More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4220 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4220  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 93 aa  183  6e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3530  transposase IS3/IS911 family protein  95.7 
 
 		 93 aa  173  7e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4813  transposase IS3/IS911 family protein  93.55 
 
 		 93 aa  169  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1495  transposase IS3/IS911 family protein  93.55 
 
 		 93 aa  169  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.824912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4337  transposase IS3/IS911 family protein  91.4 
 
 		 93 aa  168  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3339  transposase IS3/IS911 family protein  87.1 
 
 		 93 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0442  transposase IS3/IS911 family protein  82.8 
 
 		 93 aa  157  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.855822 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0440  putative transposase  68.54 
 
 		 94 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.468029 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0204  IS3/IS911 family transposase  68.54 
 
 		 92 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0143  IS3/IS911 family transposase  68.54 
 
 		 92 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0209  IS3/IS911 family transposase  68.54 
 
 		 92 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.599747 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1235  putative transposase  68.54 
 
 		 92 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0720605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3414  transposase IS3/IS911 family protein  55.91 
 
 		 91 aa  104  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4909  transposase IS3/IS911 family protein  53.93 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2882  transposase IS3/IS911 family protein  59.26 
 
 		 92 aa  102  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.935915  normal  0.211621 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_777  transposase IS3/IS911-family  51.76 
 
 		 92 aa  97.8  4e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_89  transposase IS3/IS911-family  51.76 
 
 		 92 aa  97.8  4e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1332  transposase IS3/IS911-family  51.76 
 
 		 92 aa  97.8  4e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_64  transposase IS3/IS911-family  51.76 
 
 		 92 aa  97.8  4e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1309  transposase IS3/IS911-family  51.76 
 
 		 92 aa  97.8  4e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5068  transposase IS3/IS911 family protein  49.44 
 
 		 92 aa  96.7  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.858829  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1508  ISDet3, transposase orfA  48.24 
 
 		 92 aa  92.4  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.140272  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0288  transposase IS3/IS911 family protein  48.24 
 
 		 92 aa  92.4  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1300  transposase IS3/IS911 family protein  48.24 
 
 		 92 aa  92.4  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0272  transposase IS3/IS911 family protein  48.24 
 
 		 92 aa  92.4  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0116  transposase IS3/IS911 family protein  48.24 
 
 		 92 aa  92.4  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7865  transposase IS3/IS911 family protein  49.44 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0345  transposase IS3/IS911 family protein  51.14 
 
 		 91 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3816  transposase IS3/IS911 family protein  51.14 
 
 		 91 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1054  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 91 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.298359  normal  0.762501 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1083  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 91 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5379  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 91 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.543472  normal  0.936634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3840  transposase IS3/IS911 family protein  52.38 
 
 		 91 aa  90.1  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3583  transposase IS3/IS911 family protein  47.19 
 
 		 92 aa  89.7  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2016  transposase IS3/IS911 family protein  46.07 
 
 		 92 aa  89  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5098  transposase IS3/IS911 family protein  57.14 
 
 		 72 aa  88.2  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.451404 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3556  hypothetical protein  44.32 
 
 		 99 aa  87.4  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1826  transposase IS3/IS911 family protein  44.32 
 
 		 99 aa  87.4  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4474  transposase IS3/IS911 family protein  43.82 
 
 		 93 aa  86.7  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0797  transposase IS3/IS911 family protein  43.18 
 
 		 106 aa  86.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1291  transposase IS3/IS911 family protein  51.28 
 
 		 83 aa  85.1  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1010  hypothetical protein  45.45 
 
 		 89 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0535  hypothetical protein  95.24 
 
 		 102 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22010  Transposase  41.57 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.124801 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08100  Transposase  41.57 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.721014 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17080  Transposase  41.57 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1443  transposase IS3/IS911  46.51 
 
 		 92 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1571  transposase IS3/IS911  46.51 
 
 		 92 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2056  transposase IS3/IS911  46.51 
 
 		 92 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0286844  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1694  transposase IS3/IS911  46.51 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.233674  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0797  hypothetical protein  84.44 
 
 		 53 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0461181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2011  transposase IS3/IS911  45.35 
 
 		 92 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1433  transposase IS3/IS911 family protein  45.88 
 
 		 88 aa  73.9  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2015  transposase IS3/IS911 family protein  37.63 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2906  Fis family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 88 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000119814  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4237  transposase IS3/IS911 family protein  43.33 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219099  normal  0.376477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6820  transposase IS3/IS911 family protein  44.16 
 
 		 79 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2942  transposase subfamily protein  38.71 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.342551  hitchhiker  1.76227e-24 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1438  isrso12-transposase orfa protein  44.58 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5363  transposase IS3/IS911 family protein  34.83 
 
 		 95 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.657542  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2707  isrso12-transposase orfa protein  44.58 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0503  isrso12-transposase orfa protein  44.58 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1299  isrso12-transposase orfa protein  44.58 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3081  transposase IS3/IS911 family protein  39.78 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0845  transposase IS3/IS911  33.71 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2756  transposase IS3/IS911 family protein  43.02 
 
 		 88 aa  69.3  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5607  transposase IS3/IS911 family protein  34.83 
 
 		 95 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0862  transposase IS3/IS911 family protein  33.71 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1475  transposase IS3/IS911 family protein  34.83 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1720  transposase IS3/IS911 family protein  34.83 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.809119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1736  transposase IS3/IS911 family protein  34.83 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1752  transposase IS3/IS911 family protein  34.83 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.130264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1591  transposase IS3/IS911 family protein  34.83 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1665  transposase IS3/IS911 family protein  34.83 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1667  transposase IS3/IS911 family protein  34.83 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0248444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2263  transposase IS3/IS911 family protein  34.83 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4451  transposase IS3/IS911 family protein  34.83 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.396466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4740  transposase IS3/IS911 family protein  40.48 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0442  transposase IS3/IS911 family protein  40.48 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4807  transposase subfamily  37.63 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.650973  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2927  transposase IS3/IS911 family protein  40.48 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0578  transposase IS3/IS911 family protein  33.71 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1110  transposase IS3/IS911 family protein  33.71 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3069  transposase family protein  37.63 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6104  transposase IS3/IS911 family protein  40.48 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2634  transposase IS3/IS911 family protein  40.48 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4321  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.583527  normal  0.389304 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5527  transposase IS3/IS911 family protein  43.02 
 
 		 88 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.100543 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1111  transposase IS3/IS911 family protein  43.02 
 
 		 88 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.207112 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4865  transposase IS3/IS911  45.45 
 
 		 87 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3300  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 87 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4892  transposase family protein  38.64 
 
 		 92 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0142849 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5438  transposase IS3/IS911 family protein  38.2 
 
 		 93 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189176  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0557  ISRSO16-transposase OrfA protein  39.56 
 
 		 88 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.235174 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0602  transposase IS3/IS911 family protein  38.2 
 
 		 93 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1163  transposase IS3/IS911  41.11 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.966557  normal  0.412061 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0125  transposase IS3/IS911 family protein  40.86 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0132  isrso12-transposase orfa protein  41.98 
 
 		 88 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.183288  normal  0.0817579 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0093  transposase  41.98 
 
 		 88 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.426296 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3926  transposase IS3/IS911 family protein  41.98 
 
 		 88 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>