
 		 93 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5438  transposase IS3/IS911 family protein  41.76 
 
 		 93 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1213  hypothetical protein  46.77 
 
 		 85 aa  71.2  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0796796  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1137  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.000000141669 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1438  isrso12-transposase orfa protein  37.04 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2707  isrso12-transposase orfa protein  37.04 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0503  isrso12-transposase orfa protein  37.04 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1299  isrso12-transposase orfa protein  37.04 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0199  hypothetical protein  37.21 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5527  transposase IS3/IS911 family protein  37.21 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.100543 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1078  hypothetical protein  37.21 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1433  transposase IS3/IS911 family protein  34.78 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0527  transposase IS3/IS911 family protein  39.02 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.781347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3122  transposase IS3/IS911 family protein  39.02 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.956375  normal  0.520056 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2542  transposase IS3/IS911 family protein  41.89 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0881  transposase IS3/IS911 family protein  39.02 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0140867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2313  transposase IS3/IS911 family protein  39.02 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4321  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.583527  normal  0.389304 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1111  transposase IS3/IS911 family protein  37.21 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.207112 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4006  transposase IS3/IS911 family protein  41.89 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2634  transposase IS3/IS911 family protein  35.63 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0442  transposase IS3/IS911 family protein  35.63 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3926  transposase IS3/IS911 family protein  32.95 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287084  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2927  transposase IS3/IS911 family protein  35.63 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6104  transposase IS3/IS911 family protein  35.63 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4740  transposase IS3/IS911 family protein  35.63 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0093  transposase  32.95 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.426296 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>