More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0209 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009475  BBta_p0143  IS3/IS911 family transposase  100 
 
 		 92 aa  185  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1235  putative transposase  100 
 
 		 92 aa  185  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0720605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0440  putative transposase  100 
 
 		 94 aa  185  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.468029 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0209  IS3/IS911 family transposase  100 
 
 		 92 aa  185  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.599747 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0204  IS3/IS911 family transposase  100 
 
 		 92 aa  185  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3339  transposase IS3/IS911 family protein  74.16 
 
 		 93 aa  140  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0442  transposase IS3/IS911 family protein  75.28 
 
 		 93 aa  139  9e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.855822 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3530  transposase IS3/IS911 family protein  73.03 
 
 		 93 aa  135  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4813  transposase IS3/IS911 family protein  73.03 
 
 		 93 aa  135  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1495  transposase IS3/IS911 family protein  73.03 
 
 		 93 aa  135  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.824912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4337  transposase IS3/IS911 family protein  71.91 
 
 		 93 aa  134  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_89  transposase IS3/IS911-family  61.54 
 
 		 92 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_777  transposase IS3/IS911-family  61.54 
 
 		 92 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_64  transposase IS3/IS911-family  61.54 
 
 		 92 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1332  transposase IS3/IS911-family  61.54 
 
 		 92 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1309  transposase IS3/IS911-family  61.54 
 
 		 92 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4220  transposase IS3/IS911 family protein  68.54 
 
 		 93 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4909  transposase IS3/IS911 family protein  53.26 
 
 		 92 aa  114  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2882  transposase IS3/IS911 family protein  56.82 
 
 		 92 aa  113  6.9999999999999995e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.935915  normal  0.211621 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3414  transposase IS3/IS911 family protein  60.71 
 
 		 91 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5068  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 92 aa  110  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.858829  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1508  ISDet3, transposase orfA  54.95 
 
 		 92 aa  108  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.140272  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0116  transposase IS3/IS911 family protein  54.95 
 
 		 92 aa  108  3e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0288  transposase IS3/IS911 family protein  54.95 
 
 		 92 aa  108  3e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0272  transposase IS3/IS911 family protein  54.95 
 
 		 92 aa  108  3e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1300  transposase IS3/IS911 family protein  54.95 
 
 		 92 aa  108  3e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3556  hypothetical protein  53.85 
 
 		 99 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1826  transposase IS3/IS911 family protein  53.85 
 
 		 99 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0797  transposase IS3/IS911 family protein  53.85 
 
 		 106 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3816  transposase IS3/IS911 family protein  53.85 
 
 		 91 aa  104  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0345  transposase IS3/IS911 family protein  53.85 
 
 		 91 aa  104  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1083  transposase IS3/IS911 family protein  52.75 
 
 		 91 aa  103  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5379  transposase IS3/IS911 family protein  52.75 
 
 		 91 aa  103  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.543472  normal  0.936634 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1054  transposase IS3/IS911 family protein  52.75 
 
 		 91 aa  103  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.298359  normal  0.762501 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3840  transposase IS3/IS911 family protein  51.65 
 
 		 91 aa  100  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7865  transposase IS3/IS911 family protein  49.44 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4474  transposase IS3/IS911 family protein  50.55 
 
 		 93 aa  98.6  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17080  Transposase  48.89 
 
 		 111 aa  97.1  7e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08100  Transposase  48.89 
 
 		 111 aa  97.1  7e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.721014 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22010  Transposase  48.89 
 
 		 111 aa  97.1  7e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.124801 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5098  transposase IS3/IS911 family protein  55.56 
 
 		 72 aa  96.3  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.451404 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1694  transposase IS3/IS911  52.75 
 
 		 133 aa  94.4  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.233674  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1443  transposase IS3/IS911  52.75 
 
 		 92 aa  93.6  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1571  transposase IS3/IS911  52.75 
 
 		 92 aa  93.6  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2056  transposase IS3/IS911  52.75 
 
 		 92 aa  93.6  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0286844  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3583  transposase IS3/IS911 family protein  46.74 
 
 		 92 aa  92.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2011  transposase IS3/IS911  51.65 
 
 		 92 aa  91.7  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2016  transposase IS3/IS911 family protein  45.65 
 
 		 92 aa  91.7  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3081  transposase IS3/IS911 family protein  50.57 
 
 		 88 aa  90.5  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1433  transposase IS3/IS911 family protein  51.69 
 
 		 88 aa  90.1  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2942  transposase subfamily protein  49.43 
 
 		 88 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.342551  hitchhiker  1.76227e-24 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3069  transposase family protein  46.74 
 
 		 88 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4807  transposase subfamily  46.74 
 
 		 88 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.650973  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2300  transposase IS3/IS911 family protein  48.28 
 
 		 94 aa  87.8  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.356728  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2228  transposase IS3/IS911 family protein  45.65 
 
 		 88 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0431  transposase IS3/IS911 family protein  45.65 
 
 		 88 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4892  transposase family protein  47.13 
 
 		 92 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0142849 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0275  transposase IS3/IS911 family protein  45.65 
 
 		 88 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2355  transposase IS3/IS911 family protein  45.65 
 
 		 88 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4237  transposase IS3/IS911 family protein  49.45 
 
 		 92 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219099  normal  0.376477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0881  transposase IS3/IS911 family protein  47.13 
 
 		 96 aa  85.9  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0140867  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0199  hypothetical protein  44.57 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1078  hypothetical protein  44.57 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6104  transposase IS3/IS911 family protein  45.98 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2927  transposase IS3/IS911 family protein  45.98 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4740  transposase IS3/IS911 family protein  45.98 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2634  transposase IS3/IS911 family protein  45.98 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0442  transposase IS3/IS911 family protein  45.98 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4321  transposase IS3/IS911 family protein  47.83 
 
 		 88 aa  86.3  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.583527  normal  0.389304 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3122  transposase IS3/IS911 family protein  47.13 
 
 		 96 aa  85.9  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.956375  normal  0.520056 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0527  transposase IS3/IS911 family protein  47.13 
 
 		 96 aa  85.9  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.781347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2313  transposase IS3/IS911 family protein  47.13 
 
 		 96 aa  85.9  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6345  transposase IS3/IS911 family protein  46.07 
 
 		 370 aa  85.1  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5979  transposase IS3/IS911 family protein  46.07 
 
 		 370 aa  85.1  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0959  transposase IS3/IS911 family protein  45.98 
 
 		 88 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4211  transposase IS3/IS911 family protein  46.07 
 
 		 370 aa  85.1  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1392  transposase IS3/IS911 family protein  46.07 
 
 		 370 aa  85.1  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3513  transposase IS3/IS911 family protein  46.07 
 
 		 370 aa  85.1  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3491  transposase IS3/IS911 family protein  46.07 
 
 		 370 aa  85.1  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3517  transposase IS3/IS911 family protein  46.07 
 
 		 370 aa  85.1  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2906  Fis family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 88 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000119814  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5527  transposase IS3/IS911 family protein  48.94 
 
 		 88 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.100543 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1111  transposase IS3/IS911 family protein  48.94 
 
 		 88 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.207112 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1137  transposase IS3/IS911 family protein  45.65 
 
 		 88 aa  84.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.000000141669 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0943  transposase IS3/IS911 family protein  44.57 
 
 		 88 aa  84  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1263  transposase IS3/IS911 family protein  44.57 
 
 		 88 aa  84  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0036  transposase IS3/IS911 family protein  46.07 
 
 		 88 aa  83.6  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2601  transposase IS3/IS911 family protein  43.48 
 
 		 88 aa  83.6  9e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.297438 
 
 
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NC_013730  Slin_2278  transposase IS3/IS911 family protein  48.28 
 
 		 88 aa  83.2  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00023086  normal  0.050685 
 
 
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NC_013730  Slin_0125  transposase IS3/IS911 family protein  48.28 
 
 		 88 aa  83.2  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.405857 
 
 
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NC_013730  Slin_2285  transposase IS3/IS911 family protein  48.28 
 
 		 88 aa  83.2  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0445809  normal  0.0110111 
 
 
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NC_011666  Msil_1291  transposase IS3/IS911 family protein  45.78 
 
 		 83 aa  82.8  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013730  Slin_6172  transposase IS3/IS911 family protein  48.28 
 
 		 88 aa  83.2  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3837  transposase IS3/IS911 family protein  48.28 
 
 		 88 aa  83.2  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003295  RSc2707  isrso12-transposase orfa protein  45.98 
 
 		 88 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.130575 
 
 
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NC_013421  Pecwa_0379  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 77 aa  82  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.563054  n/a   
 
 
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NC_010157  YpAngola_B0093  transposase  45.98 
 
 		 88 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.426296 
 
 
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NC_010159  YpAngola_A0317  transposase  50.59 
 
 		 87 aa  82.8  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00457951  normal  1 
 
 
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NC_010159  YpAngola_A0132  isrso12-transposase orfa protein  45.98 
 
 		 88 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.183288  normal  0.0817579 
 
 
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NC_010465  YPK_3926  transposase IS3/IS911 family protein  45.98 
 
 		 88 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287084  n/a   
 
 
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