57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0531 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0531  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  265  2e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0922777  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1047  hypothetical protein  82.44 
 
 
154 aa  214  4e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2986  hypothetical protein  44.33 
 
 
121 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309048  normal  0.153656 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1636  hypothetical protein  44.04 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.52512  normal  0.903403 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3556  hypothetical protein  37.17 
 
 
99 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1826  transposase IS3/IS911 family protein  37.17 
 
 
99 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0797  transposase IS3/IS911 family protein  37.17 
 
 
106 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5379  transposase IS3/IS911 family protein  34.91 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.543472  normal  0.936634 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1083  transposase IS3/IS911 family protein  34.91 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3816  transposase IS3/IS911 family protein  35.85 
 
 
91 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113749  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0345  transposase IS3/IS911 family protein  35.85 
 
 
91 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1054  transposase IS3/IS911 family protein  34.91 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.298359  normal  0.762501 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7865  transposase IS3/IS911 family protein  36.79 
 
 
126 aa  57.8  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3840  transposase IS3/IS911 family protein  34.91 
 
 
91 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5438  transposase IS3/IS911 family protein  37.74 
 
 
93 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189176  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0896  transposase IS3/IS911 family protein  36.79 
 
 
96 aa  52.8  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.665473  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4710  transposase IS3/IS911 family protein  36.79 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4904  transposase IS3/IS911 family protein  36.79 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2882  transposase IS3/IS911 family protein  32.67 
 
 
92 aa  52  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.935915  normal  0.211621 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4909  transposase IS3/IS911 family protein  33.96 
 
 
92 aa  51.6  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3583  transposase IS3/IS911 family protein  34.58 
 
 
92 aa  51.2  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0602  transposase IS3/IS911 family protein  35.85 
 
 
93 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6820  transposase IS3/IS911 family protein  36.56 
 
 
79 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2016  transposase IS3/IS911 family protein  33.96 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3414  transposase IS3/IS911 family protein  32.08 
 
 
91 aa  48.9  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4474  transposase IS3/IS911 family protein  32.08 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08100  Transposase  30.19 
 
 
111 aa  46.2  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.721014 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17080  Transposase  30.19 
 
 
111 aa  46.2  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22010  Transposase  30.19 
 
 
111 aa  46.2  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.124801 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5068  transposase IS3/IS911 family protein  31.13 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.858829  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1010  hypothetical protein  31.13 
 
 
89 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1291  transposase IS3/IS911 family protein  32.67 
 
 
83 aa  45.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3515  hypothetical protein  43.18 
 
 
71 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1545  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1309  transposase IS3/IS911-family  29.09 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1332  transposase IS3/IS911-family  29.09 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_64  transposase IS3/IS911-family  29.09 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_777  transposase IS3/IS911-family  29.09 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_89  transposase IS3/IS911-family  29.09 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5974  putative transposase  30.53 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.6597  normal  0.546785 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0116  transposase IS3/IS911 family protein  32.08 
 
 
92 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1508  ISDet3, transposase orfA  32.08 
 
 
92 aa  42  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.140272  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0272  transposase IS3/IS911 family protein  32.08 
 
 
92 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0288  transposase IS3/IS911 family protein  32.08 
 
 
92 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2015  transposase IS3/IS911 family protein  32.65 
 
 
92 aa  42  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1300  transposase IS3/IS911 family protein  32.08 
 
 
92 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2969  transposase IS3/IS911  33.72 
 
 
88 aa  41.2  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0895571 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3534  transposase IS3/IS911  33.72 
 
 
88 aa  41.2  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.545436  normal  0.522486 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3127  transposase IS3/IS911  33.72 
 
 
88 aa  41.2  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.800536  normal  0.701441 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4237  transposase IS3/IS911 family protein  28.83 
 
 
92 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219099  normal  0.376477 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5098  transposase IS3/IS911 family protein  29.41 
 
 
72 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.451404 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0720  transposase subfamily  29.81 
 
 
88 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.116485 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2056  transposase IS3/IS911  28.83 
 
 
92 aa  40.8  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0286844  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1571  transposase IS3/IS911  28.83 
 
 
92 aa  40.8  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1443  transposase IS3/IS911  28.83 
 
 
92 aa  40.8  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1168  transposase and inactivated derivative  43.18 
 
 
76 aa  40.4  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1694  transposase IS3/IS911  28.83 
 
 
133 aa  40.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.233674  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4730  putative SyrB-like regulator  33.33 
 
 
144 aa  40  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>