More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_89 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1332  transposase IS3/IS911-family  100 
 
 		 92 aa  188  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_89  transposase IS3/IS911-family  100 
 
 		 92 aa  188  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_777  transposase IS3/IS911-family  100 
 
 		 92 aa  188  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_64  transposase IS3/IS911-family  100 
 
 		 92 aa  188  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1309  transposase IS3/IS911-family  100 
 
 		 92 aa  188  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1508  ISDet3, transposase orfA  71.74 
 
 		 92 aa  140  6e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.140272  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0116  transposase IS3/IS911 family protein  71.74 
 
 		 92 aa  140  6e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0288  transposase IS3/IS911 family protein  71.74 
 
 		 92 aa  140  6e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0272  transposase IS3/IS911 family protein  71.74 
 
 		 92 aa  140  6e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1300  transposase IS3/IS911 family protein  71.74 
 
 		 92 aa  140  6e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3414  transposase IS3/IS911 family protein  74.7 
 
 		 91 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4909  transposase IS3/IS911 family protein  67.03 
 
 		 92 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2882  transposase IS3/IS911 family protein  65.17 
 
 		 92 aa  129  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.935915  normal  0.211621 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0143  IS3/IS911 family transposase  61.54 
 
 		 92 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0440  putative transposase  61.54 
 
 		 94 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.468029 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0209  IS3/IS911 family transposase  61.54 
 
 		 92 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.599747 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0204  IS3/IS911 family transposase  61.54 
 
 		 92 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1235  putative transposase  61.54 
 
 		 92 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0720605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5068  transposase IS3/IS911 family protein  62.64 
 
 		 92 aa  127  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.858829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3816  transposase IS3/IS911 family protein  57.14 
 
 		 91 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0345  transposase IS3/IS911 family protein  57.14 
 
 		 91 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1083  transposase IS3/IS911 family protein  56.04 
 
 		 91 aa  110  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1054  transposase IS3/IS911 family protein  56.04 
 
 		 91 aa  110  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.298359  normal  0.762501 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5379  transposase IS3/IS911 family protein  56.04 
 
 		 91 aa  110  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.543472  normal  0.936634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3840  transposase IS3/IS911 family protein  56.04 
 
 		 91 aa  110  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0797  transposase IS3/IS911 family protein  57.14 
 
 		 106 aa  110  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5098  transposase IS3/IS911 family protein  67.61 
 
 		 72 aa  110  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.451404 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4474  transposase IS3/IS911 family protein  57.3 
 
 		 93 aa  108  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1826  transposase IS3/IS911 family protein  56.04 
 
 		 99 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3556  hypothetical protein  56.04 
 
 		 99 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3339  transposase IS3/IS911 family protein  54.12 
 
 		 93 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0442  transposase IS3/IS911 family protein  55.29 
 
 		 93 aa  105  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.855822 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3530  transposase IS3/IS911 family protein  54.12 
 
 		 93 aa  105  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4337  transposase IS3/IS911 family protein  54.12 
 
 		 93 aa  104  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08100  Transposase  55.06 
 
 		 111 aa  103  5e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.721014 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22010  Transposase  55.06 
 
 		 111 aa  103  5e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.124801 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17080  Transposase  55.06 
 
 		 111 aa  103  5e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7865  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 126 aa  103  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1495  transposase IS3/IS911 family protein  52.94 
 
 		 93 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.824912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4813  transposase IS3/IS911 family protein  52.94 
 
 		 93 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2015  transposase IS3/IS911 family protein  51.65 
 
 		 92 aa  102  3e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1433  transposase IS3/IS911 family protein  54.02 
 
 		 88 aa  99  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2016  transposase IS3/IS911 family protein  50.55 
 
 		 92 aa  98.2  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4220  transposase IS3/IS911 family protein  51.76 
 
 		 93 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4740  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 		 88 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2634  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 		 88 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2927  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 		 88 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6104  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 		 88 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0442  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 		 88 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0959  transposase IS3/IS911 family protein  51.72 
 
 		 88 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2906  Fis family transcriptional regulator  52.87 
 
 		 88 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000119814  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3583  transposase IS3/IS911 family protein  49.45 
 
 		 92 aa  95.1  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1438  isrso12-transposase orfa protein  49.44 
 
 		 88 aa  93.6  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2707  isrso12-transposase orfa protein  49.44 
 
 		 88 aa  93.6  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0503  isrso12-transposase orfa protein  49.44 
 
 		 88 aa  93.6  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1299  isrso12-transposase orfa protein  49.44 
 
 		 88 aa  93.6  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1443  transposase IS3/IS911  47.73 
 
 		 92 aa  91.3  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1571  transposase IS3/IS911  47.73 
 
 		 92 aa  91.3  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1694  transposase IS3/IS911  47.73 
 
 		 133 aa  91.3  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.233674  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2056  transposase IS3/IS911  47.73 
 
 		 92 aa  91.3  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0286844  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0557  ISRSO16-transposase OrfA protein  50 
 
 		 88 aa  90.9  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.235174 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4237  transposase IS3/IS911 family protein  48.86 
 
 		 92 aa  90.1  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219099  normal  0.376477 
 
 
-
 
NC_002936  DET0165  ISDet2, transposase orfA  53.49 
 
 		 88 aa  89.7  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.265769  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2011  transposase IS3/IS911  46.59 
 
 		 92 aa  89.7  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5527  transposase IS3/IS911 family protein  51.72 
 
 		 88 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.100543 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1111  transposase IS3/IS911 family protein  51.72 
 
 		 88 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.207112 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4528  transposase IS3/IS911 family protein  53.49 
 
 		 88 aa  90.1  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4335  transposase IS3/IS911 family protein  53.49 
 
 		 88 aa  90.1  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0132  isrso12-transposase orfa protein  48.31 
 
 		 88 aa  89.4  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.183288  normal  0.0817579 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3837  transposase IS3/IS911 family protein  48.28 
 
 		 88 aa  89.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0093  transposase  48.31 
 
 		 88 aa  89.4  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.426296 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2285  transposase IS3/IS911 family protein  48.28 
 
 		 88 aa  89.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0445809  normal  0.0110111 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3926  transposase IS3/IS911 family protein  48.31 
 
 		 88 aa  89.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287084  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0125  transposase IS3/IS911 family protein  48.28 
 
 		 88 aa  89.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1291  transposase IS3/IS911 family protein  49.4 
 
 		 83 aa  89  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6172  transposase IS3/IS911 family protein  48.28 
 
 		 88 aa  89.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2278  transposase IS3/IS911 family protein  48.28 
 
 		 88 aa  89.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00023086  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0466  transposase IS3/IS911 family protein  53.49 
 
 		 88 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0845  transposase IS3/IS911  48.31 
 
 		 111 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0862  transposase IS3/IS911 family protein  48.31 
 
 		 111 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5607  transposase IS3/IS911 family protein  47.19 
 
 		 95 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4596  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 88 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5363  transposase IS3/IS911 family protein  47.19 
 
 		 95 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.657542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1475  transposase IS3/IS911 family protein  47.19 
 
 		 111 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1720  transposase IS3/IS911 family protein  47.19 
 
 		 111 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.809119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1736  transposase IS3/IS911 family protein  47.19 
 
 		 111 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1752  transposase IS3/IS911 family protein  47.19 
 
 		 111 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.130264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1591  transposase IS3/IS911 family protein  47.19 
 
 		 111 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1667  transposase IS3/IS911 family protein  47.19 
 
 		 111 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0248444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4451  transposase IS3/IS911 family protein  47.19 
 
 		 111 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.396466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2263  transposase IS3/IS911 family protein  47.19 
 
 		 111 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1665  transposase IS3/IS911 family protein  47.19 
 
 		 111 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7038  transposase IS3/IS911 family protein  53.49 
 
 		 88 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1184  transposase IS3/IS911  46.51 
 
 		 85 aa  86.3  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2044  transposase IS3/IS911  48.84 
 
 		 106 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777947  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7057  transposase IS3/IS911 family protein  52.33 
 
 		 88 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0066  transposase IS3/IS911 family protein  47.19 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2311  transposase IS3/IS911 family protein  51.16 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.882739 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2308  transposase IS3/IS911 family protein  51.16 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6139  transposase IS3/IS911 family protein  49.41 
 
 		 87 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.623502 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>