More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0744 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0744  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 393 aa  804    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2654  transposase IS3 family protein  60.83 
 
 		 372 aa  438  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683836  normal  0.423018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0936  transposase IS3 family protein  60.83 
 
 		 372 aa  438  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.582923  normal  0.33404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0649  transposase IS3 family protein  60.83 
 
 		 372 aa  438  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1768  transposase IS3 family protein  60.83 
 
 		 372 aa  438  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1761  transposase IS3 family protein  60.83 
 
 		 372 aa  438  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1258  transposase IS3 family protein  60.83 
 
 		 372 aa  438  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0898  transposase IS3 protein  60.83 
 
 		 372 aa  438  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2430  transposase IS3 family protein  60.83 
 
 		 372 aa  438  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.755967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1719  transposase IS3 family protein  60.83 
 
 		 372 aa  438  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.662695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1688  transposase IS3 family protein  60.83 
 
 		 372 aa  438  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4891  Integrase catalytic region  66.34 
 
 		 309 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0382576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2860  integrase catalytic region  66.34 
 
 		 309 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6506  integrase catalytic region  66.34 
 
 		 309 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4559  Integrase catalytic region  65.7 
 
 		 309 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.326011 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0674  Integrase catalytic region  65.7 
 
 		 309 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4981  Integrase catalytic region  65.7 
 
 		 309 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5714  integrase catalytic region  66.02 
 
 		 309 aa  391  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6240  integrase catalytic region  65.58 
 
 		 375 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4607  integrase catalytic region  65.37 
 
 		 309 aa  391  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5317  integrase catalytic region  66.03 
 
 		 306 aa  387  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0707814  normal  0.862383 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4597  Integrase catalytic region  61.36 
 
 		 307 aa  352  5e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4683  integrase catalytic region  58.53 
 
 		 309 aa  351  1e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4529  integrase catalytic region  58.53 
 
 		 309 aa  351  1e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4336  integrase catalytic region  58.53 
 
 		 309 aa  351  1e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.139423  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7691  integrase catalytic subunit  62.45 
 
 		 312 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1567  Integrase catalytic region  61.23 
 
 		 309 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4005  integrase catalytic region  59.71 
 
 		 284 aa  318  7e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.5936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1064  integrase catalytic region  61.66 
 
 		 290 aa  315  7e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0221  integrase catalytic region  61.66 
 
 		 290 aa  315  7e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0898 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4471  integrase catalytic region  71.18 
 
 		 235 aa  311  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154485  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3736  integrase catalytic region  57.59 
 
 		 290 aa  310  4e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.402881 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3472  integrase catalytic region  60.87 
 
 		 290 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0238059  normal  0.994317 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1608  integrase catalytic region  60.87 
 
 		 290 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0124752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4852  integrase catalytic region  59.06 
 
 		 260 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0318827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1392  transposase IS3/IS911 family protein  42.37 
 
 		 370 aa  302  8.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6345  transposase IS3/IS911 family protein  42.37 
 
 		 370 aa  302  8.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3491  transposase IS3/IS911 family protein  42.37 
 
 		 370 aa  302  8.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5979  transposase IS3/IS911 family protein  42.37 
 
 		 370 aa  302  8.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4211  transposase IS3/IS911 family protein  42.37 
 
 		 370 aa  302  8.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3517  transposase IS3/IS911 family protein  42.37 
 
 		 370 aa  302  8.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3513  transposase IS3/IS911 family protein  42.37 
 
 		 370 aa  302  8.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2508  integrase  59.45 
 
 		 273 aa  295  1e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0298999 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1913  putative insertion element  59.45 
 
 		 273 aa  295  1e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000339403 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0876  integrase catalytic region  59.45 
 
 		 273 aa  295  1e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.516654 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2104  putative integrase  59.45 
 
 		 273 aa  295  1e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.209867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0464  integrase catalytic region  59.45 
 
 		 273 aa  295  1e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0926  integrase catalytic region  56.92 
 
 		 269 aa  293  2e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2460  transposase IS3/IS911 family protein  57.58 
 
 		 298 aa  293  3e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3357  integrase catalytic region  56.54 
 
 		 269 aa  289  6e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0404  integrase catalytic region  56.15 
 
 		 269 aa  288  1e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.980653 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4089  integrase catalytic region  56.15 
 
 		 269 aa  288  1e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.805064  normal  0.114736 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3393  integrase catalytic subunit  57.87 
 
 		 274 aa  281  2e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2968  integrase catalytic subunit  54.84 
 
 		 264 aa  270  5e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166186 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2624  integrase protein  58.85 
 
 		 237 aa  266  4e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.947279  normal  0.151967 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3223  integrase protein  58.85 
 
 		 237 aa  266  4e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0342368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3526  integrase protein  58.85 
 
 		 237 aa  266  4e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130406 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3728  integrase protein  58.85 
 
 		 237 aa  266  4e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2509  integrase  57.58 
 
 		 231 aa  258  9e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0263754 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0381  integrase catalytic subunit  73.89 
 
 		 189 aa  256  5e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2711  transposase IS3/IS911 family protein  37.36 
 
 		 362 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155615  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2735  transposase IS3/IS911 family protein  37.36 
 
 		 362 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0657  transposase IS3/IS911 family protein  37.36 
 
 		 362 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0166  ISDet2, transposase orfB  49.2 
 
 		 274 aa  239  5e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.101481  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2543  Integrase catalytic region  47.45 
 
 		 280 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0607  integrase catalytic region  63.54 
 
 		 233 aa  238  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4005  Integrase catalytic region  48.54 
 
 		 281 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795108  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2309  Integrase catalytic region  46.24 
 
 		 282 aa  236  6e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2312  Integrase catalytic region  46.24 
 
 		 282 aa  235  9e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.939374 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1549  Integrase catalytic region  48.81 
 
 		 269 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4719  integrase catalytic region  48.85 
 
 		 277 aa  229  6e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.557613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0806  hypothetical protein  55.07 
 
 		 267 aa  229  8e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1243  IS407A, transposase OrfB  48.85 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1746  IS407A, transposase OrfB  48.85 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.149601  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0018  IS407A, transposase OrfB  48.85 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000189028  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0058  A, transposase OrfB  48.85 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.859906  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0960  IS407A, transposase OrfB  48.85 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.323661  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0984  IS407A, transposase OrfB  48.85 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.756102  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0999  IS407A, transposase OrfB  48.85 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1196  IS407A, transposase OrfB  48.85 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00667486  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1267  IS407A, transposase OrfB  48.85 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110583  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1323  IS407A, transposase OrfB  48.85 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1379  IS407A, transposase OrfB  48.85 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1427  IS407A, transposase OrfB  48.85 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2585  IS407A, transposase OrfB  48.85 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2640  A, transposase OrfB  48.85 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2665  IS407A, transposase OrfB  48.85 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0425442  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2683  IS407A, transposase OrfB  48.85 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2820  IS407A, transposase OrfB  48.85 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.670832  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2841  A, transposase OrfB  48.85 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000375956  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2852  IS407A, transposase OrfB  48.85 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2900  A, transposase OrfB  48.85 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3020  IS407A, transposase OrfB  48.85 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3069  IS407A, transposase OrfB  48.85 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3103  IS407A, transposase OrfB  48.85 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.309951  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3133  IS407A, transposase OrfB  48.85 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3193  IS407A, transposase OrfB  48.85 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00220403  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3265  IS407A, transposase OrfB  48.85 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3298  A, transposase OrfB  48.85 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2101  IS407A, transposase OrfB  48.85 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>