More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4474 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4474  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
93 aa  189  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22010  Transposase  83.52 
 
 
111 aa  159  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.124801 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17080  Transposase  83.52 
 
 
111 aa  159  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08100  Transposase  83.52 
 
 
111 aa  159  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.721014 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2015  transposase IS3/IS911 family protein  55.56 
 
 
92 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5607  transposase IS3/IS911 family protein  54.74 
 
 
95 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337897  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0845  transposase IS3/IS911  55.56 
 
 
111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0862  transposase IS3/IS911 family protein  55.56 
 
 
111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1475  transposase IS3/IS911 family protein  54.74 
 
 
111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1720  transposase IS3/IS911 family protein  54.74 
 
 
111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.809119  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1736  transposase IS3/IS911 family protein  54.74 
 
 
111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908107  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1752  transposase IS3/IS911 family protein  54.74 
 
 
111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.130264  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5363  transposase IS3/IS911 family protein  54.44 
 
 
95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.657542  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1591  transposase IS3/IS911 family protein  54.74 
 
 
111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1665  transposase IS3/IS911 family protein  54.74 
 
 
111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1667  transposase IS3/IS911 family protein  54.74 
 
 
111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0248444  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2263  transposase IS3/IS911 family protein  54.74 
 
 
111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4451  transposase IS3/IS911 family protein  54.74 
 
 
111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.396466  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0578  transposase IS3/IS911 family protein  52.22 
 
 
111 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1110  transposase IS3/IS911 family protein  52.22 
 
 
111 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564169  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1309  transposase IS3/IS911-family  57.3 
 
 
92 aa  108  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_777  transposase IS3/IS911-family  57.3 
 
 
92 aa  108  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_89  transposase IS3/IS911-family  57.3 
 
 
92 aa  108  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_64  transposase IS3/IS911-family  57.3 
 
 
92 aa  108  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1332  transposase IS3/IS911-family  57.3 
 
 
92 aa  108  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3414  transposase IS3/IS911 family protein  53.93 
 
 
91 aa  108  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4909  transposase IS3/IS911 family protein  53.93 
 
 
92 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4904  transposase IS3/IS911 family protein  56.99 
 
 
96 aa  105  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0896  transposase IS3/IS911 family protein  56.99 
 
 
96 aa  105  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.665473  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4710  transposase IS3/IS911 family protein  55.91 
 
 
96 aa  104  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2882  transposase IS3/IS911 family protein  51.11 
 
 
92 aa  103  8e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.935915  normal  0.211621 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5068  transposase IS3/IS911 family protein  51.69 
 
 
92 aa  103  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.858829  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4856  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
128 aa  102  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.164746 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7865  transposase IS3/IS911 family protein  51.69 
 
 
126 aa  100  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5438  transposase IS3/IS911 family protein  54.84 
 
 
93 aa  100  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189176  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1508  ISDet3, transposase orfA  50.56 
 
 
92 aa  99.8  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.140272  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0116  transposase IS3/IS911 family protein  50.56 
 
 
92 aa  99.8  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0272  transposase IS3/IS911 family protein  50.56 
 
 
92 aa  99.8  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1300  transposase IS3/IS911 family protein  50.56 
 
 
92 aa  99.8  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0288  transposase IS3/IS911 family protein  50.56 
 
 
92 aa  99.8  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0204  IS3/IS911 family transposase  50.55 
 
 
92 aa  98.6  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5379  transposase IS3/IS911 family protein  52.27 
 
 
91 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.543472  normal  0.936634 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1054  transposase IS3/IS911 family protein  52.27 
 
 
91 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.298359  normal  0.762501 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0442  transposase IS3/IS911 family protein  51.69 
 
 
93 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.855822 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1235  putative transposase  50.55 
 
 
92 aa  98.6  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0720605  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0143  IS3/IS911 family transposase  50.55 
 
 
92 aa  98.6  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1083  transposase IS3/IS911 family protein  52.27 
 
 
91 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3816  transposase IS3/IS911 family protein  52.27 
 
 
91 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113749  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0345  transposase IS3/IS911 family protein  52.27 
 
 
91 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0602  transposase IS3/IS911 family protein  53.76 
 
 
93 aa  98.6  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0209  IS3/IS911 family transposase  50.55 
 
 
92 aa  98.6  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.599747 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0440  putative transposase  49.46 
 
 
94 aa  99.4  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.468029 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1826  transposase IS3/IS911 family protein  51.14 
 
 
99 aa  97.1  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3556  hypothetical protein  51.14 
 
 
99 aa  97.1  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3840  transposase IS3/IS911 family protein  51.14 
 
 
91 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3530  transposase IS3/IS911 family protein  48.31 
 
 
93 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2016  transposase IS3/IS911 family protein  49.44 
 
 
92 aa  96.7  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3339  transposase IS3/IS911 family protein  48.31 
 
 
93 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3583  transposase IS3/IS911 family protein  49.44 
 
 
92 aa  95.1  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4337  transposase IS3/IS911 family protein  48.31 
 
 
93 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5098  transposase IS3/IS911 family protein  59.72 
 
 
72 aa  95.1  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.451404 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0797  transposase IS3/IS911 family protein  48.86 
 
 
106 aa  94.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1495  transposase IS3/IS911 family protein  47.19 
 
 
93 aa  94  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.824912  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4813  transposase IS3/IS911 family protein  47.19 
 
 
93 aa  94  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2193  transposase IS3/IS911 family protein  47.06 
 
 
88 aa  86.3  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4220  transposase IS3/IS911 family protein  43.82 
 
 
93 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1288  transposase IS3/IS911 family protein  47.06 
 
 
88 aa  86.3  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1235  transposase IS3/IS911 family protein  47.06 
 
 
88 aa  86.3  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0275  transposase IS3/IS911 family protein  48.24 
 
 
88 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0431  transposase IS3/IS911 family protein  48.24 
 
 
88 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2355  transposase IS3/IS911 family protein  48.24 
 
 
88 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2228  transposase IS3/IS911 family protein  48.24 
 
 
88 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2601  transposase IS3/IS911 family protein  45.88 
 
 
88 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1291  transposase IS3/IS911 family protein  48.72 
 
 
83 aa  84.3  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1010  hypothetical protein  46.74 
 
 
89 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1137  transposase IS3/IS911 family protein  47.06 
 
 
88 aa  84  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.000000141669 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6861  transposase IS3/IS911 family protein  48.28 
 
 
87 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232506  normal  0.190073 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2633  IS3/IS911 family transposase A  47.13 
 
 
87 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000594495  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4520  IS3/IS911 family transposase A  47.13 
 
 
87 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000777217  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1457  transposase IS3/IS911 family protein  49.4 
 
 
88 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080676  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4865  transposase IS3/IS911  47.13 
 
 
87 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3300  transposase IS3/IS911 family protein  47.13 
 
 
87 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0108  transposase IS3/IS911  44.19 
 
 
88 aa  81.6  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2022  transposase IS3/IS911  44.19 
 
 
88 aa  81.6  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2784  transposase IS3/IS911  44.19 
 
 
88 aa  81.6  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1263  transposase IS3/IS911 family protein  47.06 
 
 
88 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0943  transposase IS3/IS911 family protein  47.06 
 
 
88 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3395  transposase IS3/IS911 family protein  46.59 
 
 
100 aa  81.3  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02903  transposase ORF-A, IS-type  41.86 
 
 
87 aa  80.5  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4237  transposase IS3/IS911 family protein  46.51 
 
 
92 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219099  normal  0.376477 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2559  transposase IS3/IS911  45.88 
 
 
86 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0007  transposase IS3/IS911 family protein  45.88 
 
 
86 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2927  transposase IS3/IS911 family protein  46.51 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2634  transposase IS3/IS911 family protein  46.51 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492474  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6104  transposase IS3/IS911 family protein  46.51 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03180  hypothetical protein  48.86 
 
 
87 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000135  hitchhiker  0.00000000259634 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6139  transposase IS3/IS911 family protein  44.32 
 
 
87 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.623502 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2513  hypothetical protein  47.73 
 
 
87 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4740  transposase IS3/IS911 family protein  46.51 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0442  transposase IS3/IS911 family protein  46.51 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317076  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>