More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2044 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2044  transposase IS3/IS911  100 
 
 		 106 aa  213  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4596  transposase IS3/IS911 family protein  95.45 
 
 		 88 aa  168  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4335  transposase IS3/IS911 family protein  86.36 
 
 		 88 aa  158  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4528  transposase IS3/IS911 family protein  86.36 
 
 		 88 aa  158  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0466  transposase IS3/IS911 family protein  85.23 
 
 		 88 aa  156  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1065  transposase IS3/IS911 family protein  84.09 
 
 		 88 aa  155  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1609  transposase IS3/IS911 family protein  84.09 
 
 		 88 aa  155  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0629133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3471  transposase IS3/IS911 family protein  84.09 
 
 		 88 aa  155  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0959135  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0220  transposase IS3/IS911 family protein  84.09 
 
 		 88 aa  155  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7038  transposase IS3/IS911 family protein  84.09 
 
 		 88 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7057  transposase IS3/IS911 family protein  82.95 
 
 		 88 aa  152  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3735  transposase IS3/IS911 family protein  81.48 
 
 		 107 aa  140  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.247375 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0744  integrase catalytic subunit  75.58 
 
 		 393 aa  137  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4892  transposase IS3/IS911 family protein  70.45 
 
 		 88 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.050362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2510  transposase  69.32 
 
 		 88 aa  134  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.021123 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0403  insertion element ISR1 uncharacterized 10 kDa protein A3  69.32 
 
 		 88 aa  134  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.868889 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4090  transposase IS3/IS911 family protein  69.32 
 
 		 88 aa  134  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.702583  normal  0.16367 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3356  insertion element ISR1 uncharacterized 10 kDa protein A3  69.32 
 
 		 88 aa  134  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6507  transposase IS3/IS911 family protein  69.32 
 
 		 88 aa  134  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6241  transposase IS3/IS911 family protein  69.32 
 
 		 88 aa  134  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2861  transposase IS3/IS911 family protein  69.32 
 
 		 88 aa  134  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5715  transposase IS3/IS911 family protein  69.32 
 
 		 88 aa  134  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3395  transposase IS3/IS911 family protein  60.78 
 
 		 100 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4558  transposase IS3 family protein  67.05 
 
 		 88 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.289218 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0673  transposase IS3 family protein  67.05 
 
 		 88 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4982  transposase IS3 family protein  67.05 
 
 		 88 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6020  transposase IS3/IS911 family protein  69.32 
 
 		 88 aa  128  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.02017 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4608  transposase IS3/IS911 family protein  65.91 
 
 		 88 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546764  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7692  insertion element protein  64.77 
 
 		 152 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.382154  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1761  transposase IS3 family protein  59.34 
 
 		 372 aa  124  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0936  transposase IS3 family protein  59.34 
 
 		 372 aa  124  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.582923  normal  0.33404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0649  transposase IS3 family protein  59.34 
 
 		 372 aa  124  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2654  transposase IS3 family protein  59.34 
 
 		 372 aa  124  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683836  normal  0.423018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1768  transposase IS3 family protein  59.34 
 
 		 372 aa  124  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1258  transposase IS3 family protein  59.34 
 
 		 372 aa  124  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2559  transposase IS3/IS911  70.73 
 
 		 86 aa  124  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0007  transposase IS3/IS911 family protein  70.73 
 
 		 86 aa  124  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0898  transposase IS3 protein  59.34 
 
 		 372 aa  124  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1719  transposase IS3 family protein  59.34 
 
 		 372 aa  124  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.662695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2430  transposase IS3 family protein  59.34 
 
 		 372 aa  124  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.755967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1688  transposase IS3 family protein  59.34 
 
 		 372 aa  124  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0875  transposase IS3/IS911 family protein  61.36 
 
 		 88 aa  123  7e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.572302 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2507  transposase  61.36 
 
 		 88 aa  123  7e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0154773 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1914  putative insertion element / transposase  61.36 
 
 		 88 aa  123  7e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.863357  hitchhiker  0.0000000229131 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0463  transposase IS3/IS911 family protein  61.36 
 
 		 88 aa  123  7e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2103  putative transposase  61.36 
 
 		 88 aa  123  7e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0726746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1610  transposase IS3/IS911 family protein  63.95 
 
 		 97 aa  121  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1093  transposase IS3/IS911 family protein  63.86 
 
 		 84 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0026  transposase subfamily  63.86 
 
 		 87 aa  117  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.138106  normal  0.472585 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6139  transposase IS3/IS911 family protein  68.29 
 
 		 87 aa  117  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.623502 
 
 
-
 
NC_002936  DET0165  ISDet2, transposase orfA  61.36 
 
 		 88 aa  116  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.265769  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2579  transposase IS3/IS911 family protein  61.63 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0712611  unclonable  0.0000116597 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0375  transposase IS3/IS911 family protein  61.45 
 
 		 87 aa  114  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000436145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0641  transposase subfamily protein  68.35 
 
 		 87 aa  114  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4079  transposase IS3/IS911 family protein  60.24 
 
 		 87 aa  113  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0083  ISDet1, transposase orfA  61.36 
 
 		 88 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.376944  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0285  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0322  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.796566  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0720  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0609624  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0805  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0858  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0898  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.188476  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1204  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1231  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.336215  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1410  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0273301  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1842  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.987481  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1953  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.221799  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2086  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.270809  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2250  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2269  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2284  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.884453  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2596  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0551  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0588539  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0556  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0856086  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0812  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0846  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0870  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00673205  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0886  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.377434  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0891  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0917  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.251594  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0991  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1004  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1024  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0721664  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1055  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433151  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1174  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174757  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1226  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.488211  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1307  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.465429  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1377  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1411  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1504  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0530  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.694816  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0752  transposase subfamily protein  67.09 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0781  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1242  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1266  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.479831  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1630  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00252803  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1735  transposase subfamily protein  67.09 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1745  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205847  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1750  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0455865  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0017  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000967984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>