124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1168 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1168  transposase and inactivated derivative  100 
 
 		 76 aa  157  5e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1826  transposase IS3/IS911 family protein  84.62 
 
 		 99 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3556  hypothetical protein  84.62 
 
 		 99 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0797  transposase IS3/IS911 family protein  84.62 
 
 		 106 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3515  hypothetical protein  93.1 
 
 		 71 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0345  transposase IS3/IS911 family protein  69.84 
 
 		 91 aa  100  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3816  transposase IS3/IS911 family protein  69.84 
 
 		 91 aa  100  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1054  transposase IS3/IS911 family protein  69.84 
 
 		 91 aa  100  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.298359  normal  0.762501 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1083  transposase IS3/IS911 family protein  69.84 
 
 		 91 aa  100  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5379  transposase IS3/IS911 family protein  69.84 
 
 		 91 aa  100  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.543472  normal  0.936634 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7865  transposase IS3/IS911 family protein  68.57 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3840  transposase IS3/IS911 family protein  69.84 
 
 		 91 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1010  hypothetical protein  65.08 
 
 		 89 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2016  transposase IS3/IS911 family protein  63.49 
 
 		 92 aa  89  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3583  transposase IS3/IS911 family protein  63.49 
 
 		 92 aa  89  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1291  transposase IS3/IS911 family protein  61.9 
 
 		 83 aa  87.4  7e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4909  transposase IS3/IS911 family protein  56.92 
 
 		 92 aa  86.3  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5068  transposase IS3/IS911 family protein  56.92 
 
 		 92 aa  85.1  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.858829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3414  transposase IS3/IS911 family protein  49.3 
 
 		 91 aa  79.3  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1309  transposase IS3/IS911-family  50 
 
 		 92 aa  78.6  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_89  transposase IS3/IS911-family  50 
 
 		 92 aa  78.6  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_777  transposase IS3/IS911-family  50 
 
 		 92 aa  78.6  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_64  transposase IS3/IS911-family  50 
 
 		 92 aa  78.6  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1332  transposase IS3/IS911-family  50 
 
 		 92 aa  78.6  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6820  transposase IS3/IS911 family protein  60 
 
 		 79 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0143  IS3/IS911 family transposase  45.95 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0204  IS3/IS911 family transposase  45.95 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0209  IS3/IS911 family transposase  45.95 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.599747 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0440  putative transposase  45.95 
 
 		 94 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.468029 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1235  putative transposase  45.95 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0720605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4474  transposase IS3/IS911 family protein  44.29 
 
 		 93 aa  71.2  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2882  transposase IS3/IS911 family protein  41.89 
 
 		 92 aa  70.5  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.935915  normal  0.211621 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08100  Transposase  44.29 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.721014 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22010  Transposase  44.29 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.124801 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17080  Transposase  44.29 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1508  ISDet3, transposase orfA  39.19 
 
 		 92 aa  67.8  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.140272  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0116  transposase IS3/IS911 family protein  39.19 
 
 		 92 aa  67.8  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0272  transposase IS3/IS911 family protein  39.19 
 
 		 92 aa  67.8  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0288  transposase IS3/IS911 family protein  39.19 
 
 		 92 aa  67.8  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1300  transposase IS3/IS911 family protein  39.19 
 
 		 92 aa  67.8  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1213  hypothetical protein  49.15 
 
 		 85 aa  65.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0796796  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2015  transposase IS3/IS911 family protein  36.49 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4337  transposase IS3/IS911 family protein  39.44 
 
 		 93 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3530  transposase IS3/IS911 family protein  38.03 
 
 		 93 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0442  transposase IS3/IS911 family protein  40.3 
 
 		 93 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.855822 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4904  transposase IS3/IS911 family protein  36.62 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3339  transposase IS3/IS911 family protein  35.21 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4710  transposase IS3/IS911 family protein  36.62 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0896  transposase IS3/IS911 family protein  36.11 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.665473  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1495  transposase IS3/IS911 family protein  35.21 
 
 		 93 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.824912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4813  transposase IS3/IS911 family protein  35.21 
 
 		 93 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4237  transposase IS3/IS911 family protein  33.78 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219099  normal  0.376477 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4220  transposase IS3/IS911 family protein  35.21 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5098  transposase IS3/IS911 family protein  53.33 
 
 		 72 aa  53.9  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.451404 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1443  transposase IS3/IS911  31.08 
 
 		 92 aa  52.8  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1571  transposase IS3/IS911  31.08 
 
 		 92 aa  52.8  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2011  transposase IS3/IS911  31.08 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2056  transposase IS3/IS911  31.08 
 
 		 92 aa  52.8  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0286844  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0602  transposase IS3/IS911 family protein  34.72 
 
 		 93 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1694  transposase IS3/IS911  32.84 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.233674  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0845  transposase IS3/IS911  33.33 
 
 		 111 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0862  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 111 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5607  transposase IS3/IS911 family protein  32.73 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1475  transposase IS3/IS911 family protein  32.73 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1720  transposase IS3/IS911 family protein  32.73 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.809119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1736  transposase IS3/IS911 family protein  32.73 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1752  transposase IS3/IS911 family protein  32.73 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.130264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1591  transposase IS3/IS911 family protein  32.73 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1665  transposase IS3/IS911 family protein  32.73 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1667  transposase IS3/IS911 family protein  32.73 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0248444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2263  transposase IS3/IS911 family protein  32.73 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4451  transposase IS3/IS911 family protein  32.73 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.396466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5363  transposase IS3/IS911 family protein  32.73 
 
 		 95 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.657542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0442  transposase IS3/IS911 family protein  33.78 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2634  transposase IS3/IS911 family protein  33.78 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2927  transposase IS3/IS911 family protein  33.78 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4740  transposase IS3/IS911 family protein  33.78 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6104  transposase IS3/IS911 family protein  33.78 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0578  transposase IS3/IS911 family protein  30.91 
 
 		 111 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1110  transposase IS3/IS911 family protein  30.91 
 
 		 111 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5438  transposase IS3/IS911 family protein  33.8 
 
 		 93 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0959  transposase IS3/IS911 family protein  31.08 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2542  transposase IS3/IS911 family protein  35.9 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2986  hypothetical protein  42.55 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309048  normal  0.153656 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1184  transposase IS3/IS911  33.33 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1438  isrso12-transposase orfa protein  32.43 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2707  isrso12-transposase orfa protein  32.43 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0503  isrso12-transposase orfa protein  32.43 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1299  isrso12-transposase orfa protein  32.43 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1433  transposase IS3/IS911 family protein  40.38 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02903  transposase ORF-A, IS-type  27.4 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3081  transposase IS3/IS911 family protein  28.57 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2300  transposase IS3/IS911 family protein  28.57 
 
 		 94 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.356728  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0453  transposase IS3/IS911  31.25 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1137  transposase IS3/IS911 family protein  30.14 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.000000141669 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1457  transposase IS3/IS911 family protein  31.75 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4856  transposase IS3/IS911 family protein  26.67 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.164746 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4006  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1163  transposase IS3/IS911  34.25 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.966557  normal  0.412061 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1972  hypothetical protein  30.16 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.806101 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>