More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2882 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2882  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 92 aa  185  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.935915  normal  0.211621 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_89  transposase IS3/IS911-family  65.17 
 
 		 92 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_777  transposase IS3/IS911-family  65.17 
 
 		 92 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_64  transposase IS3/IS911-family  65.17 
 
 		 92 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1332  transposase IS3/IS911-family  65.17 
 
 		 92 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1309  transposase IS3/IS911-family  65.17 
 
 		 92 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3414  transposase IS3/IS911 family protein  68.24 
 
 		 91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4909  transposase IS3/IS911 family protein  61.96 
 
 		 92 aa  126  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5068  transposase IS3/IS911 family protein  60.87 
 
 		 92 aa  124  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.858829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3816  transposase IS3/IS911 family protein  66.29 
 
 		 91 aa  121  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0345  transposase IS3/IS911 family protein  66.29 
 
 		 91 aa  121  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1083  transposase IS3/IS911 family protein  65.17 
 
 		 91 aa  121  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1054  transposase IS3/IS911 family protein  65.17 
 
 		 91 aa  121  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.298359  normal  0.762501 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5379  transposase IS3/IS911 family protein  65.17 
 
 		 91 aa  121  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.543472  normal  0.936634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3840  transposase IS3/IS911 family protein  64.04 
 
 		 91 aa  118  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7865  transposase IS3/IS911 family protein  57.61 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0440  putative transposase  56.82 
 
 		 94 aa  114  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.468029 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0143  IS3/IS911 family transposase  56.82 
 
 		 92 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0204  IS3/IS911 family transposase  56.82 
 
 		 92 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1235  putative transposase  56.82 
 
 		 92 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0720605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0209  IS3/IS911 family transposase  56.82 
 
 		 92 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.599747 
 
 
-
 
NC_002936  DET1508  ISDet3, transposase orfA  56.18 
 
 		 92 aa  113  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.140272  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0116  transposase IS3/IS911 family protein  56.18 
 
 		 92 aa  113  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1300  transposase IS3/IS911 family protein  56.18 
 
 		 92 aa  113  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0288  transposase IS3/IS911 family protein  56.18 
 
 		 92 aa  113  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0272  transposase IS3/IS911 family protein  56.18 
 
 		 92 aa  113  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3556  hypothetical protein  54.95 
 
 		 99 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1826  transposase IS3/IS911 family protein  54.95 
 
 		 99 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3530  transposase IS3/IS911 family protein  60.49 
 
 		 93 aa  107  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0797  transposase IS3/IS911 family protein  52.75 
 
 		 106 aa  107  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5098  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 		 72 aa  106  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.451404 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3339  transposase IS3/IS911 family protein  55.29 
 
 		 93 aa  106  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0442  transposase IS3/IS911 family protein  56.47 
 
 		 93 aa  105  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.855822 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4337  transposase IS3/IS911 family protein  58.02 
 
 		 93 aa  104  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2016  transposase IS3/IS911 family protein  51.09 
 
 		 92 aa  103  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1495  transposase IS3/IS911 family protein  59.26 
 
 		 93 aa  103  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.824912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4813  transposase IS3/IS911 family protein  59.26 
 
 		 93 aa  103  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4474  transposase IS3/IS911 family protein  51.11 
 
 		 93 aa  103  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3583  transposase IS3/IS911 family protein  52.27 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4220  transposase IS3/IS911 family protein  59.26 
 
 		 93 aa  102  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1010  hypothetical protein  55.06 
 
 		 89 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17080  Transposase  50 
 
 		 111 aa  99  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22010  Transposase  50 
 
 		 111 aa  99  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.124801 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08100  Transposase  50 
 
 		 111 aa  99  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.721014 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1443  transposase IS3/IS911  50 
 
 		 92 aa  95.1  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1571  transposase IS3/IS911  50 
 
 		 92 aa  95.1  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1694  transposase IS3/IS911  52.22 
 
 		 133 aa  95.1  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.233674  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2056  transposase IS3/IS911  50 
 
 		 92 aa  95.1  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0286844  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5607  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 95 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5363  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 95 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.657542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1548  transposase IS3/IS911 family protein  52.17 
 
 		 88 aa  94  7e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1475  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 111 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1720  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 111 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.809119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1736  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 111 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1752  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 111 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.130264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4451  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 111 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.396466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1591  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 111 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1665  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 111 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1667  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 111 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0248444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2263  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 111 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2011  transposase IS3/IS911  48.86 
 
 		 92 aa  93.2  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0845  transposase IS3/IS911  48.89 
 
 		 111 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2015  transposase IS3/IS911 family protein  47.83 
 
 		 92 aa  93.2  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0862  transposase IS3/IS911 family protein  48.89 
 
 		 111 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1291  transposase IS3/IS911 family protein  49.4 
 
 		 83 aa  93.2  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2906  Fis family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 88 aa  90.5  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000119814  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4237  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 92 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219099  normal  0.376477 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0578  transposase IS3/IS911 family protein  47.78 
 
 		 111 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1110  transposase IS3/IS911 family protein  47.78 
 
 		 111 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6820  transposase IS3/IS911 family protein  53.25 
 
 		 79 aa  89  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4740  transposase IS3/IS911 family protein  47.19 
 
 		 88 aa  89  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1433  transposase IS3/IS911 family protein  48.84 
 
 		 88 aa  88.6  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0442  transposase IS3/IS911 family protein  47.19 
 
 		 88 aa  89  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2634  transposase IS3/IS911 family protein  47.19 
 
 		 88 aa  89  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2927  transposase IS3/IS911 family protein  47.19 
 
 		 88 aa  89  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6104  transposase IS3/IS911 family protein  47.19 
 
 		 88 aa  89  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0959  transposase IS3/IS911 family protein  47.19 
 
 		 88 aa  89  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5527  transposase IS3/IS911 family protein  51.16 
 
 		 88 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.100543 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1111  transposase IS3/IS911 family protein  51.16 
 
 		 88 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.207112 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3395  transposase IS3/IS911 family protein  46.74 
 
 		 100 aa  87.8  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0673  transposase IS3 family protein  51.16 
 
 		 88 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4558  transposase IS3 family protein  51.16 
 
 		 88 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.289218 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4982  transposase IS3 family protein  51.16 
 
 		 88 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1438  isrso12-transposase orfa protein  46.51 
 
 		 88 aa  86.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2707  isrso12-transposase orfa protein  46.51 
 
 		 88 aa  86.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0503  isrso12-transposase orfa protein  46.51 
 
 		 88 aa  86.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1299  isrso12-transposase orfa protein  46.51 
 
 		 88 aa  86.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4892  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 88 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.050362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0875  transposase IS3/IS911 family protein  48.84 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.572302 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0557  ISRSO16-transposase OrfA protein  46.51 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.235174 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2103  putative transposase  48.84 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0726746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1914  putative insertion element / transposase  48.84 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.863357  hitchhiker  0.0000000229131 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0463  transposase IS3/IS911 family protein  48.84 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3926  transposase IS3/IS911 family protein  44.57 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287084  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0132  isrso12-transposase orfa protein  44.57 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.183288  normal  0.0817579 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2507  transposase  48.84 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0154773 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0093  transposase  44.57 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.426296 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0527  transposase IS3/IS911 family protein  46.51 
 
 		 96 aa  85.1  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.781347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0881  transposase IS3/IS911 family protein  46.51 
 
 		 96 aa  85.1  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0140867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2313  transposase IS3/IS911 family protein  46.51 
 
 		 96 aa  85.1  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>