More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp0503 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1438  isrso12-transposase orfa protein  100 
 
 		 88 aa  177  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2707  isrso12-transposase orfa protein  100 
 
 		 88 aa  177  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0503  isrso12-transposase orfa protein  100 
 
 		 88 aa  177  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1299  isrso12-transposase orfa protein  100 
 
 		 88 aa  177  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0557  ISRSO16-transposase OrfA protein  81.82 
 
 		 88 aa  148  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.235174 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2906  Fis family transcriptional regulator  80.68 
 
 		 88 aa  148  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000119814  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3926  transposase IS3/IS911 family protein  78.41 
 
 		 88 aa  147  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287084  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0093  transposase  78.41 
 
 		 88 aa  147  5e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.426296 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0132  isrso12-transposase orfa protein  78.41 
 
 		 88 aa  147  5e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.183288  normal  0.0817579 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1433  transposase IS3/IS911 family protein  79.55 
 
 		 88 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3837  transposase IS3/IS911 family protein  78.41 
 
 		 88 aa  143  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0125  transposase IS3/IS911 family protein  78.41 
 
 		 88 aa  143  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2278  transposase IS3/IS911 family protein  78.41 
 
 		 88 aa  143  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00023086  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6172  transposase IS3/IS911 family protein  78.41 
 
 		 88 aa  143  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2285  transposase IS3/IS911 family protein  78.41 
 
 		 88 aa  143  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0445809  normal  0.0110111 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0066  transposase IS3/IS911 family protein  77.27 
 
 		 88 aa  143  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0643  putative transposase  69.32 
 
 		 99 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.6553  normal  0.737994 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1111  transposase IS3/IS911 family protein  73.86 
 
 		 88 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.207112 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5527  transposase IS3/IS911 family protein  73.86 
 
 		 88 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.100543 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2634  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 		 88 aa  131  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6104  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 		 88 aa  131  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2927  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 		 88 aa  131  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4740  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 		 88 aa  131  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0442  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 		 88 aa  131  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0720  transposase subfamily  69.32 
 
 		 88 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.116485 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0959  transposase IS3/IS911 family protein  63.22 
 
 		 88 aa  128  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1548  transposase IS3/IS911 family protein  65.91 
 
 		 88 aa  127  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1495  transposase IS3/IS911 family protein  71.59 
 
 		 88 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2756  transposase IS3/IS911 family protein  65.91 
 
 		 88 aa  126  8.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1184  transposase IS3/IS911  64.29 
 
 		 85 aa  122  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3127  transposase IS3/IS911  64.77 
 
 		 88 aa  122  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.800536  normal  0.701441 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3534  transposase IS3/IS911  64.77 
 
 		 88 aa  122  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.545436  normal  0.522486 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2969  transposase IS3/IS911  64.77 
 
 		 88 aa  122  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0895571 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04442  isrso16-transposase orfa protein  67.82 
 
 		 88 aa  122  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3246  transposase IS3/IS911  63.64 
 
 		 88 aa  118  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00639582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7752  putative insertion element ISR1-like protein  60.23 
 
 		 88 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.619622  normal  0.112312 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5979  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 		 370 aa  110  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3513  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 		 370 aa  110  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4211  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 		 370 aa  110  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3517  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 		 370 aa  110  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3491  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 		 370 aa  110  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6345  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 		 370 aa  110  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1392  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 		 370 aa  110  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4006  transposase IS3/IS911 family protein  58.62 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3395  transposase IS3/IS911 family protein  56.98 
 
 		 100 aa  105  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0744  integrase catalytic subunit  61.63 
 
 		 393 aa  104  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1114  ISRSO16-transposase OrfA protein  60.98 
 
 		 103 aa  103  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2730  isrso12-transposase orfa  60.98 
 
 		 103 aa  103  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1137  transposase IS3/IS911 family protein  52.27 
 
 		 88 aa  103  7e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.000000141669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0527  transposase IS3/IS911 family protein  51.72 
 
 		 96 aa  103  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.781347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3122  transposase IS3/IS911 family protein  51.72 
 
 		 96 aa  103  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.956375  normal  0.520056 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0881  transposase IS3/IS911 family protein  51.72 
 
 		 96 aa  103  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0140867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2313  transposase IS3/IS911 family protein  51.72 
 
 		 96 aa  103  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2601  transposase IS3/IS911 family protein  54.55 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0275  transposase IS3/IS911 family protein  53.41 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2542  transposase IS3/IS911 family protein  57.47 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2228  transposase IS3/IS911 family protein  53.41 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2355  transposase IS3/IS911 family protein  53.41 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0431  transposase IS3/IS911 family protein  53.41 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1443  transposase IS3/IS911  54.02 
 
 		 92 aa  101  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1571  transposase IS3/IS911  54.02 
 
 		 92 aa  101  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2056  transposase IS3/IS911  54.02 
 
 		 92 aa  101  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0286844  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1235  transposase IS3/IS911 family protein  53.41 
 
 		 88 aa  101  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1288  transposase IS3/IS911 family protein  53.41 
 
 		 88 aa  101  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2193  transposase IS3/IS911 family protein  53.41 
 
 		 88 aa  101  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1263  transposase IS3/IS911 family protein  53.41 
 
 		 88 aa  100  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0943  transposase IS3/IS911 family protein  53.41 
 
 		 88 aa  100  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4596  transposase IS3/IS911 family protein  54.02 
 
 		 88 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1694  transposase IS3/IS911  54.02 
 
 		 133 aa  100  8e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.233674  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0199  hypothetical protein  52.27 
 
 		 88 aa  99.4  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1078  hypothetical protein  52.27 
 
 		 88 aa  99.4  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2579  transposase IS3/IS911 family protein  56.98 
 
 		 88 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0712611  unclonable  0.0000116597 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3471  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 		 88 aa  99.8  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0959135  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1065  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 		 88 aa  99.8  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6020  transposase IS3/IS911 family protein  54.02 
 
 		 88 aa  99.8  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.02017 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0220  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 		 88 aa  99.8  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1609  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 		 88 aa  99.8  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0629133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4608  transposase IS3/IS911 family protein  56.32 
 
 		 88 aa  99.8  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546764  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1719  transposase IS3 family protein  53.41 
 
 		 372 aa  99  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.662695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4982  transposase IS3 family protein  55.17 
 
 		 88 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1688  transposase IS3 family protein  53.41 
 
 		 372 aa  99  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4558  transposase IS3 family protein  55.17 
 
 		 88 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.289218 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1258  transposase IS3 family protein  53.41 
 
 		 372 aa  99  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02903  transposase ORF-A, IS-type  51.72 
 
 		 87 aa  98.6  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1768  transposase IS3 family protein  53.41 
 
 		 372 aa  99  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0673  transposase IS3 family protein  55.17 
 
 		 88 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2011  transposase IS3/IS911  52.87 
 
 		 92 aa  99  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0936  transposase IS3 family protein  53.41 
 
 		 372 aa  99  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.582923  normal  0.33404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1761  transposase IS3 family protein  53.41 
 
 		 372 aa  99  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0649  transposase IS3 family protein  53.41 
 
 		 372 aa  99  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0898  transposase IS3 protein  53.41 
 
 		 372 aa  99  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2430  transposase IS3 family protein  53.41 
 
 		 372 aa  99  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.755967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5715  transposase IS3/IS911 family protein  56.32 
 
 		 88 aa  99  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6507  transposase IS3/IS911 family protein  56.32 
 
 		 88 aa  99  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4335  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 		 88 aa  99  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2861  transposase IS3/IS911 family protein  56.32 
 
 		 88 aa  99  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6241  transposase IS3/IS911 family protein  56.32 
 
 		 88 aa  99  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2654  transposase IS3 family protein  53.41 
 
 		 372 aa  99  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683836  normal  0.423018 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4528  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 		 88 aa  99  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0036  transposase IS3/IS911 family protein  54.55 
 
 		 88 aa  98.2  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>