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for query gene DehaBAV1_0272 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1508  ISDet3, transposase orfA  100 
 
 
92 aa  187  5e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.140272  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0288  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
92 aa  187  5e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0116  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
92 aa  187  5e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1300  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
92 aa  187  5e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0272  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
92 aa  187  5e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1309  transposase IS3/IS911-family  71.74 
 
 
92 aa  140  6e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_89  transposase IS3/IS911-family  71.74 
 
 
92 aa  140  6e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1332  transposase IS3/IS911-family  71.74 
 
 
92 aa  140  6e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_64  transposase IS3/IS911-family  71.74 
 
 
92 aa  140  6e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_777  transposase IS3/IS911-family  71.74 
 
 
92 aa  140  6e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3414  transposase IS3/IS911 family protein  62.5 
 
 
91 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4909  transposase IS3/IS911 family protein  58.24 
 
 
92 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0345  transposase IS3/IS911 family protein  54.95 
 
 
91 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3816  transposase IS3/IS911 family protein  54.95 
 
 
91 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113749  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2882  transposase IS3/IS911 family protein  56.18 
 
 
92 aa  113  8.999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.935915  normal  0.211621 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5379  transposase IS3/IS911 family protein  53.85 
 
 
91 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.543472  normal  0.936634 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1083  transposase IS3/IS911 family protein  53.85 
 
 
91 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1054  transposase IS3/IS911 family protein  53.85 
 
 
91 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.298359  normal  0.762501 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3840  transposase IS3/IS911 family protein  53.85 
 
 
91 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5068  transposase IS3/IS911 family protein  56.04 
 
 
92 aa  111  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.858829  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7865  transposase IS3/IS911 family protein  52.27 
 
 
126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0204  IS3/IS911 family transposase  54.95 
 
 
92 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0440  putative transposase  54.95 
 
 
94 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.468029 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0209  IS3/IS911 family transposase  54.95 
 
 
92 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.599747 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0143  IS3/IS911 family transposase  54.95 
 
 
92 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1235  putative transposase  54.95 
 
 
92 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0720605  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1826  transposase IS3/IS911 family protein  53.85 
 
 
99 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3556  hypothetical protein  53.85 
 
 
99 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0797  transposase IS3/IS911 family protein  52.75 
 
 
106 aa  103  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4337  transposase IS3/IS911 family protein  52.94 
 
 
93 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2016  transposase IS3/IS911 family protein  50.55 
 
 
92 aa  102  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3339  transposase IS3/IS911 family protein  51.76 
 
 
93 aa  101  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2015  transposase IS3/IS911 family protein  52.75 
 
 
92 aa  101  3e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3583  transposase IS3/IS911 family protein  50.55 
 
 
92 aa  100  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3530  transposase IS3/IS911 family protein  50.59 
 
 
93 aa  100  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4474  transposase IS3/IS911 family protein  50.56 
 
 
93 aa  99.8  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0442  transposase IS3/IS911 family protein  50.59 
 
 
93 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.855822 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4813  transposase IS3/IS911 family protein  49.41 
 
 
93 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1495  transposase IS3/IS911 family protein  49.41 
 
 
93 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.824912  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17080  Transposase  49.44 
 
 
111 aa  95.5  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08100  Transposase  49.44 
 
 
111 aa  95.5  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.721014 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22010  Transposase  49.44 
 
 
111 aa  95.5  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.124801 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0845  transposase IS3/IS911  51.69 
 
 
111 aa  94  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0862  transposase IS3/IS911 family protein  51.69 
 
 
111 aa  94  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1010  hypothetical protein  46.15 
 
 
89 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5363  transposase IS3/IS911 family protein  50.56 
 
 
95 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.657542  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5607  transposase IS3/IS911 family protein  50.56 
 
 
95 aa  93.6  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337897  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1291  transposase IS3/IS911 family protein  50.6 
 
 
83 aa  93.6  9e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1475  transposase IS3/IS911 family protein  50.56 
 
 
111 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1720  transposase IS3/IS911 family protein  50.56 
 
 
111 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.809119  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1736  transposase IS3/IS911 family protein  50.56 
 
 
111 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908107  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1752  transposase IS3/IS911 family protein  50.56 
 
 
111 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.130264  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1665  transposase IS3/IS911 family protein  50.56 
 
 
111 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2263  transposase IS3/IS911 family protein  50.56 
 
 
111 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1667  transposase IS3/IS911 family protein  50.56 
 
 
111 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0248444  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1591  transposase IS3/IS911 family protein  50.56 
 
 
111 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4451  transposase IS3/IS911 family protein  50.56 
 
 
111 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.396466  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4220  transposase IS3/IS911 family protein  48.24 
 
 
93 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0578  transposase IS3/IS911 family protein  48.31 
 
 
111 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1110  transposase IS3/IS911 family protein  48.31 
 
 
111 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564169  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5098  transposase IS3/IS911 family protein  56.34 
 
 
72 aa  90.9  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.451404 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1443  transposase IS3/IS911  46.59 
 
 
92 aa  87  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1571  transposase IS3/IS911  46.59 
 
 
92 aa  87  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1694  transposase IS3/IS911  46.59 
 
 
133 aa  87  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.233674  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2056  transposase IS3/IS911  46.59 
 
 
92 aa  87  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0286844  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7038  transposase IS3/IS911 family protein  51.16 
 
 
88 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1433  transposase IS3/IS911 family protein  48.28 
 
 
88 aa  85.1  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2011  transposase IS3/IS911  45.45 
 
 
92 aa  84.7  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2044  transposase IS3/IS911  48.84 
 
 
106 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777947  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4237  transposase IS3/IS911 family protein  46.59 
 
 
92 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219099  normal  0.376477 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2634  transposase IS3/IS911 family protein  45.98 
 
 
88 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492474  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0442  transposase IS3/IS911 family protein  45.98 
 
 
88 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317076  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6104  transposase IS3/IS911 family protein  45.98 
 
 
88 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4740  transposase IS3/IS911 family protein  45.98 
 
 
88 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0959  transposase IS3/IS911 family protein  45.98 
 
 
88 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2927  transposase IS3/IS911 family protein  45.98 
 
 
88 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6820  transposase IS3/IS911 family protein  46.75 
 
 
79 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2906  Fis family transcriptional regulator  47.13 
 
 
88 aa  82  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000119814  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4596  transposase IS3/IS911 family protein  48.84 
 
 
88 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0165  ISDet2, transposase orfA  51.16 
 
 
88 aa  81.6  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.265769  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4528  transposase IS3/IS911 family protein  48.84 
 
 
88 aa  81.3  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0466  transposase IS3/IS911 family protein  48.84 
 
 
88 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4335  transposase IS3/IS911 family protein  48.84 
 
 
88 aa  81.3  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0896  transposase IS3/IS911 family protein  47.73 
 
 
96 aa  80.9  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.665473  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5438  transposase IS3/IS911 family protein  47.73 
 
 
93 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189176  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4892  transposase IS3/IS911 family protein  48.84 
 
 
88 aa  80.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.050362  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5527  transposase IS3/IS911 family protein  47.67 
 
 
88 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.100543 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0026  transposase subfamily  50.59 
 
 
87 aa  79.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.138106  normal  0.472585 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1111  transposase IS3/IS911 family protein  47.67 
 
 
88 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.207112 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4710  transposase IS3/IS911 family protein  46.59 
 
 
96 aa  79.3  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4904  transposase IS3/IS911 family protein  46.59 
 
 
96 aa  80.1  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2311  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.882739 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0036  transposase IS3/IS911 family protein  45.35 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2308  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7057  transposase IS3/IS911 family protein  47.67 
 
 
88 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5715  transposase IS3/IS911 family protein  46.51 
 
 
88 aa  78.2  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6241  transposase IS3/IS911 family protein  46.51 
 
 
88 aa  78.2  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328617  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2861  transposase IS3/IS911 family protein  46.51 
 
 
88 aa  78.2  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009622  Smed_6507  transposase IS3/IS911 family protein  46.51 
 
 
88 aa  78.2  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_006348  BMA2224  IS407A, transposase OrfA  45.45 
 
 
87 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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