75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2986 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2986  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  241  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309048  normal  0.153656 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0531  hypothetical protein  48.11 
 
 		 131 aa  97.1  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0922777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1047  hypothetical protein  49.06 
 
 		 154 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1636  hypothetical protein  44.66 
 
 		 112 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.52512  normal  0.903403 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2016  transposase IS3/IS911 family protein  38.68 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0797  transposase IS3/IS911 family protein  35.24 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3583  transposase IS3/IS911 family protein  39.22 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0345  transposase IS3/IS911 family protein  34.86 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3816  transposase IS3/IS911 family protein  34.86 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3556  hypothetical protein  36.19 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1826  transposase IS3/IS911 family protein  36.19 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1054  transposase IS3/IS911 family protein  33.94 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.298359  normal  0.762501 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1083  transposase IS3/IS911 family protein  33.94 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5379  transposase IS3/IS911 family protein  33.94 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.543472  normal  0.936634 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0602  transposase IS3/IS911 family protein  37.74 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7865  transposase IS3/IS911 family protein  34.29 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1291  transposase IS3/IS911 family protein  37.76 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3840  transposase IS3/IS911 family protein  33.03 
 
 		 91 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4904  transposase IS3/IS911 family protein  35.85 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0896  transposase IS3/IS911 family protein  35.85 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.665473  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4710  transposase IS3/IS911 family protein  35.85 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4909  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 92 aa  51.6  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5438  transposase IS3/IS911 family protein  35.14 
 
 		 93 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4474  transposase IS3/IS911 family protein  35.29 
 
 		 93 aa  51.2  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08100  Transposase  32.35 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.721014 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6820  transposase IS3/IS911 family protein  32.65 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17080  Transposase  32.35 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22010  Transposase  32.35 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.124801 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0959  transposase IS3/IS911 family protein  32.41 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4740  transposase IS3/IS911 family protein  31.48 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0442  transposase IS3/IS911 family protein  31.48 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2927  transposase IS3/IS911 family protein  31.48 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2634  transposase IS3/IS911 family protein  31.48 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_89  transposase IS3/IS911-family  31.48 
 
 		 92 aa  47  0.00009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6104  transposase IS3/IS911 family protein  31.48 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1309  transposase IS3/IS911-family  31.48 
 
 		 92 aa  47  0.00009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1332  transposase IS3/IS911-family  31.48 
 
 		 92 aa  47  0.00009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_64  transposase IS3/IS911-family  31.48 
 
 		 92 aa  47  0.00009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_777  transposase IS3/IS911-family  31.48 
 
 		 92 aa  47  0.00009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1438  isrso12-transposase orfa protein  30.19 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2707  isrso12-transposase orfa protein  30.19 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0503  isrso12-transposase orfa protein  30.19 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1299  isrso12-transposase orfa protein  30.19 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3515  hypothetical protein  43.18 
 
 		 71 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1168  transposase and inactivated derivative  42.55 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3414  transposase IS3/IS911 family protein  29.63 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5068  transposase IS3/IS911 family protein  29.36 
 
 		 92 aa  42  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.858829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2882  transposase IS3/IS911 family protein  30.39 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.935915  normal  0.211621 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2015  transposase IS3/IS911 family protein  26.53 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0845  transposase IS3/IS911  31.37 
 
 		 111 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0862  transposase IS3/IS911 family protein  31.37 
 
 		 111 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0132  isrso12-transposase orfa protein  27.36 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.183288  normal  0.0817579 
 
 
-
 
NC_002936  DET1508  ISDet3, transposase orfA  30.56 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.140272  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2906  Fis family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000119814  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0093  transposase  27.36 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.426296 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3926  transposase IS3/IS911 family protein  27.36 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287084  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1300  transposase IS3/IS911 family protein  30.56 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0288  transposase IS3/IS911 family protein  30.56 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0272  transposase IS3/IS911 family protein  30.56 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0116  transposase IS3/IS911 family protein  30.56 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4337  transposase IS3/IS911 family protein  32.65 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1475  transposase IS3/IS911 family protein  29.17 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3530  transposase IS3/IS911 family protein  32.65 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4451  transposase IS3/IS911 family protein  29.17 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.396466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1667  transposase IS3/IS911 family protein  29.17 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0248444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1720  transposase IS3/IS911 family protein  29.17 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.809119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2263  transposase IS3/IS911 family protein  29.17 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1736  transposase IS3/IS911 family protein  29.17 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1752  transposase IS3/IS911 family protein  29.17 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.130264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1591  transposase IS3/IS911 family protein  29.17 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1665  transposase IS3/IS911 family protein  29.17 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5607  transposase IS3/IS911 family protein  29.17 
 
 		 95 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5363  transposase IS3/IS911 family protein  29.17 
 
 		 95 aa  40.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.657542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0578  transposase IS3/IS911 family protein  29.41 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1110  transposase IS3/IS911 family protein  29.41 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564169  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>