More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0875 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_2507  transposase  100 
 
 
88 aa  179  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0154773 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2103  putative transposase  100 
 
 
88 aa  179  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0726746  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0463  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
88 aa  179  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1914  putative insertion element / transposase  100 
 
 
88 aa  179  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.863357  hitchhiker  0.0000000229131 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0875  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
88 aa  179  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.572302 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1768  transposase IS3 family protein  74.42 
 
 
372 aa  140  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.383553  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1258  transposase IS3 family protein  74.42 
 
 
372 aa  140  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542288  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2654  transposase IS3 family protein  74.42 
 
 
372 aa  140  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683836  normal  0.423018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2430  transposase IS3 family protein  74.42 
 
 
372 aa  140  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.755967  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1719  transposase IS3 family protein  74.42 
 
 
372 aa  140  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.662695  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2967  transposase IS3/IS911  80 
 
 
95 aa  140  7e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.142788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1688  transposase IS3 family protein  74.42 
 
 
372 aa  140  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0936  transposase IS3 family protein  74.42 
 
 
372 aa  140  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.582923  normal  0.33404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1761  transposase IS3 family protein  74.42 
 
 
372 aa  140  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0898  transposase IS3 protein  74.42 
 
 
372 aa  140  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0649  transposase IS3 family protein  74.42 
 
 
372 aa  140  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0466  transposase IS3/IS911 family protein  65.91 
 
 
88 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4596  transposase IS3/IS911 family protein  64.77 
 
 
88 aa  130  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7057  transposase IS3/IS911 family protein  65.91 
 
 
88 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4608  transposase IS3/IS911 family protein  67.05 
 
 
88 aa  130  7.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546764  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7038  transposase IS3/IS911 family protein  65.91 
 
 
88 aa  129  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4528  transposase IS3/IS911 family protein  64.77 
 
 
88 aa  130  9e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4335  transposase IS3/IS911 family protein  64.77 
 
 
88 aa  130  9e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4892  transposase IS3/IS911 family protein  65.91 
 
 
88 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.050362  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5715  transposase IS3/IS911 family protein  65.91 
 
 
88 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6507  transposase IS3/IS911 family protein  65.91 
 
 
88 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6241  transposase IS3/IS911 family protein  65.91 
 
 
88 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328617  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2861  transposase IS3/IS911 family protein  65.91 
 
 
88 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2623  transposase IS3/IS911  93.75 
 
 
64 aa  127  6e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.866642  normal  0.218597 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3222  transposase IS3/IS911  93.75 
 
 
64 aa  127  6e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.170867  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3527  transposase IS3/IS911  93.75 
 
 
64 aa  127  6e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0117396 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3727  transposase IS3/IS911  93.75 
 
 
64 aa  127  6e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3471  transposase IS3/IS911 family protein  61.36 
 
 
88 aa  125  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0959135  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0220  transposase IS3/IS911 family protein  61.36 
 
 
88 aa  125  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4558  transposase IS3 family protein  63.64 
 
 
88 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.289218 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0673  transposase IS3 family protein  63.64 
 
 
88 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112042  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4982  transposase IS3 family protein  63.64 
 
 
88 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1065  transposase IS3/IS911 family protein  61.36 
 
 
88 aa  125  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1610  transposase IS3/IS911 family protein  67.82 
 
 
97 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111694  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1609  transposase IS3/IS911 family protein  61.36 
 
 
88 aa  125  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0629133  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3395  transposase IS3/IS911 family protein  63.64 
 
 
100 aa  125  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2044  transposase IS3/IS911  61.36 
 
 
106 aa  123  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777947  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2579  transposase IS3/IS911 family protein  63.22 
 
 
88 aa  122  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0712611  unclonable  0.0000116597 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1093  transposase IS3/IS911 family protein  67.47 
 
 
84 aa  121  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0403  insertion element ISR1 uncharacterized 10 kDa protein A3  61.36 
 
 
88 aa  120  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.868889 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3356  insertion element ISR1 uncharacterized 10 kDa protein A3  61.36 
 
 
88 aa  120  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2510  transposase  61.36 
 
 
88 aa  120  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.021123 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4090  transposase IS3/IS911 family protein  61.36 
 
 
88 aa  120  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.702583  normal  0.16367 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2759  transposase IS3/IS911 family protein  59.09 
 
 
88 aa  119  9e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2308  transposase IS3/IS911 family protein  62.5 
 
 
88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2311  transposase IS3/IS911 family protein  62.5 
 
 
88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.882739 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0829  ISRSO14-transposase ORFA protein  68.35 
 
 
87 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1493  ISRSO14-transposase ORFA protein  68.35 
 
 
87 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.504029  normal  0.961053 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2406  ISRSO14-transposase ORFA protein  68.35 
 
 
87 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1216  ISRSO14-transposase ORFA protein  68.35 
 
 
87 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2559  transposase IS3/IS911  64.29 
 
 
86 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0007  transposase IS3/IS911 family protein  64.29 
 
 
86 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0641  transposase subfamily protein  68.35 
 
 
87 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6139  transposase IS3/IS911 family protein  67.09 
 
 
87 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.623502 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4650  transposase IS3/IS911 family protein  65.88 
 
 
88 aa  117  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204613  normal  0.663628 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0744  integrase catalytic subunit  61.63 
 
 
393 aa  117  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2224  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 
87 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3352  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 
87 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2697  transposase  67.09 
 
 
87 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1596  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 
87 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0643  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 
87 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.909976  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2798  transposase subfamily protein  67.09 
 
 
87 aa  116  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0089  transposase subfamily protein  67.09 
 
 
87 aa  116  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0511092  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0182  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 
87 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.237707  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1552  transposase subfamily protein  67.09 
 
 
87 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3030  transposase  67.09 
 
 
87 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.339863  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1074  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 
87 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.721827  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0297  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 
87 aa  116  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000529534  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0313  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 
87 aa  116  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00217618  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0782  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 
87 aa  116  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1720  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 
87 aa  116  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0359558  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1167  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 
87 aa  116  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0160  transposase  67.09 
 
 
87 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2146  transposase subfamily protein  67.09 
 
 
87 aa  116  9e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0922  transposase subfamily protein  67.09 
 
 
87 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0437514  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0122  hypothetical protein  67.09 
 
 
87 aa  116  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2134  transposase subfamily protein  67.09 
 
 
87 aa  116  9e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.692115  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0027  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 
87 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1567  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 
87 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.996412  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2048  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 
87 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0705823  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1450  transposase subfamily protein  67.09 
 
 
87 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.23699  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1913  transposase subfamily protein  67.09 
 
 
87 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000126039  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1425  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 
87 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.565113  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0022  transposase  67.09 
 
 
87 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4720  transposase IS3/IS911 family protein  67.09 
 
 
87 aa  116  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3021  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 
87 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1750  transposase subfamily protein  67.09 
 
 
87 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.834954  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1648  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 
87 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.699645  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0551  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 
87 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0588539  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1226  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 
87 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.488211  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1307  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 
87 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.465429  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0166  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 
87 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00153904  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0124  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 
87 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00485388  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0194  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 
87 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.455443  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0290  IS407A, transposase OrfA  67.09 
 
 
87 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0146217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>