More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3530 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3530  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 93 aa  183  7e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4813  transposase IS3/IS911 family protein  97.85 
 
 		 93 aa  179  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1495  transposase IS3/IS911 family protein  97.85 
 
 		 93 aa  179  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.824912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4337  transposase IS3/IS911 family protein  95.7 
 
 		 93 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4220  transposase IS3/IS911 family protein  95.7 
 
 		 93 aa  173  7e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3339  transposase IS3/IS911 family protein  91.4 
 
 		 93 aa  169  9e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0442  transposase IS3/IS911 family protein  87.1 
 
 		 93 aa  167  5e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.855822 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0143  IS3/IS911 family transposase  73.03 
 
 		 92 aa  135  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1235  putative transposase  73.03 
 
 		 92 aa  135  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0720605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0204  IS3/IS911 family transposase  73.03 
 
 		 92 aa  135  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0440  putative transposase  73.03 
 
 		 94 aa  136  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.468029 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0209  IS3/IS911 family transposase  73.03 
 
 		 92 aa  135  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.599747 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3414  transposase IS3/IS911 family protein  58.06 
 
 		 91 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4909  transposase IS3/IS911 family protein  56.18 
 
 		 92 aa  110  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2882  transposase IS3/IS911 family protein  60.49 
 
 		 92 aa  107  5e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.935915  normal  0.211621 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1309  transposase IS3/IS911-family  54.12 
 
 		 92 aa  105  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_64  transposase IS3/IS911-family  54.12 
 
 		 92 aa  105  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1332  transposase IS3/IS911-family  54.12 
 
 		 92 aa  105  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_777  transposase IS3/IS911-family  54.12 
 
 		 92 aa  105  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_89  transposase IS3/IS911-family  54.12 
 
 		 92 aa  105  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5068  transposase IS3/IS911 family protein  51.69 
 
 		 92 aa  104  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.858829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7865  transposase IS3/IS911 family protein  52.81 
 
 		 126 aa  100  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1508  ISDet3, transposase orfA  50.59 
 
 		 92 aa  100  8e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.140272  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1300  transposase IS3/IS911 family protein  50.59 
 
 		 92 aa  100  8e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0116  transposase IS3/IS911 family protein  50.59 
 
 		 92 aa  100  8e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0288  transposase IS3/IS911 family protein  50.59 
 
 		 92 aa  100  8e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0272  transposase IS3/IS911 family protein  50.59 
 
 		 92 aa  100  8e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3816  transposase IS3/IS911 family protein  54.55 
 
 		 91 aa  100  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0345  transposase IS3/IS911 family protein  54.55 
 
 		 91 aa  100  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5379  transposase IS3/IS911 family protein  53.41 
 
 		 91 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.543472  normal  0.936634 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1083  transposase IS3/IS911 family protein  53.41 
 
 		 91 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1054  transposase IS3/IS911 family protein  53.41 
 
 		 91 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.298359  normal  0.762501 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3583  transposase IS3/IS911 family protein  50.56 
 
 		 92 aa  99  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3840  transposase IS3/IS911 family protein  55.95 
 
 		 91 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2016  transposase IS3/IS911 family protein  51.76 
 
 		 92 aa  97.8  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3556  hypothetical protein  48.86 
 
 		 99 aa  97.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1826  transposase IS3/IS911 family protein  48.86 
 
 		 99 aa  97.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4474  transposase IS3/IS911 family protein  48.31 
 
 		 93 aa  96.3  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0797  transposase IS3/IS911 family protein  47.73 
 
 		 106 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5098  transposase IS3/IS911 family protein  60 
 
 		 72 aa  95.5  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.451404 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1291  transposase IS3/IS911 family protein  52.44 
 
 		 83 aa  92.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22010  Transposase  46.07 
 
 		 111 aa  89.7  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.124801 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08100  Transposase  46.07 
 
 		 111 aa  89.7  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.721014 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17080  Transposase  46.07 
 
 		 111 aa  89.7  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0535  hypothetical protein  97.67 
 
 		 102 aa  84.3  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1443  transposase IS3/IS911  47.67 
 
 		 92 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1571  transposase IS3/IS911  47.67 
 
 		 92 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1694  transposase IS3/IS911  47.67 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.233674  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2056  transposase IS3/IS911  47.67 
 
 		 92 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0286844  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2011  transposase IS3/IS911  46.51 
 
 		 92 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1433  transposase IS3/IS911 family protein  48.24 
 
 		 88 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4237  transposase IS3/IS911 family protein  46.67 
 
 		 92 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219099  normal  0.376477 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0797  hypothetical protein  88.37 
 
 		 53 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0461181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1010  hypothetical protein  44.32 
 
 		 89 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2906  Fis family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 88 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000119814  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2015  transposase IS3/IS911 family protein  37.63 
 
 		 92 aa  76.6  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2756  transposase IS3/IS911 family protein  44.19 
 
 		 88 aa  76.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1438  isrso12-transposase orfa protein  45.78 
 
 		 88 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2707  isrso12-transposase orfa protein  45.78 
 
 		 88 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0503  isrso12-transposase orfa protein  45.78 
 
 		 88 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1299  isrso12-transposase orfa protein  45.78 
 
 		 88 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2942  transposase subfamily protein  40.86 
 
 		 88 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.342551  hitchhiker  1.76227e-24 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3081  transposase IS3/IS911 family protein  41.94 
 
 		 88 aa  75.1  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5607  transposase IS3/IS911 family protein  34.83 
 
 		 95 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1475  transposase IS3/IS911 family protein  34.83 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1720  transposase IS3/IS911 family protein  34.83 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.809119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1736  transposase IS3/IS911 family protein  34.83 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1752  transposase IS3/IS911 family protein  34.83 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.130264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1591  transposase IS3/IS911 family protein  34.83 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1665  transposase IS3/IS911 family protein  34.83 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1667  transposase IS3/IS911 family protein  34.83 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0248444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2263  transposase IS3/IS911 family protein  34.83 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4451  transposase IS3/IS911 family protein  34.83 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.396466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5363  transposase IS3/IS911 family protein  34.83 
 
 		 95 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.657542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4807  transposase subfamily  39.78 
 
 		 88 aa  73.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.650973  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3069  transposase family protein  39.78 
 
 		 88 aa  73.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1111  transposase IS3/IS911 family protein  44.19 
 
 		 88 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.207112 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5527  transposase IS3/IS911 family protein  44.19 
 
 		 88 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.100543 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0602  transposase IS3/IS911 family protein  41.57 
 
 		 93 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2285  transposase IS3/IS911 family protein  44.32 
 
 		 88 aa  73.9  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0445809  normal  0.0110111 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6172  transposase IS3/IS911 family protein  44.32 
 
 		 88 aa  73.9  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2278  transposase IS3/IS911 family protein  44.32 
 
 		 88 aa  73.9  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00023086  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0845  transposase IS3/IS911  33.71 
 
 		 111 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0862  transposase IS3/IS911 family protein  33.71 
 
 		 111 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0125  transposase IS3/IS911 family protein  44.32 
 
 		 88 aa  73.9  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2634  transposase IS3/IS911 family protein  40.48 
 
 		 88 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0442  transposase IS3/IS911 family protein  40.48 
 
 		 88 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6104  transposase IS3/IS911 family protein  40.48 
 
 		 88 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4740  transposase IS3/IS911 family protein  40.48 
 
 		 88 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5438  transposase IS3/IS911 family protein  41.57 
 
 		 93 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2927  transposase IS3/IS911 family protein  40.48 
 
 		 88 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3837  transposase IS3/IS911 family protein  44.32 
 
 		 88 aa  73.9  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4321  transposase IS3/IS911 family protein  40.66 
 
 		 88 aa  73.6  0.0000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.583527  normal  0.389304 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0557  ISRSO16-transposase OrfA protein  40.66 
 
 		 88 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.235174 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0578  transposase IS3/IS911 family protein  33.71 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1110  transposase IS3/IS911 family protein  33.71 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0093  transposase  43.21 
 
 		 88 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.426296 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0132  isrso12-transposase orfa protein  43.21 
 
 		 88 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.183288  normal  0.0817579 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3926  transposase IS3/IS911 family protein  43.21 
 
 		 88 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287084  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4904  transposase IS3/IS911 family protein  39.33 
 
 		 96 aa  72  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>