More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1291 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1291  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 83 aa  166  8e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2016  transposase IS3/IS911 family protein  97.59 
 
 		 92 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3583  transposase IS3/IS911 family protein  97.59 
 
 		 92 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3816  transposase IS3/IS911 family protein  69.88 
 
 		 91 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0345  transposase IS3/IS911 family protein  69.88 
 
 		 91 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5379  transposase IS3/IS911 family protein  69.88 
 
 		 91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.543472  normal  0.936634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3840  transposase IS3/IS911 family protein  69.88 
 
 		 91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1083  transposase IS3/IS911 family protein  69.88 
 
 		 91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1054  transposase IS3/IS911 family protein  69.88 
 
 		 91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.298359  normal  0.762501 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3556  hypothetical protein  69.88 
 
 		 99 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1826  transposase IS3/IS911 family protein  69.88 
 
 		 99 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7865  transposase IS3/IS911 family protein  65.06 
 
 		 126 aa  124  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0797  transposase IS3/IS911 family protein  67.47 
 
 		 106 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1010  hypothetical protein  63.86 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4909  transposase IS3/IS911 family protein  62.65 
 
 		 92 aa  113  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5068  transposase IS3/IS911 family protein  63.86 
 
 		 92 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.858829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3414  transposase IS3/IS911 family protein  58.75 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0442  transposase IS3/IS911 family protein  56.1 
 
 		 93 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.855822 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3515  hypothetical protein  68.85 
 
 		 71 aa  94.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6820  transposase IS3/IS911 family protein  58.11 
 
 		 79 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1508  ISDet3, transposase orfA  50.6 
 
 		 92 aa  93.6  9e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.140272  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0116  transposase IS3/IS911 family protein  50.6 
 
 		 92 aa  93.6  9e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0288  transposase IS3/IS911 family protein  50.6 
 
 		 92 aa  93.6  9e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1300  transposase IS3/IS911 family protein  50.6 
 
 		 92 aa  93.6  9e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0272  transposase IS3/IS911 family protein  50.6 
 
 		 92 aa  93.6  9e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2882  transposase IS3/IS911 family protein  49.4 
 
 		 92 aa  93.2  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.935915  normal  0.211621 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3530  transposase IS3/IS911 family protein  52.44 
 
 		 93 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4337  transposase IS3/IS911 family protein  52.44 
 
 		 93 aa  92  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3339  transposase IS3/IS911 family protein  52.63 
 
 		 93 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1332  transposase IS3/IS911-family  49.4 
 
 		 92 aa  89  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_64  transposase IS3/IS911-family  49.4 
 
 		 92 aa  89  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1309  transposase IS3/IS911-family  49.4 
 
 		 92 aa  89  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_89  transposase IS3/IS911-family  49.4 
 
 		 92 aa  89  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_777  transposase IS3/IS911-family  49.4 
 
 		 92 aa  89  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4813  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 93 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1495  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 93 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.824912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5098  transposase IS3/IS911 family protein  65.08 
 
 		 72 aa  87.4  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.451404 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1168  transposase and inactivated derivative  61.9 
 
 		 76 aa  87.4  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4220  transposase IS3/IS911 family protein  51.28 
 
 		 93 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4474  transposase IS3/IS911 family protein  48.72 
 
 		 93 aa  84.3  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0209  IS3/IS911 family transposase  45.78 
 
 		 92 aa  82.8  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.599747 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0440  putative transposase  45.78 
 
 		 94 aa  83.2  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.468029 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0204  IS3/IS911 family transposase  45.78 
 
 		 92 aa  82.8  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1235  putative transposase  45.78 
 
 		 92 aa  82.8  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0720605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0143  IS3/IS911 family transposase  45.78 
 
 		 92 aa  82.8  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22010  Transposase  44.87 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.124801 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08100  Transposase  44.87 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.721014 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17080  Transposase  44.87 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2015  transposase IS3/IS911 family protein  43.75 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0845  transposase IS3/IS911  42.67 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0862  transposase IS3/IS911 family protein  42.67 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4237  transposase IS3/IS911 family protein  42.17 
 
 		 92 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219099  normal  0.376477 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5607  transposase IS3/IS911 family protein  41.33 
 
 		 95 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1475  transposase IS3/IS911 family protein  41.33 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1720  transposase IS3/IS911 family protein  41.33 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.809119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1736  transposase IS3/IS911 family protein  41.33 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1752  transposase IS3/IS911 family protein  41.33 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.130264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5363  transposase IS3/IS911 family protein  41.33 
 
 		 95 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.657542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1591  transposase IS3/IS911 family protein  41.33 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1665  transposase IS3/IS911 family protein  41.33 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1667  transposase IS3/IS911 family protein  41.33 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0248444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2263  transposase IS3/IS911 family protein  41.33 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4451  transposase IS3/IS911 family protein  41.33 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.396466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0578  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 		 111 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1110  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 		 111 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1213  hypothetical protein  48.39 
 
 		 85 aa  71.6  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0796796  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1694  transposase IS3/IS911  40 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.233674  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1443  transposase IS3/IS911  40 
 
 		 92 aa  70.5  0.000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1571  transposase IS3/IS911  40 
 
 		 92 aa  70.5  0.000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2056  transposase IS3/IS911  40 
 
 		 92 aa  70.5  0.000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0286844  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2011  transposase IS3/IS911  38.67 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1137  transposase IS3/IS911 family protein  42.25 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.000000141669 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2542  transposase IS3/IS911 family protein  41.89 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4006  transposase IS3/IS911 family protein  41.89 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4321  transposase IS3/IS911 family protein  38.03 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.583527  normal  0.389304 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4904  transposase IS3/IS911 family protein  41.25 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4710  transposase IS3/IS911 family protein  41.25 
 
 		 96 aa  63.5  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0896  transposase IS3/IS911 family protein  41.25 
 
 		 96 aa  63.5  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.665473  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2355  transposase IS3/IS911 family protein  41.07 
 
 		 88 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1111  transposase IS3/IS911 family protein  38.67 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.207112 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0431  transposase IS3/IS911 family protein  41.07 
 
 		 88 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2756  transposase IS3/IS911 family protein  45.61 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0275  transposase IS3/IS911 family protein  41.07 
 
 		 88 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2228  transposase IS3/IS911 family protein  41.07 
 
 		 88 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5527  transposase IS3/IS911 family protein  38.67 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.100543 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1945  transposase IS3/IS911 family protein  36.36 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0881  transposase IS3/IS911 family protein  42.65 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0140867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0527  transposase IS3/IS911 family protein  42.65 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.781347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0379  transposase IS3/IS911 family protein  36.62 
 
 		 77 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.563054  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2942  transposase subfamily protein  36.62 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.342551  hitchhiker  1.76227e-24 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0602  transposase IS3/IS911 family protein  41.25 
 
 		 93 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1433  transposase IS3/IS911 family protein  39.19 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3122  transposase IS3/IS911 family protein  42.65 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.956375  normal  0.520056 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2313  transposase IS3/IS911 family protein  42.65 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0036  transposase IS3/IS911 family protein  38.03 
 
 		 88 aa  62  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1438  isrso12-transposase orfa protein  36.84 
 
 		 88 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2707  isrso12-transposase orfa protein  36.84 
 
 		 88 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0503  isrso12-transposase orfa protein  36.84 
 
 		 88 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1299  isrso12-transposase orfa protein  36.84 
 
 		 88 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0199  hypothetical protein  39.19 
 
 		 88 aa  62  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>