More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1010 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1010  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5379  transposase IS3/IS911 family protein  81.32 
 
 		 91 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.543472  normal  0.936634 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1083  transposase IS3/IS911 family protein  81.32 
 
 		 91 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7865  transposase IS3/IS911 family protein  81.32 
 
 		 126 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1054  transposase IS3/IS911 family protein  81.32 
 
 		 91 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.298359  normal  0.762501 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3816  transposase IS3/IS911 family protein  80.22 
 
 		 91 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0345  transposase IS3/IS911 family protein  80.22 
 
 		 91 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3840  transposase IS3/IS911 family protein  81.32 
 
 		 91 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3556  hypothetical protein  68.89 
 
 		 99 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1826  transposase IS3/IS911 family protein  68.89 
 
 		 99 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2016  transposase IS3/IS911 family protein  64.84 
 
 		 92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0797  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 		 106 aa  124  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3583  transposase IS3/IS911 family protein  64.84 
 
 		 92 aa  124  6e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1291  transposase IS3/IS911 family protein  63.86 
 
 		 83 aa  114  6e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4909  transposase IS3/IS911 family protein  58.24 
 
 		 92 aa  113  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6820  transposase IS3/IS911 family protein  74.03 
 
 		 79 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5068  transposase IS3/IS911 family protein  56.04 
 
 		 92 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.858829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3414  transposase IS3/IS911 family protein  57.95 
 
 		 91 aa  105  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2882  transposase IS3/IS911 family protein  55.06 
 
 		 92 aa  99.4  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.935915  normal  0.211621 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3515  hypothetical protein  73.77 
 
 		 71 aa  98.6  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1545  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1508  ISDet3, transposase orfA  46.15 
 
 		 92 aa  93.6  8e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.140272  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0116  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 		 92 aa  93.6  8e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1300  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 		 92 aa  93.6  8e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0288  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 		 92 aa  93.6  8e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0272  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 		 92 aa  93.6  8e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1168  transposase and inactivated derivative  65.08 
 
 		 76 aa  90.9  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5098  transposase IS3/IS911 family protein  60.56 
 
 		 72 aa  87.8  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.451404 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_89  transposase IS3/IS911-family  42.86 
 
 		 92 aa  84.7  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1332  transposase IS3/IS911-family  42.86 
 
 		 92 aa  84.7  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_64  transposase IS3/IS911-family  42.86 
 
 		 92 aa  84.7  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_777  transposase IS3/IS911-family  42.86 
 
 		 92 aa  84.7  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1309  transposase IS3/IS911-family  42.86 
 
 		 92 aa  84.7  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4474  transposase IS3/IS911 family protein  46.74 
 
 		 93 aa  84.3  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4220  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 93 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4337  transposase IS3/IS911 family protein  44.32 
 
 		 93 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3530  transposase IS3/IS911 family protein  44.32 
 
 		 93 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2015  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 		 92 aa  77.8  0.00000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0442  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 93 aa  76.6  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.855822 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1235  putative transposase  39.56 
 
 		 92 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0720605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0440  putative transposase  39.56 
 
 		 94 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.468029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3339  transposase IS3/IS911 family protein  42.53 
 
 		 93 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0143  IS3/IS911 family transposase  39.56 
 
 		 92 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0204  IS3/IS911 family transposase  39.56 
 
 		 92 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0209  IS3/IS911 family transposase  39.56 
 
 		 92 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.599747 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17080  Transposase  42.05 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22010  Transposase  42.05 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.124801 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08100  Transposase  42.05 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.721014 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1495  transposase IS3/IS911 family protein  42.53 
 
 		 93 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.824912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4813  transposase IS3/IS911 family protein  42.53 
 
 		 93 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1694  transposase IS3/IS911  42.05 
 
 		 133 aa  72  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.233674  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1443  transposase IS3/IS911  42.05 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1571  transposase IS3/IS911  42.05 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2056  transposase IS3/IS911  42.05 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0286844  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2011  transposase IS3/IS911  40.91 
 
 		 92 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0845  transposase IS3/IS911  38.64 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0862  transposase IS3/IS911 family protein  38.64 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4451  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.396466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2263  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1667  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0248444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1665  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5607  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 		 95 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1475  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1720  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.809119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1736  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1752  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.130264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1591  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5363  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 		 95 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.657542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4237  transposase IS3/IS911 family protein  38.64 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219099  normal  0.376477 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0578  transposase IS3/IS911 family protein  35.23 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1110  transposase IS3/IS911 family protein  35.23 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1213  hypothetical protein  46.55 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0796796  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1184  transposase IS3/IS911  38.37 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1163  transposase IS3/IS911  37.5 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.966557  normal  0.412061 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1433  transposase IS3/IS911 family protein  34.88 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1438  isrso12-transposase orfa protein  33.71 
 
 		 88 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2707  isrso12-transposase orfa protein  33.71 
 
 		 88 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0503  isrso12-transposase orfa protein  33.71 
 
 		 88 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1299  isrso12-transposase orfa protein  33.71 
 
 		 88 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0896  transposase IS3/IS911 family protein  33.71 
 
 		 96 aa  57  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.665473  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2633  IS3/IS911 family transposase A  39.51 
 
 		 87 aa  57  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000594495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4520  IS3/IS911 family transposase A  39.51 
 
 		 87 aa  57  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000777217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2542  transposase IS3/IS911 family protein  36.25 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4006  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6104  transposase IS3/IS911 family protein  34.83 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4740  transposase IS3/IS911 family protein  34.83 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0720  transposase subfamily  31.46 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.116485 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4904  transposase IS3/IS911 family protein  32.58 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0442  transposase IS3/IS911 family protein  34.83 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2927  transposase IS3/IS911 family protein  34.83 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2634  transposase IS3/IS911 family protein  34.83 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4710  transposase IS3/IS911 family protein  32.58 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1111  transposase IS3/IS911 family protein  33.72 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.207112 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5527  transposase IS3/IS911 family protein  33.72 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.100543 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0557  ISRSO16-transposase OrfA protein  31.4 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.235174 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0602  transposase IS3/IS911 family protein  32.58 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2906  Fis family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000119814  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5438  transposase IS3/IS911 family protein  32.58 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1137  transposase IS3/IS911 family protein  40.28 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.000000141669 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0093  transposase  31.46 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.426296 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0132  isrso12-transposase orfa protein  31.46 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.183288  normal  0.0817579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>